Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ADCY5_0007000

Sequence Length

1279 nt

GC Content

0.5387

GACUACAAAUCCUAGUCCAGAGGAAAGUCUCGAAGCUGCGUUCCUAACUCUUCUGAACCAGUUCCUCUCCUGGGCCAGACAUUUUGGCAAGGAUCUUCUGAGGAGAUUUGCUGUUUUAGUCAUAUCCUCUUCUCCAGAGUGGCCGAUCUGAGCCCUCACUGCUGUCCUCUCUGUAGCUCCCAGUCCUGUGUCUCCACCAAGCCCUCAUGUUUUUGCAGAUAAACUUCCUGCCUCAUUGAGGACGUCAUAAGCCUUCCCUCUCCAUCUCAGCCGACGUCCUGCACCUCCUGGCUUCUCAGAGCAGCCCAGUUCCUUCUCCUGCCCAAGGCAUUCCCUCCUUUGACCUGGCCUCCAUUCUUUCCUUCUGGCCACCUUCCUCCCUCCUUCCUUCCAUGACUCCUGGCCUCCCGCCCCGCCUCCUUCCCCAGGUCCCUCCUGUAGAGGCUAACUAGGGACACAGGUCCCCAGUAUAGAAACACCUCCUUCACUCCCUGGCGUGCCUCCAUCUCUCACGUCUCUCUCCUCCAACUCCCCACUGGCCCUCUUGACAGGAUAGUUCUCAGCGUAUGUGCCUCCCCAAUCUCACAGAGGACCCUCAUGGUGAAAGCAGCCCUUGCCGCUCAUAUUGGGGGCCCCUGGCUGCCACAUGAUGGGUCUCCUUCACCUGGCACUGCUUGCUCUGGCCCCACUCCCAUUCUUGUCUUUCUUUGGCUGUUCCCACUCUGUCUGUUGUUUUGGCCUCCUCUUUUCUUUUCCUCCUCAAGCAUUUGUUUUUCCCAGGGCUCCAUCUUGGGCUCUUUUCUUCCAGCUCAUUUUGUCCAUCUCUGUGAUUUUGUUAACCCUCCCCAUAUCUGUCCCUCUGGCCCAGCCUCUCCGGAGAUGCACCUGCACAUUUCCAGCUGCCUGUUAGUUAUUGCUCCCUGGGGUACCUUAAACCCAUCAUGUGUACCCCUCACUCAUCCACCCCACUGUCCUCACGGAGACCGGCUCCUCCACUGCCUCUCUUCUCUGUCUUAUUUCCUGUCAUUCUCCCUGUUGCCUGCUUAGAAACUGAAGUCAUCCUUGACAACUCCCUCUCCUCGCCUCCCACUUUCAGUUGGUCAUACAGUGCUGAUGGGUUUGGCUCUGAAACGUCCCCUCCAUUCCUCCAACCUCCGCGGCCCCUCCCAACCUGCCCUGGUUAGACCUUCAUCAUCUCUCAUCUGGACCAUUGCGCAGCCUUUUACUUAGCUCUGGGCCACCUUCCAUACAGCUGUAAUGCGACAUUUCCAAAAUUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-303.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -324.83

Frequency: 0.0000

Diversity: 292.51

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((.......)))))(.(((((.(((.....(((((.((((...........)))))))))......((((((((((((...(((..(((.......((((((((.(((((...))).)).)).))))))((((((((((.(((..(((((.......((((..(((((((.((...((((....((((.......((((......))))..((((.........)))).......((((((((..........................))))))))))))...))))...))))))).))..))))..........((((((((....((((.........(((((................)))))..............................(((.....)))..(((((......((((.....))))..)))))..(((.(((((....))))).)))...(((........))).......((((((...........)))))).....................((((....((((((.((((....(((((((.(((((.............((.(((((((((((.((...((((((...(((.((((...)))))))....))))))))))))).)))))).))......))))))))......(((........)))................))))........))))))))))....)))).....................((((....)))).....)))).....))))))))............)))))..))).))).))))).))..........)))..)))....))))....)))))))).......(((((((........)))))))(((((.....)))))..........((((((((.............).)))))))...............))).)))))(((((((..(((.........))).....)))))))...............(((....((.....))..)))(((((((((((....))))........................)))))))(((((..(((.((.(.((((...((((.((...........................)).))))...)))).)..)).)))..).))))................((((....((((((.....((((..((((.((((......))))...)))))))))))).))..)))).......)

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((((.......)))))(.((((({(((,..{,{((((.((((...........))))))))),.....((((((((((((...(((..(((.......((((({{{.{((((...})).}}.})}}))}}}{(((((((((.(((..(((((.......((((,.{{{((((.((...((((.,,,((((,,,.....{{,..,,,,|,....((((,......,.))))......,((((((((....,.....................)))))))),))}...}}}}...}}}}))),))..}})}.........,(((,{{||,,...........|...(((((................))))).......................},.....(((.....)))..(((({......((((.....))))..)))))..,{{.|||||,,,,)})}}.})}..,({,........,,,.......((((((...........))))))....................,||{{,,..,||{|||||||....,{({{,,.({(((....,,,....,,{({(((((((((({,((...((((((...(((.(((,...,))})))....))))))))))))).))))),.,.......|||}},||.}}}}.,((........|||.....,.........|}||}.....,|.}}}},,))})....)))).....................|||{....)}},.....||||{.,...,,})))),...........)))))..))).))).))))).))..........)))..)))....))},..,})))))))).,,,...{|||{(({....|,,||}|}}}{(({{,..,..{{{....}},....((((((((.............).)))))))...............,||,|,,,,{((((((..(((.........))).....))))))}..........,.,,..,,....{,.....},..}}}|{{{{{{((((....))))..............,.........}}}))}}({{{,..|||.|{.|,||||...(({{.,{,.....................,,...,|.||}}...}}}}.,,.)).}}),,).))}}................{|||....,|{||||....,,{{..{{{{.{|{|......})))...)))))}))))})}),}}))),....,,.)