Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_AKT3_0024100

Sequence Length

2046 nt

GC Content

0.3759

AAAUUGCCACAGCCACUCUAACCUUCAGCAACUGCCACCCCAAUCAGUCAGCAGCCAUCAAGGCAAGACCUUCUACCAGCAAAAAGUUUAUGACUUGCUGAAGGCUCAGAUGAUCCUUAAUUAAGGUAUGUGCAUUUUAAAAUCAUAAUGCUGUUACACAGAAGACUAUAGUAUAGUGUAAACAUAACUGUCAUAUGAACUGGGAAUCCAAAAAAUUUGUGUUACUCACUUUAUUGUGGUGGUCUGGAACAGAACGUGCAAUGUCUCGAGGUAUGCCUGUAUACAGGAUAAUGUGUGUAGGUUAUAUGCAAAUACUAUACCAUUUGAUAUAAGAGACUUGAAUAUCUGUGGAUUUUAGUAUCCUUAGUGGGUCCCGGAAUCAGUCCCCCCCACGAAUACCCAGGGAUAGCUGCACUCACACAUAAUGAAUUUAUAGUGGAAAUUCUAUGAAAUGUAUAUAGAGUUGUUAUAAUAUACCUAGGAUGAUCAUUGGUAUUUCGGAAUAGCUUUUAGAAUAUGACCAAGAUACAUGACAUCUACUAUUAUAUAAACCUGUGUUUGUUUCAGCAUGUUUUUUUCCUAUGUUUUGUUCCAUGUUAGAUGUCAUGAGUUUGCAAAGUAUAAUAAGCUAUAUUCCCUGCCUUCAAGUAGCUUACCAUCCAUGUACCAUUUCCCAAAGUGUACAUCAUUAGCAGGUAGGUAUUCCUCAAAAAUAGAUUAUUGUCUCUGAUUAAGUUUCAGAGAUACCUGGAUUAAUCAAAAUUGAAAGUUUUUUUUUAGAAUAGGGUUCUCAAAUGCAUACAUUAGGGAAUUCCAGAAAGCGACUGUAUGUUGCAAGGUUUUCCAAGCUUUGUCGACACACUAUUUUUUUUCUCAUGAAACUUCUGUGGUGGGAUCUGAGGGGAAUGGAGGUGGGGAAGAGAGUGGCAGUGGUGUUUUUAGGAAGAAGAUUAAUGUAGGAGAGGAGUGGGAGGAACACCUAGGACAGUAGCUGUGUACCUGGCCUAGGUUCCUCAGUCCAGAUGGUAGCAAGUCUGAAGACAGGGAGAGACUUCUUCCAGAAGAUGAAAUUCAUAGAAACCUGAGGCAAAUUGGUAUACUCAAAGGAGCUUUGUCAGACUGGAGAGUCUGGGGUGAAUUGGGAUAAAUAUAUAGUAGAUAAGUAUGUAGAAAACUAAAGAAAUGAGAAACAAAUUAUUAAUUGCAAGGGAAACAAAAUGUUAUGCAGGAAAAGAAAAGUAAUUAUUGUUUACUGCUUGGUUCAGCUCUGAAUACCCUAUGUAGUUAUAAUGACAUAAGCCUCAAAUAUUGAUCUAACCAAAGUUAGGAUUGUGUUGAGACAUCGGGGGUGGGAAGUGUGGAGGAUGCCAGGACCAGGAAACAGCUAUAUCUCAAAUUUCCUCAACUGGCAGUCACUGAAUAAAGAAAGCUUUUGGGAAAAGGAAAUAUUGGAGAGGGAGCUGGGACUAGUUUUUCAUAACAAGCCUUGUAGAUCUAGUUAAUUUAAAAAAAUGUGCAUGGGUAACAUUUAUUUUUACCUUUAUCAGAUAUUUUUCUAGAUCAAAAUUUUUACAAUUGUUUUAGCUUCUCAUUGAAAUGUUGUCUUACUAGGUUAAAGUUUCACGUGUGUAAUUGGAUUUGAAAAAUGUAAAUUCACUUUGUCGUUGCCUUUAUGAUUUAGCUACAAAGAUCUUACUUAUGGAUGAGAUGAUGACUGGCAGUUAUUCCACACCAACCACUCUGGGACCAAGGUUUUCUAGAUUAACCUAAUCCUACAGUCCUUUUAUUCUGUGUUUCCCACUCCUACAUUUUAAACUUUGUAUCUGUAUUAUGCUCUUCUGUGCUUGUUAGAAUACACACUGUGUUCUCAGGUCAGUUCUUACAUGGGCCUCUUCUUUUUUUUGCCUUCUUUAAUUUCCUUUUCUUCACAGCUUUUUUAGCAUGUCAGUAGCAGAGCUGACUUUAUGUAGUGAGAAGCUACUGUGUGCUUCUCUCUUGACCCUUCUCCCCAAACAUGGAUGGAAGGGCAGAACAAGAGACCUGUGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-538.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -580.98

