Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_AKT3_0001800
Sequence Length
2021 nt
GC Content
0.3726
GGUUGGUAUUUCUUUAUUACAAAGAACUGCAAAAGAGGAUAUCGCCUUACCUUACAAAAUAAGAUUUAGGUUUGAUUUACAAGCACCACCAAAAAACAUUUCUGUAAGUGAAUAUUUUAUAAUAGCAAUAGAUUCCCAGGAGAAAUUGUUGAAACCAUCUGUAUAUAUCUAGAAGAAGAUGCUCAUCUCUUUGGGAUUGUUUAGAUCACAUUUUCUUUUUUAAAAAAAGAGGAUUGAUGUUUGCUUUGAAAAGUUGAUUAGGCUUUAAUUUCAGAACUUACAAAAUAAUGGCUCUUAAAGCUAUAUCACUUAUUCCCAUCGGUUUAAAAAUAGAUAAUUUUAUCAUCGUGAAGUAUUUGAUAAAACAUGUUUCUUUUUACACGUGAAGCAACAGAGUUUGUAAGUACUGAGCGUUCUAUUAGCUACAACUAUGUCCUGUUUCCAAAAUACCUUACUCAGCAUUCAGUAGUUUUUUAAAAUGGUAUUUUCAUGUUGUUGAAGACUAUAGAACAAAUUAUGUCAUUUUUCUUAAUACACAGUUGGAGAAUCUAAUGCUGGACAAAGAUGGCCACAUAAAAAUUACAGAUUUUGGACUUUGCAAAGAAGGGAUCACAGAUGCAGCCACCAUGAAGACAUUCUGUGGCACUCCAGAAUAUCUGGCACCAGAGGUGUUAGAAGAUAAUGACUAUGGCCGAGCAGUAGACUGGUGGGGCCUAGGGGUUGUCAUGUAUGAAAUGAUGUGUGGGAGGUUACCUUUCUACAACCAGGACCAUGAGAAACUUUUUGAAUUAAUAUUAAUGGAAGACAUUAAAUUUCCUCGAACACUCUCUUCAGAUGCAAAAUCAUUGCUUUCAGGGCUCUUGAUAAAGGAUCCAAAUAAACGCCUUGGUGGAGGACCAGAUGAUGCAAAAGAAAUUAUGAGACACAGUUUCUUCUCUGGAGUAAACUGGCAAGAUGUAUAUGAUAAAAAGCUUGUACCUCCUUUUAAACCUCAAGUAACAUCUGAGACAGAUACUAGAUAUUUUGAUGAAGAAUUUACAGCUCAGACUAUUACAAUAACACCACCUGAAAAAUAUGAUGAGGAUGGUAUGGACUGCAUGGACAAUGAGAGGCGGCCGCAUUUCCCUCAAUUUUCCUACUCUGCAAGUGGACGAGAAUAAGUCUCUUUCAUUCUGCUACUUCACUGUCAUCUUCAAUUUAUUACUGAAAAUGAUUCCUGGACAUCACCAGUCCUAGCUCUUACACAUAGCAGGGGCACCUUCCGACAUCCCAGACCAGCCAAGGGUCCUCACCCCUCGCCACCUUUCACCCUCAUGAAAACACACAUACACGCAAAUACACUCCAGUUUUUGUUUUUGCAUGAAAUUGUAUCUCAGUCUAAGGUCUCAUGCUGUUGCUGCUACUGUCUUACUAUUAUAGCAACUUUAAGAAGUAAUUUUCCAACCUUUGGAAGUCAUGAGCCCACCAUUGUUCAUUUGUGCACCAAUUAUCAUCUUUUGAUCUUUUAGUUUUUCCCUCAGUGAAGGCUAAAUGAGAUACACUGAUUCUAGGUACAUUUUUUAACUUUCUAGAAGAGAAAAACUAACUAGACUAAGAAGAUUUAGUUUAUAAAUUCAGAACAAGCAAUUGUGGAAGGGUGGUGGCGUGCAUAUGUAAAGCACAUCAGAUCCGUGCGUGAAGUAGGCAUAUAUCACUAAGCUGUGGCUGGAAUUGAUUAGGAAGCAUUUGGUAGAAGGACUGAACAACUGUUGGGAUAUAUAUAUAUAUAUAUAAUUUUUUUUUUUUAAAUUCCUGGUGGAUACUGUAGAAGAAGCCCAUAUCACAUGUGGAUGUCGAGACUUCACGGGCAAUCAUGAGCAAGUGAACACUGUUCUACCAAGAACUGAAGGCAUAUGCACAGUCAAGGUCACUUAAAGGGUCUUAUGAAACAAUUUGAGCCAGAGAGCAUCUUUCCCCUGUGCUUGGAAACCUUUUUUCCUUCUUGACAUUUAUCACCUCUGAUGGCUGAAGAAUGUAGACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-473.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -512.45
Frequency: 0.0000
Diversity: 484.83
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(....(((.((((((.....)))))).)))((((((((..(((((((...((((.....))))....))))..)))...(((((((..((((((......((((((((((..((((((....(((((.(((((((((((((((((.(((.((.....((((.(((.((((.(((((.(((....)))))))).))))))).))))))))).)))))))........(((((((.((((((.........((((((.....))))))...(((((.(((((((((...((((((.....)))))).....(((..((....))..)))..........((((((((............))))))))..((((((...........))))))......))))))))).))))).(((((((.((((.((((((((..........(((((((((((((........)))))...........))))))))))))..)))).)).))))))))).....)))))).)))))))..........))).))))))).)))))....))))))..))).......)))))))))))))............((((.....((((((.(((((...(((....))).)))))((((((((.((((((((((((.(((((((....((((((..(((.((((.(.(((....))).)..)))))))..))))))....(((........(((((((((....)))))))))........)))((((.....(((((...(((.((((((.....)))))))))...)))))...))))....((.((((.....))))..)).(((.((((.....))))))).....)))))))))))).....)))))))