Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ALAS2_0000600
Sequence Length
777 nt
GC Content
0.5611
GGUGCGAGAUUUACUCAGACGCAGGCAACCAUGCUUCCAUGAUCCAAGGUAUCCGUAACAGUGGAGCAGCCAAGUUUGUCUUCAGGCACAAUGACCCUGACCACCUAAAGAAACUUCUAGAGAAGUCUAACCCUAAGAUACCCAAAAUUGUGGCCUUUGAGACUGUCCACUCCAUGGAUGGUGCCAUCUGUCCCCUCGAGGAGUUGUGUGAUGUGUCCCACCAGUAUGGGGCCCUGACCUUCGUGGAUGAGGUCCAUGCUGUAGGACUGUAUGGGUCCCGGGGCGCUGGGAUUGGGGAGCGUGAUGGAAUUAUGCAUAAGAUUGACAUCAUCUCUGGAACUCUUGGCAAGGCCUUUGGCUGUGUGGGCGGCUACAUUGCCAGCACCCGUGACUUGGUGGACAUGGUGCGCUCCUAUGCUGCAGGCUUCAUCUUUACCACUUCUCUGCCCCCCAUGGUGCUCUCUGGAGCUCUAGAAUCUGUGCGGCUGCUCAAGGGAGAGGAGGGCCAAGCCCUGAGGCGAGCCCACCAGCGCAAUGUCAAGCACAUGCGCCAGCUACUCAUGGACAGGGGCCUUCCUGUCAUCCCCUGCCCCAGCCACAUCAUCCCCAUCCGGGUGGGCAAUGCAGCACUCAACAGCAAGCUCUGUGAUCUCCUGCUCUCCAAGCAUGGCAUCUAUGUGCAGGCCAUCAACUACCCAACUGUCCCCCGGGGUGAAGAGCUCCUGCGCUUGGCACCCUCCCCCCACCACAGCCCUCAGAUGAUGGAAGAUUUUGUGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-262.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -276.24
Frequency: 0.0000
Diversity: 210.32
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((...((((((.((((((.((((((.....((((.((((.......((...))......)))))))).....))))))..(((((.........)))))...............))).))))))))).)))(((.......((((((((((((.......((((((((.....)))))))))))))(((((..((.((((.((((((((..(((((((..(((((((((..(((.(((.....)).).))))))))))))..(((((.....))))).))))))).(((((((((.....((((((.....((((((((((...(((...((.((((......(((...)))....(((((.((((..(((.(((((((..((((((.((..(((.(((((((((((((......)).)))(((....................)))..)))))..((((....))))..........(((.(((((....((((.((((.((((...(((....)))..)))).)).(((((.(((.....))))))))((........))(((((((....))))))).))))))....))))).)))..))))))))))))))))))))).))).))))))))).(((.............))).)))))).)))..)))).))))))..))))))....))))...)))))..((((((..((((......))))..)))))).....)).))))))))))))..)))))..))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((,.,((({,,.((((((.{{{(((,....{{(|{((((.,,....((,,,|}......||||}}|}|,,..||}}|||,(((((,,...,...))))}...,....,,,.,{,||}.}})))))}}.,,,,,,.}},.,,,,..|||}||||.,,}},}{{|{||||,,,,,||||}}}},|||((,(((..{{.((((.((((((((..(((((((..(((((((((,,(((.(((.....)).).))))))))))))..(((((.....))))).))))))).(((((((((.,{..((((((.....((((((((({,{.{,{,,,,,.{(((.....,,(({.(({,....(((((.((((..(((.(((((((..((((((.((..(((.(((,{((((({((......}}.}||(((..........,,........}}}..}}}})|.{{{{,,,,|}}}.}}},,....{{(.(((((....{(((,{{((,((((,..{((.,,,|}}.,|}}}.}}.(((({,(((.....))))))))..,,..,,,,.)|{{{{{|,,,,))))})).,}))))....))))).))},,))))))))))))))))))))).))).))))))))),})}}.))),}...|},|{|.,}}})),)}),})))).))))))..)))))).},.))))...)))))..((((((..((((......))))..)))))).....)),})))))))))}),,))))),.,,,)))))))
Back