Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ANKRD11_0003400
Sequence Length
412 nt
GC Content
0.5631
AUUUUUCCAAAAGAAUCGUGAUCUCAGUGACAUAUACGUGGAAGAUGGAAAUGGAGCCCACAACUCUGCAGUGCAUCCUGAUGCCGCGCUGACCUGACGGCUUGUGCGUGUCCCUUUGGCUGCACCAGUGAGCACAGUGGCAGGCGUGUCAGAGAAAGGGCCCCUUCUGCAGACGGUCUCUCACCAUUGCCGACCACGGAAUCCCAGAACCGCUGAGCUGCCUCGGGAAGAACCAGCAGGUGUCUGCAUCGUUGAGUGUGUUCUGAUCCAAAGGAUAAAGAUAAAGUUUCUCUAACCAAGACCCCAAAACUGGAGCGUGGCGAUGGCGGGAAGGAGGUGAGGGAGCGAGCCAGCAAGCGGAAGCUGCCCUUCACCGCGGGCGCCAAUGGGGAGCAGAAGGACUCGGACACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-128.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -135.54
Frequency: 0.0000
Diversity: 124.94
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((....))))))((((.(((.(((..(((...(((.....)))...)))..((((....(((((((.(((.(((((.((((((((((......))))..(((((.(((.....))))))))..))).)))))).))...))))).)))))...)))).((((((((...((.(((((((((.((.(((.(((((......((((((((((.(((......((......)).((((....))))...))).)))).))))))((((...))))..(((.......)))....(((.(.(.(((....))).)).))))).)))))).))...))))))))).))........(((....)))((((........)))).((....))..))))))))))).)))))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((....))))))((((.(((.(((..{{{...{((,,...}}}...,}}..{{||....{(((({,,{{({{,,{,.{{{{{({{{{.,((({({((({(({{({(({,..,{||,,},,)})),}.))}),}}})))))),)))))),}..,||||.{(((((((...((.(((((((((.((.(((.((({(......((((((((((.(((,,,...((......)).{{{(,,..))))...))).)))).))))))((((...))))..{((.......}}}.,..(({.{.{.(((....))).}}.))))}.)))))).)}...))))))))).))..,..,,..||,,,,)}}||||}}}..,}}})))}||..,}}),.)))))))}))).)))))).)
Back