Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_AKT3_0002000
Sequence Length
1353 nt
GC Content
0.3962
GUGUUAGAAGAUAAUGACUAUGGCCGAGCAGUAGACUGGUGGGGCCUAGGGGUUGUCAUGUAUGAAAUGAUGUGUGGGAGGUUACCUUUCUACAACCAGGACCAUGAGAAACUUUUUGAAUUAAUAUUAAUGGAAGACAUUAAAUUUCCUCGAACACUCUCUUCAGAUGCAAAAUCAUUGCUUUCAGGGCUCUUGAUAAAGGAUCCAAAUAAACGCCUUGGUGGAGGACCAGAUGAUGCAAAAGAAAUUAUGAGACACAGUUUCUUCUCUGGAGUAAACUGGCAAGAUGUAUAUGAUAAAAAGCUUGUACCUCCUUUUAAACCUCAAGUAACAUCUGAGACAGAUACUAGAUAUUUUGAUGAAGAAUUUACAGCUCAGACUAUUACAAUAACACCACCUGAAAAAUAUGAUGAGGAUGGUAUGGACUGCAUGGACAAUGAGAGGCGGCCGCAUUUCCCUCAAUUUUCCUACUCUGCAAGUGGACGAGAAUAAGUCUCUUUCAUUCUGCUACUUCACUGUCAUCUUCAAUUUAUUACUGAAAAUGAUUCCUGGACAUCACCAGUCCUAGCUCUUACACAUAGCAGGGGCACCUUCCGACAUCCCAGACCAGCCAAGGGUCCUCACCCCUCGCCACCUUUCACCCUCAUGAAAACACACAUACACGCAAAUACACUCCAGUUUUUGUUUUUGCAUGAAAUUGUAUCUCAGUCUAAGGUCUCAUGCUGUUGCUGCUACUGUCUUACUAUUAUAGCAACUUUAAGAAGUAAUUUUCCAACCUUUGGAAGUCAUGAGCCCACCAUUGUUCAUUUGUGCACCAAUUAUCAUCUUUUGAUCUUUUAGUUUUUCCCUCAGUGAAGGCUAAAUGAGAUACACUGAUUCUAGGUACAUUUUUUAACUUUCUAGAAGAGAAAAACUAACUAGACUAAGAAGAUUUAGUUUAUAAAUUCAGAACAAGCAAUUGUGGAAGGGUGGUGGCGUGCAUAUGUAAAGCACAUCAGAUCCGUGCGUGAAGUAGGCAUAUAUCACUAAGCUGUGGCUGGAAUUGAUUAGGAAGCAUUUGGUAGAAGGACUGAACAACUGUUGGGAUAUAUAUAUAUAUAUAUAAUUUUUUUUUUUUAAAUUCCUGGUGGAUACUGUAGAAGAAGCCCAUAUCACAUGUGGAUGUCGAGACUUCACGGGCAAUCAUGAGCAAGUGAACACUGUUCUACCAAGAACUGAAGGCAUAUGCACAGUCAAGGUCACUUAAAGGGUCUUAUGAAACAAUUUGAGCCAGAGAGCAUCUUUCCCCUGUGCUUGGAAACCUUUUUUCCUUCUUGACAUUUAUCACCUCUGAUGGCUGAAGAAUGUAGACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-320.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -346.80
Frequency: 0.0000
Diversity: 452.55
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((((.((((((..(((.((((.(.(((....))).)..)))))))..))))))..............((((((..((((...(((((((((((((((...(((((((...(((((...(((.((((((.....)))))))))...)))))...(((((((...((((..(((..(.((((((((((((((.....))))...........)))))))..))).)...)))..))))...))).....))))..((((((((((...)))).))))))(((((.................)))))...(((((((..(((....((((..((((((..((((.((..((......))..)).))))....))))))...))))......(((((((.............))).))))..((((((...(((.(((..((((.((.......)))))).))).)))......(((((((((.((((.....)))).)))))).)))...((((..(((((.((((.........)))).)))))...))))......))))))..((((((.(.....).))))))..(((((...(((.....(((((((.((((....)))).((((((((((((...(((((((..............(((((.((......)).)))))....((((((.(((.((........)).))).)))))).(((((((.....((...)).....))))))).............(((((((...))))))))))))))..(((..(((((((((((((....(((((..(((((((..(((.((((((((((.((....(((((.((((.((..(((.(((....))))))..)).)))).)))))....)).))))))))))..)))...))))))).))))))))))))...))))))......))))))))))))))).((((.........))))....(((..((((.((...)).))))..))).........)))))))....)))..))))).....))))))))))((.(((....))).))(((((((....)))))))........)))))))...)))))))......)))))))).))))....))))))(((((((((((((.(((((..((........))..)))))....(((((....)))))...........((((((..((((((.(((...((.((..((......))..)).)).))).).)))))....))))))..(((((.....))))).)))))))))))))....))))))).(((...........)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
,(((((((.({{{{(,.(((,({{{,({(((..,,|||{|,|,|}||||,,||||||,,,,,,,,,,|{{,{(((((((((....}|||||}}|,{{{{{,...,((((.....(((((...(({.((((((.....))))))}))...)))))...}}}},,,,{{{(({,.,,,.}|||{{{({((({((((.....}}||,,,........||}}||||{{{{{.,{{{{{{{|,,...{{{{{{{.{{,,.,.{||||||||{..,))}}.}}}))){{{{(..,{{{,..........)}))),},}||,,,,....,,,..((({..((((((.,|{{|.{{.,{{..,{,.},.,)).})})...,)))))).,.))}}......{((((((.,.........}.))).)))),|{{.{|{,,,{{{.{{{,,({((.{|.......,})))).}}}.}}}......(((((((((.((((.....)))).)))))).)))..,,}}}..|||{|.||||.,.....,.)))}.}))))}}}})}.|.}}}})))))}|.||||,,.,.}}}})})}|||}..(((({.,{(({,.,..(((((({.((({....}))).|(((((((((({,,.(((((((..............(((((.((......)).}))))....((((({.{({,,,...........||},}}}})).(((((((..,..({...}}.....))))))).............,((((({...})))))}})))))).|(((.,((((({{((((((....(((((..(((((((..(((.((((((((((.((,...(((((.((((.{(..(((.(({....})))))..)}.)))).)))))..,,)).))))))))))..)))...))))))).))))))))))))...)))}}),,,,,.))))))))))))))},((((...,,,...||||....,,,..||||,((,.{||.}}}),,,))}}.......)))))))..,|}||{{||||,.,{{{||,{||||||((.(((....))).)){((((((,...,)))))),...,}||||||}}},,,}))))}},)),..}}}})))),}})}},,,,,,.,}|||||||||{{{{.{((((..((........))..))))}..,.(((((....))))).|,,,{,....{{{{{(..{(({|..{{{...((.((..{{......)}..)).)).}})}).}}))}....))))))..(((({.....})))).})}}}||||||,|{{,,,}}}}}),{||,.,,,,,,..,)))
Back