Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_AKT3_0024300

Sequence Length

2398 nt

GC Content

0.4041

AUUUGUGGCAACCUUGAGUCGAGCCAGUCUAUCAGUGCCAUUUUUCCAAGAGCAUGUGCUUAUGUUGUGCCUCUGUGUCACAUUUUGGGUAAUUCUUGCAGUAUUUCAACUUUUUCGUUAUUAUUAUACCGGUUAUGGUGACCUAUGAUCAGUGAUCUUUGAUGUUACUGUUGUAAUUGUUUUGGGGCACCACGAACCAUUACCCAUGUGAGGUGAUGAACUUAAUAAAUGUGUAUGUUCUUAAUGAUCCAGCAACUGGCUGUACCCCUGUCUCUCUCACUCCUGAGACACAACAAUAUUGAAAUUAGUCCAGUCAGUAACCCUAAAAUGGCCUCUACAUGUUCAAGUGAAAGGAACAAUCACACGUCUCUCUGGAAAUGAAAAGCUAGAAAUGAUGAAGCAUAGUGAGGAAGCUAUGUUGAAAGCCAAGACAGGCAAAAAGCUAGUCCUCUUGAGCCAAGUGAAUGCAAAGGGAAAUUUCUUGAAGGAAAUGAAAAGUGCUAUUCCAGUGAACCCAUGAAUGAUAAGAAAGCGAAACAGCCGUAUUGCUGAUAAGGAGAAAGUUUGAGUGGUCUGGGUAGAUCAAACCAGCCACAACAUUUCCCUAAACCAAAGCCUAAUCCAGAGGCAGGCCCUAACUCUCUUUAAUUCUAUGAAGAGAGAUGAGAAAGCUGCAGAAGAAAAGUUAGAAGCUAACAGAGGUUGAUUCAUGAGGUUUAAGGAAAGAAGCCGUCUCCGUAACAUAAAAAUGCAAAGUGAAGCAAUCAAUGUUGAUGUAGAAGCUGCAACAAUUUAUCCAGAAGAUCUAGCGAAGAUCAUUGAUGAAGGUGGUUACACUAAACAAUAGAUUUUCAGUGUAGACAAAACACUCUUCUAUUUGGUGAAGAAGAUGUUAUCCAGGACUUCAUAGCUAGAGAGAGAAGUCAAUGCCUGCCUUCAAAGCUUCAAAGGACAGUGACUUUCUUGGUCGUAGCUAAUGCAGCUGGUGACUUUAAGUUGAAGUCAGUGCUCCUUUACCAUUCCAAAAAUCCUAGGACCCUUAAGAAUUAUGGUAAAUCUGUAUUCUGCCUGUGCUCUAUCAGUGGAAAAAGAGAGCCUGGAAGCCAGCACAUCUGUUCAUAGCAUGGUUUACUAUUUUAAGCUUACUGUGGAGACCUACUGCUCAGAAAGAUUCCUUUCAAAAUAUUACUGCUCAUUGACAGUGGACCUGGUCACCCAAGAGCUCUGAUAGAGAUGGACAAGGAGAUGAAUGUUGUUUUCAUGCCUGCUAACACAACAUUUAUUCUGCAGCCCAGGUAUCAAGGACUAAUUUCAACUUUCAAGUCUUAUUAUUUAAGAAAUACAUUUUCUAAGGGUAUGGCUGCUGCCAUAGGUAGCAAUUCCUCUGAUGGCCCUGAGCAAAGUCAGUGAAAAACUUUCCGGAAAGGACUCACCAUUCUAGAUGCCAUUAAGAACAUUCAUGAAUCAUGGGAGGAGGUCAGAAUAUCAGCAUUAACAAGAGUUUGGAAAAAGUUGAAUUUCAACCCUCAUGGAUGACUUUGAGGGAUUCAAGACUUCAAAGAAGAAAGUAACUGCAGAUGUGGUAGAAAUAGCAAGAGAACUAGAAUUAGCAGUGGAGCCUGAAGAUGGAACUGAAUUGUUGCAGUAUUAUGAUAAAACAUUAAUGGAUGAGGAGUUGCUGUUUUUUAUCUGUUUAUUAAAAAGAUUUUUUUAAAGACAAAGUCUCAUUCUGUUAGGCUGGAGCAGAAUACAGUGGCACGAUCCUAGCUCACUGCAGCCUUGAACUCCCUGGCUAAAGCGAUCCUCCCUUCUCAGCCUUCUAAGUAGCUAGGACCACAGUCACACACCACUGUGCCUGGCUAAUUUUUUAAAAAAAUUAUCUUUUGUACAGACAGGGUCUUGCUUUCUUGCCCAGGCUGUUUUCGAACUCCUCGCUUCAGGCGAUCCUCCUGCUUUGGCCUCCCAGAGUGCUGGGAAUACAGGUGUGAGCUACCACCCCUGGCCAGGCAUUGCUUCUUAUGGAUGAGCAAAGUAGGUGGUUUCUUGAGAUGGAUUCUACUCCUUGAGAAGAUGCUGUGAACAUUGUUGAAAUGACAACAAAAGGAUUUAGAAUAUUACAUAAACUUAAUUGAUACAGCAAUGGCAUGAUGUGAGAGGAUUAACUCAAAUUUUGAAGAAAGUUUUACUGUGGAUAAAUAGUAUGACACGUUACAGAGAUAUAUUUCAUAAGGAAGAGUCAAUUGAUGUGGCAAACUUUAUUGUCUCAUUUUAAGAAAUUGCCACAGCCACUCUAACCUUCAGCAACUGCCACCCCAAUCAGUCAGCAGCCAUCAAGGCAAGACCUUCUACCAGCAAAAAGUUUAUGACUUGCUGAAGGCUCAGAUGAUCCUUAAUUAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-630.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -674.71

