Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_AF001548.5_0000800

Sequence Length

1497 nt

GC Content

0.5324

GAGAAUUGCCUGAACCCAGGAGGCGGGGGUUGCAGUGAGCCGAGAUCCCGCCAGUGCACUCCAGCCUGGGCGACAGAGUGAGACUUUGUCUCAAAAAAAAAAGCGUGUUGGGCAAAAGUAGGACGCGGUGAGGGGCUUCUUUCCAGGUUGUAGAGAAGGGGAAAGAGAAGCGCAAGUAUCCCGAGAGGACGAGACCCACCACUCAGUCUUCCCAUAGUCCCUGGGAGGUGCUGGACGUUGACCGGUCAGCCCUGGAUGCCCGUCCUCCCUCCAAGACAUGACUAAGAGCUGCCAGACCUCAGAUGGGGACAGGGAGUCUCUUGGUGGUAACAAAGCAGUGAAGCGGGGACCCUAGGGGACAUGGGCUCCCAGAAACCUUAGCCCAGCCUAAGACCCCAGAACUGGGGCCAAACCGCACGAGGGCCUGGGGAGCCCAGGUAGGAGCUGAUGUUAAACGUUUCCCCCACAAGCAGAUGGAACCAGGUCUCUACAUCAGAAUUCAAGUUGUUAGAGGCAAAGGCCUCUGUUUCCCUGCACCUGAGAUGGGCAGAGGUUUGCACCUCUACCUGCUUUGUGCGGGUCAGUAAUGGACAUGCCGUCUGCUGGUGGUCUUAAUAACUGCGUCUUCCCAAAGAGGCCUGGCUGGGAAUGGGCUUGGCUUCUAGCUCCUGUUCACGUCUAAUGAACCCCAAGCAUGGGGAGGGUCAGUGAUUCUGUCUGGGGCCUCACUCUUCCAACCAUAAUUUUUUUUUUUUUUUUUUGAAACUGAGUCUCACUCUGUUGCCCAGGCUGGGGUGCAGUGGCACAAUCUUGGCUCACUGCAACCUUUACCUCCUGGGUUCAAGUGAUUUUCAUGUCUCAGCCUCCCAAGUAGCUGGGAUUACAGGCGACCGCCACCACGUCCAGCUAAUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGACGGGGUUUUGCCAUGUUGGCCAGACUGGUCUCAAACUCCUGACCUCAGGUGAUCUGCCUGCCUCGGGCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGCGUGAGCCACUGCACCCAGCCUAAUUUUAUGUAUUUUUAGUAGAGAUGGGGUUUCACUAUGUUGGUCAGGCUAGUCUUGAACUCCUGACUUGGUGAUCCGCCUAUCUCAGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUAUAAGCAUGAGCCACCGCGCCCGGCCUUUGGGGGCAGUUUCUAAUGGUUUAGCACUAUCCCUUUGGUGCUGCCCUCAUGAGAUCUGGUUGUUUAAAAGUGUCUGGCAGCUCCCCAUUCUCUCUCUUCUGCCUGCUCUGGUCAUGUAAAACAUGCCUGCCUCCCCGUUGCCUUCCACCAUGAUGGUAAGUUUCCUGAGGCCUCCCCAGAAGCAGAAGCUGCUAUGCUUUCUGUACAGCCUGCAGAACCGUGAGCCAAUUAAACCUCUCUUCUUUAGAAAUUACCCAAUCUCAGGGUGGUGCAGUGGCUCACACCUGUCAUCUCAGCACUUUGGGAGGCCAAGGCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-675.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -695.19

Frequency: 0.0000

Diversity: 264.18

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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