Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ANKRD11_0006600
Sequence Length
298 nt
GC Content
0.5638
GGUGUCUGUAAUUGGGUUGACAGGUUUCCACAAUGAGAGUAGGAGGUGCCAUUGCAGCAGGGGCUGGGGUGGGCUGAUCCUGGAGCCCAGGGCUGCCCAGGUUUGGAGUCGUUCACUGUGUGAGUUGGAUCGGAUCCAUCUGGAUGUGAGAGACAAGGAGCCUCUCACCUGAUGCAGAGCAGUGGCCAAGUCCCGACACAGGCUCAGUGCAGGGGCAAGAGACCGUGGAUUCUGUUGAGGUUUGCAGGUCUUAACCACAUGCAGAGAGGCUUCAUGCAGAGAGGCUGUGACUGACCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-104.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -109.50
Frequency: 0.0002
Diversity: 84.67
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((.....((((((..((((..(((((.......)).)))(((.(((((.((((....)))).))))))))...)))).)))))))))).)))(.((((...((((..((((...))))(((...(((.((((....)))).)))..)))..((((((((((..(((...))).(((((((....(((((..(((.......)))..)))))..((((((((((((((....)).)))))).))))))..)))).))).))))))))))..((((.....)))))))))))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((.....((((((..((((,((((((.......)).)))||,,(((((.((((....)))).)))))}),...)))).}))))))))).)))(.((((,{.{(((.(((,({{{{({{({(,,,({{.{|||,.,,)))),))),.)))..{{((((((((..(((...))).(((((((....(((((..(((.......)))..)))))..((((((((((({{({...,)))))))).))))))..)))).))).))))))))))}})))}.}}},)),)},},)))).)
Back