Frequency: 0.0000

Diversity: 701.27

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(...((((((......((.(......).)).....))))))...)(...((((....))))..(((.(((((((((...((...(((((....((((((.....((((((((((((..............((((.(((((.((((.((((((((((.......)))))))........))).)))).)))))..))))(((((((....).))))))((((((....(((((..(((((((....(((((((...)))(((((((((.((((((..........))))))........(((((((((((((.((((............))))(((((((.(((((((....((((.........((((..(((((..........)))))...)))).((((((((......))))))))....(((......)))..........)))))))))))...(.(((((((.......((((((....))))))......))).)))))((((((((.(((.((((..(((..((....((((......))))...(((.(((((((...((((.((((..........))))))))))).)))))))........((((.......)))).(((((...((((((((..((((((....((((...((......((((((.....(((((...)))))(.(((((...((((((..(((((((...(((((...................(((........)))((((((((((.(((((...))))).))))..........(((((.....)))))))))))((((((((((((((((((........))).)))))).....((((.((((((.........))))))))))......((((((.............))))))...))).))))))...)))))((((((((.((((((((((((((.(((((.....)))))..))))..)))..))))))).)).)))))).....(((..........))).)))))))..))))))..))))).).))))))))...))))....))))))))))))))...))..))).))...)))..))))..))))))))))).............)))))))((((...(((((((.....((((((((...(((((..((((.(((...((((......)))).)))))))..)))))....))))..)))).(((((((((((................))))))))))))))).)))..)))).....)))))))))))))........(((((.....)))))..............)))))))))(((((((...)))))))..((((((((((((.((((......))))..........((.((((.((.....)).)))).)).))))))).......(((((...)))))))))))))))))))))..))))).....)))))).))))))))))))......((((((.((....)).))))))........((((...))))......(((((....))))).......))))))...........(((((.(((((((((((.((.(((......))).)).(((((((......)).)))))...((((((((((((.........(((((.(((((((....)))))))))))).......((((((((.......)))))))).(((((((.........)).)))))))))...((((..((((((.(((((((....(((((((..((........((((((((..((((((........))))))))))))))((((((...))))))........))..))).))))..)))))))...).)))))..))))...)))))))).))))))))..)))..))))).(((((((((((....))))))....(((.(((......))).))))))))(((((((((.....((((((.((...((.(((((((((((((((((((((((..((((((.(((((((((.(((((.((((((......)))))).....((((((((.((((((.......((((......))))......))))))(((......)))..))))))))....(((.((((((......)))))).)))..))).)).)).))).)))).)))))))))))).........(((((......))))).))))))))))))))))))).)))).))))......))))).))))..)))))...))..))))......))))).))).......(((((...((((...)))))))))((((.((....)).))))......)

