Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_AKT3_0022100

Sequence Length

1207 nt

GC Content

0.3513

UUGUUUGAAUCUGUGGAUGAGAAACUCAUGGGUUCAGAAUGGCCUAUCACAAACUGAGGAUUAUGGAAAAAUACUGUAGUUUACAGGUAUUUUUUUGAAUACUGUUAAUACACAGAUUACUCAUAGUCUAAUUGGAAUAAAAAUAUUGAGAAAAAUAAAGUCCUUUUCAUGUUUAAUUUCUAAUUCUUUGCACAAAAGUAAUUUUUUGGAAAAGCUGUUUCUUGGUUUCAUUUUAGAAUUCCCAGCAACCAAAAGUAAGCCUGAGUUUGUACCAAGUCUAGGUUAGAAGAGGCAAAAAUUGAAGACCUACAUUUGUACUGUUCAACAAAGUAGCCAUGGGCCAAAGUGGCUGUUGAGCACUUGAAAGGUGAUUGUGGUGAGCAUGCACCCACUUUUGCAGCUAUCUAAUAAAAAGAUGGAAAUAGUUGGACAACUCAUAUCAACUAUGAGAAUGACUGGUGAUGACUGAUAGUAAGAGCUGGCUACUCAUGCUAACGUUUGUUGCUAGGUAUGUUACAGUAGUCUCUAAUAAAAAUGGUGGAAAAUGUUAUGAGAGGAAACGCAACGAAAUAUUUUUCUGGGUAUAAAGUAAUGUUACAAAUUGCUUUUGGUAUGAGUAGCCAGUUAAAGUUUCAAAUAUCAUACUUAGAUGAUAUUUUUAGAAACAUGUUGAAAAAUAGUCAUGUGGUGCAGAAUGAUGUUUCAGUCAAUGAUGGACUGCAUAUAUGACAGCGAUCCCAUAAGAUUAUAAUGGAACUAAAAAAUUCUUAUUGCCUAGUGAUGUAACAUCAUAGCACAAUGCAUUACGUUUUUAUGGUGAUGGUGGUGUAAACCAACCUAUUGCAUUGCCAGUUUUGUACAAAAGUGUAGCACAUACAAUUAUAUACAGUACAUAGUACUUGAUAAUGAUAAUAAAUGACCGUGUUACUGGUUUAUGUAUUUAUUAUACUGUUGUCAUUUCAGAGUGUACUCUCUCUGCUUUAUUUUCUUUUUUAAAGGUUAACUGUAAAACAGUCUCAUGCAGGUCCUUCAGGAGGUGUUACAGAAGAAGGCGUUGUUAUUGGAGAUGGCAGCCCCAUGCACAUUAUUGCCCCCAAAAGCCCUCCACUGGGACAAGAUGUGGAGGAGGACAAUGAUAUUGAUGAUCCUGACCCCGUGUAGGUCUAGGCUAAUAUGUAUGUUUAUAUCUAAGUUUUUAACAAAAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-303.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -329.12

Frequency: 0.0000

Diversity: 292.07

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((((((((((((.........))))))))))))).((((((.(((.....)))(((((((((...(((.((((.(((((..(((((((....)))))))..))).)))))))))..)))))))))((((((((...((((((.(((((...........)))))))))))...))))))))..((((......)))).(((((((....((((......((.(((......)))..))))))..)))))))...((((...(((..(((.......)))..))).)))).........((((((((((((((((((((((((.((((.((((..(((((...)))))..)).)))))).(((((((.....((((......)))))))))))....((((((.......)))))).....)))))))).((((((.....))))))...(((((((((((.(.(((((....((((((((((((((((((((((((.((((((....(((((.((....)).)))))....)))))).))))))...........((.((..((((....)))))).))..((((((((.......))))))))))))))))))))))))))...((((((((((((((......)))))))))...))))).((((....))))((((((((.(((((........((((........))))))))))))))))).((.(((((((((((...(((((..................(((...((((((...)))))).))).....)))))...)))))))).))).))(((....)))...)))))))))))))))))..))))))...((((((((..............(((((...)))))(((((((.((((((((((((((......))))).....)))))))))...)))))))...(((((........))))).........(((((...((((....(((((...........)))))..)))).)))))))))))))......((.(((((((((...))))))))).))..(((......)))..........(((((((...........)))))))((((..((.......))..))))......))))))))))))))))..(((((....))))).))).(((((....))))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((((((((((((((.,.......})))))))))))).{((((({.{({....|.{(((((((((,..(((.((((.{{,||||{{(((({....}))))))||.,,.,}))))}}}..|}})))))}((((((((...(((((,{(((((...........)))))))))))...)))))))).,(({{...,,,)}},.{((((((....((((.,,,,.((.{{{.....,)))..}}))))..))))))}...((((.,.{({,.{((.......))),,)),.})))......,,.(((((((((({(((((((((((((.{{{{.((((..{{({,..,)))))..)).)))}}}.,,,{(((,.,({({((......))))}}}}}}},},.((((((.......))))))...,,))))}}}}.((((((.....))))))...(((((((((((.{.(((((....((((((((((((((((((({{(((,(((({{..,.{{{{{.{(...,||,|}|||,...|}}},,.,}))}))},.,}}},..{|,||,,|||(,,,,|}}},),)),,{(((((((.......))))))))))))))))))))))))))...((((((((((((((......)))))))))...))))).{{{{....}))}((((((({{(((((..{,{{...,{,,,,..,.,},,,))))))))))))).{(.(((((((((((.,.(((((,{,........,,,.,,{((,,,.((((((...)))))),)},,,,},))))).,.)))))))).))).)|(((....)))...)))))})))))))))))..)))))),.|{(({,,.,.,,,,....,....(((((...)))))((((((({((((((((((((({......})))}....,))))))))).,.)))))))...(((((.{....,.))))){{{{{....,,....}}))),...{((((...})))},.,,|},}}|||||,,,{||||||||,,,......((.(((((((((...))))))))).)}..{{,......})),.......,.(((((((...........))))))){||{|.||,,...,.))}.))))..,,..))))))))))}))))},,((({{....))))).}}).{{{{{.,,.}}}}}.