......((((((((.((...)).)))))))).))))))))...(((((.....(((((.(........).)))))..((((((((((((...((((..((((((..((((.((..((......))..)).))))....))))))...))))......(((((((.............))).))))...(((((...(((.(((..((((.((.......)))))).))).)))......(((((((((.((((.....)))).)))))).)))..(((((..(((((.((((.........)))).)))))..((.((((((..(((((((.((((((.(.....).))))))..(((((...(((.....(((((((.((((....)))).((((((((((((...(((((((..............(((((.((......)).)))))....((((((.(((.((........)).))).)))))).(((((((.....((...)).....))))))).............(((((((...))))))))))))))..(((..(((((((((((((....(((((..(((((((..(((.((((((((((.((....(((((.((((.((..(((.(((....))))))..)).)))).)))))....)).))))))))))..)))...))))))).))))))))))))...))))))......))))))))))))))).((((.........))))....(((..((((.((...)).))))..))).........)))))))....)))..)))))...........))))))).(((..((.(((((((((((....)))))))......(((((((((...(((....))).....)))))))))))))...))..))).)))))).))..(((((..((........))..)))))....(((((....))))))))))((....)).))))).))))...))))))))((..((......))..)))))))...))))))...)))))))))))....)))))))))(((((..((((((.(((((......)).))).))))))))).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
({...(((.((((((.....)))))).))){{((((((..,{{{(((...((((.....))))....))))..,,,,..(((((((..((((((......((((((((((..((((((....(((((.(((((((((((((((((.{(,{({....,((((.(((.((((.(((({{(((....)))))))).))))))).)))))||}|,|||||||{,....,,|||||||.||||{{..,.,,.,,{(((((.....)))}}}...{((((.((((((({,...{(((((.....)))))},{{{.,({,.{{...,||,.|||,,...{{{,.||||||||..||,.||||,.)))}}||,..((((,({{{........)))),)}}}..,))))))))).))))).(((((({,((((.((((,(((..........(((((((({{({{........}}}}),..........)))))))))))),.)))).)).))))))))).....,,}))).))))))}.........,))).))))))).)))))....))))))..))).......)))))))))))))..,,.....,}.{(((,....((((((.(((((.,.(((....))).)))))((((((((.,(((((((((({,{((((({,,,.((((((..(((.((((.(.(((....))).).,)))))))..))))))....,{{....,,.,(((((((((....))))))))}...,....,,,((((.....{((((...{{{.((((((.....))))))}))...))))).,.))}},,,.{{.((({.....}))).,}|.(((.((((....,)))}})).....}))))))))))).....))))))}......((((((((.((...}).)))))))).))))))))...(((((.,{{,(((((.{........}.)))))..((((((((((((...((((..((((((.,{{{{.{(.,((.,,,,.,,..)).))))...,))))))...))))......(((((((.,.........,.))).))))...(((((,,,(((.(((..((((.({.......}))))).))).)))......(((((((((.((((.....)))).)))))).)))..(((({..(((((.((((.........)))).)))))..((.(((({{..(((((((.((((((.(.....}.))))))..(((((...(((.....(((((((.((({....}))).|(((((((((({,,.(((((((..............(((((.((......)).}))))....((((({.{({,,,...........||},}}}}}).(((((((..,..({...}}.....))))))).............,((((({...})))))}})))))).|(((.,((((({{((((((....(((((..(((((((..(((.((((((((((.((,...(((((.((((.{(..(((.(({....})))))..)}.)))).)))))..,,)).))))))))))..)))...))))))).))))))))))))...)))}}),,,,,.))))))))))))))},((((.........||||....,,,..||||,({,.,||.}}}),,,))}}.......)))))))....))}..)))))....,,,.,,,))))))),{(...,|||{|{{((((((,...,)))))),....,{((((({{{...(((....))).....})))))))}))}}.,..,.,}))})))))).})..(((((..((........))..)))))....(((((....)))))})))){{...,)).})))).))))...)))))))){{..,,,.....}},,,,)))))...)))))).},))}}))))))).,,,)))))))))|(({(..((((((.(((((......)).))).))))))})).))
Back