Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ANKRD11_0002300
Sequence Length
696 nt
GC Content
0.5029
GUGAGGACAGGGUAGGUGAGAAUCCCUGUGAGGUGGGAAAACAGUAAAGAACAUUUUGAAAAUAGAAUUUUCCAGGCAAGGAUUGUAACAAAAAGACCUAAGAAACGUAGUAUUUGUCCUCCUGUGUUUAUCACCCUUUCGGGGCCAAUUUUAAUAACUUCUUGUUUAAUGUUGCAAAACUAGAUUUCCUAGGAAGAUUGUUCUGAUGUAUGAGUGUGGAGCGUUGCUUAUCCUAGAAGCUUGCAUUUUAACCAGGACCCUCUUAAAGUAGCAAGUCCACAGCCAGGCGCGGUGGCUCACGGCUGUAAUCCCAGUACUUUGGGAGGCCGAGGCGGGCAGAUCACAAGGUCAGGAGUUCGAGACCAGCCUGACCAACAUGAAGAAACCCUGUCGCUACUAAAAAUACAAAAAUUAGCCAGGUGUGGCGGCGGGUGCCUGUAAUCCCAGCUACUCGGGAGGCUGAGGCAGGAGAAUUGCGUGAACCCAAUAGGUGGAGGUUGCAGUGAGCCAAGAUUGCGCCAUUGCACUCCAGCCUGGCAACAGAGCAAGACUCCGUCUCUAAAUAAAUAAAUAGUAGCGAGUCCAACUCCAGUGCGUUCAGCCCCACCCUGGGCCGGGAGGCUGCUGGGCGCUGUGGCUCUCACACACGCCGCGUCCCCUCCUUCCCCCAGAGGAGCCGUUCUUGCUCAGAAAUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-229.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -240.50
Frequency: 0.0000
Diversity: 115.61
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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