Thermodynamic Ensemble Prediction

(...((((((...,{{({.{,,....},),.}}}}))))))...}(...,.(((((.(((...((((((((.(((((({..(((((((....(((((((.,,,.((((((((((((,.,,......,,..((((.(((((.((((.((((((((({,......)))))))........}}}.}))).)))))..))))(((((({....}.)))))){{((({....{((((..(((((({...{(({(({(...}}}(((((((((.((((((..........))))))........(((((((((((((.{,(({{{..,......|||,((((((({((({..{,,,..,||,,..,,,,.((((,.(((((..........)))))...)))).((((((((......))))))))....(((..,,..|||.....|||.}}}||}|}},}}...{.(({{({{...,...((((((....))))))......}||,}||||{{((((((((((,(({(..{{{.{(({{.{(,,,.}}.}}))),...(((.(((((((...((((.((((..........))))))))))).)))))))........((((.......)))).{{{{(,..((((((((,.,{{,,|||}}||||...{|..,{,{{{{{{,.....(({{{.,,))}||,.,||||,|||||||,||||||,|||..,,|||,.|{|.|,{{{{{{.....(((........))).,..}}}}||,||{||..,))})}.,,.,...,..,,,.(((((...,,|||||,|||.{{{{((((,,{{||||,,,,,,,.},,))),}|||}},....{{{{|((((({.......}}))}}},}}}}......{|||||.{,,{||||..||||||||,.,|,|||}}}}},..}}}}},{|||{||.||||{{||||{{||.|||||.....))))}.,||||,,}}}..))))))).)).))))}|,,,,,{{{.....,,.,.})).,}}}},}},}})}}},,,.}))}),}}))}}}},,.}}}}.|},}))))},})))))),,,))..}}),}}...)))..)))).,))))))))})),,,,,,.},}},,))))))}{|||,,,|||{,(({{{..{{|||||,...{{{((.,(({{.{{|.,,|||{,,,,,|}}}}.}}})})),,}}}}),,,.}}),..,|}|{(((((((((((.,.{,....,}..}}.))))))))))))))},}),,,)))).,,..)))))))))))))........{,,,,.....}}|||{{.....}}}},..)))))))))(((((((...)))))))..((((((((((((.((((......)))).}........{(.((((.((.....)).)))).)}.))))))},,,.,..,|||{...)))))))))})))))))))))..))))}.....}))))).)))))))))))}.,.,..((((((.((....)).)))))).......|{(({...,,,),,,}}.{((((....}}))).},,,,.))))))}..))))))}..{{.{,,.((((((((({{{{{(({{....,,}.))}}.,.,{{......}},.|||{(((((((((,....,}}}}}}}}}||||,.{((((({....})))))}||||,..})})}|,}}}.}))))))...)).},)))))).)))))))}...))).)).))){(((..{.....,,.)))}.(((.(({{......(((.(((((({..,,((((((((..((((((........)))))))))))))|{{{{{,...}}}}}},...,||{{{..,||.|(((((((((|,,,{{{....(((((({..,,|.,...||{{|..,)))}},,,..,,||,.((((,((((((....))))))...{(((.(((......))).)))))))}(((((((((.....{(((((.((...((.(((((((((((((((((((((((..((((((.(((((((((.(((((.((((((......)))))).....,{{{,,,,.((((((.......((((......))))......))))))(((......)))..}}}}}},,....(((.((((((......)))))).)))..))).)).)}.))).)))).)))))))))))).........(((((......))))).))))))))))))))))))).)))).))))......))))).))))..........}..}))))))..}))))))))))))},,..,{|||},,{({{...})))))))))))))).))).)))))))......)