Frequency: 0.0000

Diversity: 469.98

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

......((((((.........((((((.((..(.(((((((......(((((((((.....)))..(((((((....((((...((((...))))))))))))).)).(((.(((((......(((((((((((((..........)))))((((.(.((((..(((((((((.((((..(((((((.......((....(((....)))....)))))))))...)))).)))))))))..)))))))))....(((((.((((((..((((((((((((((((......))))))))))).........((((((..((((..(((((..((...))..))))).))))....)))))).....(((((....(((.....)))..)))))..)))))..))))))..)))))((.(((((((.....)))).)))))(((((((((.......)))))))))......))))))))))))).))).(((((..(((.(((.....))).)))....)))))..((((((..(((((((((.((((..(((...(((((((((((...((((((....((((((((((.(((((........)))).)...))))))))))...........((((((.((((((.(.(((.((((((.((((((.((((....))))))))))..............((((((((.............(((((((((.......)))))))))((((.(((((((.....((((((....)))))).......((((((.((((....)))).))))))((((((((((.((((..(((((((((((((...)))))))).)))))..((((((((((((((((....(((((..(((...)))..))))).......)))))))))))))))))))).)).))))).)))....))))))).)))).)))))))).(((((..(((((((.(((..((...))..))).))))))))))))......))))))))).).).))))).))))))....(((((...)))))((((...))))))))))))))))))))).)))...(((((....(((...(((((((....))))))))))...)))))....)))))))))))))...))))))..............((((......(((((.(((((((((((........((((..((..(((..((..(((((.......)))))..))..))).))....)))))))).)))))))))))).........)))).........(((((....))))).....)))))).......))))))).)..)))))))).((((((....((((((...............))))))...))))))...........(((((((((...(((((((((((((..(((((((((.((.(((.((.(((......))).))))).)).(((((((.......(((((.((.((...((((((.........))))))....)).)).)))))))))))).........(((((.(((((((.......))))))))))))..(((.((((((((((((...(((((....((((((((.......))))))))((((((.((((...........)))).))))))((((((........))))))(((((((...)))))))...........(((.(((((...(((((.........)))))..))))).)))...........(((.....)))...)))))...)))))))).)))))))....((((..(((.(((((..((((((((...)))))))))))))))).........))))...............))))))))))))))))))))))...)))))))))((((((.(((((((....((.(((......))).))..)))))))))))))..(((((((.(((((((..(((....)))..))))))).....))))))).))))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

({{.,(((((.((((((((...((((..(,,((.(((((((..(((({,....(((.....)))......{{((((({.({..((((((((({..{(((((((((...(((.(((((......(((((((({((((.,......,.}}}}|((((.(.((((..(((((((((.((((..(((((((...,,....},..(((....)))......)))))))...)))).)))))))))..)))))))))}...(((((.((((((..((((((((((((((((......))))))))))).,,,,.,,,(({{{{..{{||,,|{||||,{,..,}}..}}})).})||,,..}}}})).....(((((....(((.....)))..)))))..)))))..))))))..))))){{.({{{(({.....)))}.)))},(((((((((.......)))))))))......))))))))))))).)))..,|,......((((((((((.,,..((((.....((((.(((((((((((.,,,...((((((..,,||}}},...||||{{.........,}}}},..,....}}).))))))))))).)))).....))))...))))))}.})))..))))))},))}(((((((....((((({{((({....)))))))))).....,..)))))))..,,,,.......,{{,,..(((((((((.......))))))))).,{,,,,|,,,,,..,,|||.,{,|||},}}}}},.,.((((((((.((((....)))).))))))})}{({{{{.{{..((.(((((((((((({...}))))))).))))).))..}}..}}}}})))))))}))}.}))))))))).))))))))..))),))))..)))))))))))).)))))|.,,,.((((((((((...(((((((((((((((((((({{{{((,{((({({({({,.{{{|{{|,,{||||||||,|{{,{(((((((........|||||..}}}.((((((....)))))).,...{{{,...))}},}.}}}}}||}}}.....)))}}}),{,,,{,,}}}}}}|||||||....})))))}|,||,.,{((({({{{..,,,.{({{,,.,{|{(.(((((((((........,........{((({{(((((((((((.{(({...}))}..((((..({.,(.,{....,,.}}.})}.))))...(((({....))))).)))).))))))))}))).........((({({(((.,.((((((....)))))).,.))))))))...,(.(((((((...((((((((..((((((,,,.{{....(((((...((((,,(((((((...{{(({,,(,.,,......,),..))).}}))....))))))).},.))))...))))){(.(|.({{......}}|.|}},{{{{,(((((((.......{,((({((,({...((((((.,.....,.))))))....}}.)),))))))))))))........,||}}..}|||||,|,|||{{{{|{||,|||||{{{.,,,}}|||,.||||||,{,|.|{{{.((((((((.......))))))))((((((.((({.,.....}...)))).))))))|{{{|||...,,},)))))}.....))))))....))))))))...))))))).),.....))))))))).}}.,,}}),}),)))).}}}},}}}}}}})))}}})))))))))),{,..........,|||...,,...,,}}....(((.(((((..((((((({...})))))))))))))))})))))))).....))))))))}}...,,...................,{(((((.,,,,..{(((((.(((((((....((.(((......))).))..)))))))}))))),,{{(((((.(((((((..(((....)))..))))))),,,..,)))))).))))))