Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ANKRD11_0007500
Sequence Length
1412 nt
GC Content
0.5234
CAGAGUCUCGCUCUGUAGCCCAGGCUGGAGUGCAGUGGCGCAUUGUCGCCUCACUGCAACCUCCGCCUCCCGGGUUCAAGCAAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCCCAGUGGCUGGGAUUACCGGUGCACACCACCAUGCCCAGCUUAUUAUUUUUAUUUUUUAAUUUUCAGUAGAAAUAGGGUUUCGCCAUGUUGGCCGGGCUGGUCUCAAACUCCUGAUCUCAAAUGAUCCACCUGCCUCGGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUGACAGGCCUGAGCCACCUCGCCCAGCCGCCCUUCUCAUCCCUUUUUGGAUCGAUUGUUUACCGUGUGCUCAGGGGCUUCACUCGGAGCCCCUUAGAACCUUGCCCAGCAGAGUGGGCCCACACUGGGAAGCAGGGAUGCGUGCUCCGUCUGCCUGCCUCAGCUGUCCUCUGCCCACGACCUCUGAGCUGCAUUGCCCCGUGUAGGCCUGGUCACCUUUGGGGCCGGAACUGCACACACUCCUUCCUCCCAUAAGCCCCAGUGCUCGUGGUGGUUACGCAGCCCUGCUGCCCGUGCAGGAGAUGCCCCACGAGGCCUCCAGCUUCUUCUCUGCCUUUGCUCACUUCUCUUCCCUGGAAAGCAGGCAGGUACUCGUCAGGCUUUCCUUCAUUUAUUUCUAGAGUUUCUGCAGAUCUAGAAGCCUGUCUCCUAUUGGUUAUUGUCUUUUAACAAAGACCUGUUUGGCAUUACACAAAAAAUGCUUUCACAAGUCCCAAGGCAGCGGGCAGGUCCUGGGGCUGCUCUUCGUGCCCUGUGUCCCGUUUCUUAUGCAGGUGGAGACUGCUGGUCGUUCUCUGGAGUAGCCCCAAGGAAGCUAUCUGAAGGCUCAGGGAGCUCUAAUCCACUUAGGAGAAAAGGAGUUAAAAUGGCAUCAUUGGGCUGGGCACAGUGGCUCACACCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCCGAGGUGGGUGGAUCACCUGAGGUCAGGAGUUUGAGACCAGCUUGGCCAACAUGGAGAAACCCCAUCUCUACUAAAAAUACAGAAUUAGCCAGGCGUCGUGGCACAUGCCUGUAAUACCAACUACUCGGGGGGCAGAGACAGGAGAAUUGCUUGAACCUGUGAAGUGGGUGUUGAAGUGAGCCGAGAUCACGCCAUCGCUCUCCAGCCUGGGUGACAGAAUGAGACUCUGUCUCAAAAAGAAAAAAACAGGCAUCAUUGUUUUGCAACUGGGGUACCAGAAAUAACAUCUUUCCAUAGUGAAUUUCUGGUGGCAGAGGAGCUUCAUAUAUACCCAUUGAUACUUGGACCUGGACUGAAGCUUGAGGGGUUUGGAGAUGCAGAAAAUAGUGUUUGGUAAAUAGAGAUGAAAGUGUGUGUUUUGAGAAAUGAUGAUUGGAAAACUGAAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-675.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -691.09
Frequency: 0.0000
Diversity: 248.77
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((.(((((.(((((((((((((.((.((((((...(.(((.((((((.((((.(((((.((.(((((((((((((((((((((.(((.(((((((.(((((.(((..((((.(((.....((((.(((((..(((.(((.....(((((((........((((((.((.(((((((.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((..((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((..((((((((...((((((((((((((((..(((((...(((((..........(((((((((.(((((((((....))))))))).))......(((((......))))).))))).))((.(((((.(.(((.....))).).))))).))..((((((.(((((...(((...((((..(((((.....((((((((((((...((((((((((.....((((((.........((..((((.(((......))).)))).))....(((((...)))))..)))))).....)))))).))))...)))((((((..(((((....((((.............(((((((.(((........)))..)))))))..............))))....)))))...))))))............((((.((((......)))).)))).....))).))))))....))))).))))...)))....))))).)))))).(((((((((((((((....((((.((((((((((((....).)))))).))).)).))..)).....))))))))))).))))((((.(((((....))))).))))...)))))...))).))..))))).......))).......))))))))...))))))))..))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))..))))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))).)).)))))))))))))...))).)))..))))).)))).....))).))))..))).))))).))))))).))).))))))))))))))))))))).)).))))).)))).)))))).))).)...)))))).)).))))))))))))).))))).))))))))))(.(((............((..(((((((.........((..(.((((((((((..((.((......)))).)))))))))).)..))((((((((.......(((........)))........))))))))......(((.((((((((.(.....((.((((.....)))).)).....).)))))))).))))))))))..))......)))...)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((((.(((((.(((((((((((((.((.((((((...(.(((.((((((.((((.(((((.((.(((((((((((((((((((((.(((.(((((((.(((((.(((.,((((.((({....((((.(((((..(((.{,,.,,,.{((((((........((((((.((.(((((((.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((..((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((..((((((((...((((((((((((((((..(((((...(((((..........{{(((((((.(((((((((....))))))))).))......(((((......))))).))))).||(.,((((({{,(((.{..,|}}.|{|}|||,||{{{{((({.{{{{{...|||..,||||..||{{{.....(((((({{((((,,.(({{{|||||,,,..||||||.........,{..((((.(((......))).)))).))..,,|||{|,,,)))}),,)}}}||,,,,.|||}}|,|||},..}},(((({{..(((((....((({.............||{{|||.||{,},..,,,))}.,)))))))..........,,,,||}}....))))),,,)))))|,,{,..,{....(({{.{(((......}))).)))}.,,..|||,||}}}}....))))),}}}).,.)))....))))).)))))).(((((((((((((((....({((.((((((({,,,{....}.)))})).})).}}.)).,),.,...)))))))))))},))){(((.{((((....))))).))))...)))))...))).))..)))})....,,,|}}..,,,,.))))))))...))))))))..))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))..))))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))).)).))))))))))))).}}))}.)))..))))).))))....}))).)))),.))).))))).))))))).))).))))))))))))))))))))).)).))))).)))).)))))).))).)...)))))).)).))))))))))))).))))).))))))))))(,({,....,.......((,.(((((((,{,,,,{..((..(.((((((((((..({.{{......}))}.)))))))))).)..))((((((((..,....(((........)))...,,...))))))))......{{(.((((((((.{.....{(.((({.....)))).)).....).)))))))).)))}}}}}}}.,)}.....}},,...)
Back