Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_AKT3_0000600

Sequence Length

1358 nt

GC Content

0.3932

GAGAAUAUAUAAAAAACUGGAGGCCAAGAUACUUCCUUUUGAAGACAGAUGGCUCAUUCAUAGGAUAUAAAGAGAAACCUCAAGAUGUGGAUUUACCUUAUCCCCUCAACAACUUUUCAGUGGCAAAAUGCCAGUUAAUGAAAACAGAACGACCAAAGCCAAACACAUUUAUAAUCAGAUGUCUCCAGUGGACUACUGUUAUAGAGAGAACAUUUCAUGUAGAUACUCCAGAGGAAAGGGAAGAAUGGACAGAAGCUAUCCAGGCUGUAGCAGACAGACUGCAGAGGCAAGAAGAGGAGAGAAUGAAUUGUAGUCCAACUUCACAAAUUGAUAAUAUAGGAGAGGAAGAGAUGGAUGCCUCUACAACCCAUCAUAAAAGAAAGACAAUGAAUGAUUUUGACUAUUUGAAACUACUAGGUAAAGGCACUUUUGGGAAAGUUAUUUUGGUUCGAGAGAAGGCAAGUGGAAAAUACUAUGCUAUGAAGAUUCUGAAGAAAGAAGUCAUUAUUGCAAAGGAUGAAGUGGCACACACUCUAACUGAAAGCAGAGUAUUAAAGAACACUAGACAUCCCUUUUUAACAUCCUUGAAAUAUUCCUUCCAGACAAAAGACCGUUUGUGUUUUGUGAUGGAAUAUGUUAAUGGGGGCGAGCUGUUUUUCCAUUUGUCGAGAGAGCGGGUGUUCUCUGAGGACCGCACACGUUUCUAUGGUGCAGAAAUUGUCUCUGCCUUGGACUAUCUACAUUCCGGAAAGAUUGUGUACCGUGAUCUCAAGUUGGAGAAUCUAAUGCUGGACAAAGAUGGCCACAUAAAAAUUACAGAUUUUGGACUUUGCAAAGAAGGGAUCACAGAUGCAGCCACCAUGAAGACAUUCUGUGGCACUCCAGAAUAUCUGGCACCAGAGGUGUUAGAAGAUAAUGACUAUGGCCGAGCAGUAGACUGGUGGGGCCUAGGGGUUGUCAUGUAUGAAAUGAUGUGUGGGAGGUUACCUUUCUACAACCAGGACCAUGAGAAACUUUUUGAAUUAAUAUUAAUGGAAGACAUUAAAUUUCCUCGAACACUCUCUUCAGAUGCAAAAUCAUUGCUUUCAGGGCUCUUGAUAAAGGAUCCAAAUAAACGCCUUGGUGGAGGACCAGAUGAUGCAAAAGAAAUUAUGAGACACAGUUUCUUCUCUGGAGUAAACUGGCAAGAUGUAUAUGAUAAAAAGCUUGUACCUCCUUUUAAACCUCAAGUAACAUCUGAGACAGAUACUAGAUAUUUUGAUGAAGAAUUUACAGCUCAGACUAUUACAAUAACACCACCUGAAAAAUGUCAGCAAUCAGAUUGUGGCAUGCUGGGUAACUGGAAAAAAUAAUAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-317.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -346.03

Frequency: 0.0000

Diversity: 360.61

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.....(((((.........(((.(((.....((((.....)))).....)))))).........)))))..(((....)))..((.(.((((.......))))).))......((((((((((.....((((((((...............................(((((((.(((..((((.....))))..))))))))))....((((...))))...((((((((((((..(((.((..((((.((...)).))))..))...((((.....))))(((((((........................((((.((((.....(((......))).....))))...)))))))))))....))).........(((((.((....(((((((((.(.(((((((.......((((...((((((((.((((.((.....(((((((((....(((((((((((((..((.(((.((((.((((((......)).)))).)))).))).)).....((((.....))))....(((....)))...............(((....(((((.((((((.........((((((.((...((((((.((.....)).)))))))).)))))))))))).)))))....))).))))))))))))).(((((((....))))))).((((.((....)).)))).....(((((.......))))))))))))))...)).)))).)))))..))).))))((((((((...(((.(((.(((((.((((.......(((....)))........))).).))))).))).)))....)))))))).......(((((...(((....))).)))))...........(((((((((...))))))))).((((((..(((.((((.(.(((....))).)..)))))))..))))))....(((........(((((((((....)))))))))........)))((((.....(((((...(((.((((((.....)))))))))...)))))...)))))))))))))))))))))))))))).(((.((((.....)))))))...........(((((.....)))))(((((.........)))))(((((...))))))))))))))))))))))))).((.(((((.(........).))))).))..............((((..((((((..((((.((..((......))..)).))))....))))))...)))).......))).)))))))((((((.((((...)))))))))).((((....))))...............

Thermodynamic Ensemble Prediction

..................((((({((.,...{{(({,..,||||.....,}}})}.}))}.}}}},,,...(((....)))..((,(.((((.......)))),.}}..,..,((((((,,,(({...((((((((..............................,((((({,..(({{(((({,..,||||..}}))),,,|,||}.,}}))),.)))}},(((((((((({{..,,,.((..((((.((...)).))))..))...((((.....)))){(((((,......,,,..........,...,|||{.((((.....,{,.......,,....,}}}}...}}}})))))))....,,|{{{{,....(((((.(({,.,,{(((((((.{,(((((((.,,....(((,...,,,((({{.{({{,{{.....{{(((((((.{,.(((((((((((((,,((.(((.((((.((((((......))))})).)))}.))}.}|,,{{.((((.....)}}||,..{{,....})}})}......,,,||||.,.|.|((((,.((((({,.......,((((((.((...((((((.((.....)).)))))))).)))))))))))).)))))..,,.)))))))))))))))).(((((((....))))))),,,,,,{{{{{.{(({{{{|||||(((((.......)))})|||||}}}}...}}.|||},|},}}..|||{|||}((((((((...(((.(((.(((((..(((.......(((....)))........))).,.))))).))).)))....)))))))).},}}}}(((((.,.(((....))).)))))..,}}.,,,..(((((((((...))))))))).((((((..(((.((((.(.(((....))).).,)))))))..))))))...,,,,...,,.,,(((((((((....))))))))).,},}}},}},{|||,,,..{{{{{...,{,.((((((.....)))))),}),,,))))),..}}}})))))))))))))))))))))))).(((.((((....,)))}})).........,||((((.....)))),}}}}},....,{{{{{|.|(,,,|,.})))))))))))))))))))))))))...}}|...}}}...,,,}}}))}.)}))},,|,.....{|.,(({,.,(((({{.}||||,||.,|{.,|||.,,.,)}.}}}}.,,{|||||,...||||{,,......,,(({|...,{{|||}{{,,...)))))))}},.}})))}..})),...............