Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ANKRD11_0006500

Sequence Length

1137 nt

GC Content

0.5321

AAUAUAUACAGCCCUGCUCUGGGACACACCUCCAUUGGAUUUAAAAGACAGUCCUCGUCAGCACUGACUUUCAGCUAUGGAAUCGGAGUGGAAGGUCUCCCUGAGCCUGUGUCCUUUGCUGGCAGUCCCACUGCCCUCAGAGCGGCAUUCUCCCAGCAGGAUGGGCCUCAGUGCUGCCUGCAGAGCCUUCUGGUGAUGCGGAUGUUCCUCUGCUGAUUCUGUAGCAUCAUAACCAAAGAAGAAAACACUUGUUAAUGGCUUGGGAUAUGUAAGUAUGGAACAUAAACAGGUGGACUGGCACAAACCCUAAGUUUCAAAGUUGAAUGAUGAUGAAGACAGUCACCUGGCCUGAAUGAGGCAGCUCAUGCUCAGUGGUCUGUGCUGGCCCCCAGAGAAGUGCACAGCUGGAAUGUGUCCCUGCAGCACCCCCCGCCCCCGGCGCUGUGAUGGUUCUGUGUGUGCUGAGGCCAAGGAAGGCCUGUGUCACCCCGUUUCCUGCUGCUUGGGGCAGGCCCUCUGCGGGAGGAAGAAGGGGGAUGUGCUGCUGGGGUUUCCUAAGGGGUGCGCAGAGGUGGUGGUUUAGGGUAGCUGAGCAGGGUUUCAGGCUUACAGGAAGAAGUACGGGCCUAGCCAGGGUGUCUGUAAUUGGGUUGACAGGUUUCCACAAUGAGAGUAGGAGGUGCCAUUGCAGCAGGGGCUGGGGUGGGCUGAUCCUGGAGCCCAGGGCUGCCCAGGUUUGGAGUCGUUCACUGUGUGAGUUGGAUCGGAUCCAUCUGGAUGUGAGAGACAAGGAGCCUCUCACCUGAUGCAGAGCAGUGGCCAAGUCCCGACACAGGCUCAGUGCAGGGGCAAGAGACCGUGGAUUCUGUUGAGGUUUGCAGGUCUUAACCACAUGCAGAGAGGCUUCAUGCAGAGAGGCUGUGACUGACCAGGUAUCUGAUUACUUGGAUCUUUCUUGGAGGCUUAACAGGAGUUUUUAGUGAAUCGAAAUCUUUUCUUCUCCUCUUCCUCUCCAUAGCCACAUGACAGACACACACACCUGGAGUUUUGAAAGGGAGUCCACGUAUGACAGAUGAAGCUGCCUAGUGUUGACCAUCGACGUUCUAGGUUCCGAACAUACCAUGAAUUUCAUCUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-406.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -427.67

Frequency: 0.0000

Diversity: 363.36

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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