Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ANKRD11_0002400
Sequence Length
780 nt
GC Content
0.5692
AUGGGGGAAGUGGUCCAGGUGAGAAGAGCUCGUGAUACGAAGGAGAUUGUUGAAGAGGAACGGCAGCAGGCACAGCCAGUAAAGAGGAUCCACACCCCAGCUUUUGUCAGCACAGCUCAGCAAGCUUCAGCCUUUAUGAUUGUGUGGCUGCCGCAGGCCUGUGGCCCCUCCUGUCCUAUGUGGGGUGCUCCAGGGAUGUGCUCACAGUAGCCAGGUGGAGACUCUGCUGAGUGAAAGGCCAGCAGAGAGGGCUGGUUUUCCCAGAUGGGAAGUGAGGGGCAGGUGCAGUGCCAGGCACAUGGCUCCUGUCUCUGGGCCAGCACAUCUGGGGACAGGAAGGCUGCAGGGACACCAGCACAGGCCCAGGAGGACUCCUCUUCCCAGCAGCGGACAGCUCCGAGGAAGAACACUGGGAGACACGGGGAAGUGAGUGGACAGAAUGUGUGGAUGGGUUGUGUAAGGGACCUCAGCCCCCAGAAGGGAGGGCCUGGGUGACUCCCUGGAGCUCCCAGCGGUGCUGUGUACUCUCGGGCUUUAGGCCUAGAGAAAGUCAGUCCAGGCCUGAAACCCUGUGUUUGCCGUCUUUGGUCCCCAUGCUGGUUUUGGUUGUAGAAGGCCGUCAUGUUGAUACGUAGCUGUUAGCUCUUUGCACAGUGGCCAUGCGGGAGUUGGCCUCAGACCUUUGAGGUGUUUCUGUGAUGUCUCUGGAGGUGUUGCUGAAAGGGUUAAUGAGACAAGCAUCUGCUUCUGCUUCCUGGGAGAAUGAUCCCACUUGGUAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-302.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -316.03
Frequency: 0.0000
Diversity: 314.13
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((.(((.((((.(((.(((.((((((((.....((((............((((((((.(((((((..((((((...((((((.((........)).((((((((..(((...)))))).))))).....))))))..)))))).)))))))..(((((((((((((((((.((((((.((((...(((((....((.(((......)))))..)))))((((....))))..(((((((((.......))))))))))))).)))))))).)))))))...((((((((((......))))(((((((((((((........)))))))))))))..))))))((....))..)))))))).........))))))))(((((((.(((.....(((((((.......(((.((((((((((..(.(((((.((((....(((...((((..((...((((((((((((((((.....)).))).))))).)..)))))...)).)))))))...)))).))))).)....(((((((((.((.........)).))))))))).)))))))))).))))))))))))).).))))))....((((......))))((((...)))).))))......)))))))).)))..)))))))(((((((...(((((((....))))))).)))))))..((((((...((.(.((.....)).).))...))))))....))).)))(((((...(((((......)))))...))).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
,{((((,..(((((((,.{{{.{,,,,,(((,{...,||,..,,,.,{{({(,,{,,,,.|{{||{{.,(({{{|,|.,{{{{{.||,.,,,,.,))}|{(({{(({.(((,,,}||,,||}}||,.,,{{|}}}}}..,})))},))))}})}.,|((((,((((((({(,.{{{{{{,{||||.}||{||,,,.||}|||.}}},.,||||{{|||,},((((((((.((.....))))))))))...|,|,|||{|||||.,,||||||{,||||||{{{(((,(,((((......)))){{{(((((({(((,,,,,,..,}|||||||}}||,{||}|||((.,,,}}.,}}|||}}|..{{,,,..}))}||||({,{{({{,,,,,}||{|{,|||}|,...,{((,((((((((((..{.(((((.((((..,.({{...{(((,,{(...((((((((((((((((.....)).)))},)))).,..))))),..)),)))))}),,.)))).))))).|,,{.(((((((((.((.........)).))))))))}.)))))))))),)})))))).)}))}||||}}|||||,{{{{....,,))))|,,|||{.,..,)}}.}},{{{{|||||||||||||,|||||,(({(({|...((((((,....|)))))),|}))))},,||||||.},||,|.||}},,,))})})),,,)))))}.})}))))))))}})))))))))|}}}}.,)))))}}}))},})
Back