Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ANKRD11_0007700

Sequence Length

1455 nt

GC Content

0.5450

GCUGGUCUUGAACUGCUGAGCUCAGGUGACCUGCCUGCCUCAGCCUCCCAGUUUCAGAUUCUUUAUCUUGCUAGAUGCUUUUGUGAAGCGCCUUCGUCAGUGGGAGGUGAGUUUGACAAGGCCCUAGCGGGUGUUUGUGAGACAGAGGUAUGACUGGAGCUUGGAGGUGGUGUUUGGGAAAGGUGGGAGUGAGGGAGGAGUCUGCACCUUUGCCCUCUGGGUGCUAUCAUGAUUGGGCUCUUGGCAUUGGGCCUUCUUGGCUUUCCGUCUGCUGCUUUGCUGGUCCGAGUGCAGGGGCUGGACGUCUGCUGCGUUGCUGGUCCGAGGGCAGGGGCUGGACGUCUGCUGCGUUGCUGGUCCGAGGGUAGGGGCUCGACGUCUGCUGCGUUGCUGGUCCGAGGGCAGGGGCUCGACGUGACACCAUGGGAGGCUCUUCGGCUUUGGCCAUUCCUGGCCGUGCUUUGUUCCAUGGGAACUUCAUGGCUCUUCCUUCUUGCAGACACAGGAGGCAGCAGCGUCCACUGGACAUGGCCCCGAGGUUUUGAAUGAGACAGAAAUGAGCCCAUCAGGGAGGGUAGAUACAGCGCCUUUCUGAACUCACAUUCUCCCAGAGUGUGGGGACAGCCAUGGCACAGAUCUCCUCGUCUUGUUCUCUCAGGAGGUCAGCGUUGGUAUGGGGCUGCUGCUGCCCCUCCAGAGCAGCCAGGCAGGCAUGGCUAGGAGGGGUUCCCUGGAAAUCCUAAUGGCAGUGCUUCUGGCAGAGCCGGUUAUCUUGAGCUUUCAGCCAGCUGAACACUUUGCUCUUGUGGCUCCUCCCUCUUCCUCCCUGAGGUGACCUCGCACCGCUCCCUUUACUCAGCAGCACAGGCGGCUGUUUGGCCUUAGGCUGUGGGUCCGCAUGAGCCAGCACACCCAGCUUUUAAAACCUAUAUUACAGUGGUGUGAAAGUUGAAUCCAGACGAGAGAGGUAUAUGACAUGGCAUAAUUGAAUAACUACCUUUAUUAAAAGUUACGCUUUACAAGCCUGGCACGGUGGCUCACGCCUGUAAUCCCAGCUCCUCGGGAGGCUGAGGCUGGAGAAUUGCUUGAACCUGGGAGGCAGAGGUUGCAGUGAGCCGAGAUCAUGCUGCUGCACUCCAGCCUGGGCAACAAGAGUGAAACUCUGUCUCAAAAAAUGGGCAAACAAAGGAAACUCUACUUUUGUUUCUUGGAUAUGAUGUCAAGGUGGUGGUUAAACGUUUAUUUCAGCUGAACACAGUUGACUCACACCUAUAAUCUCAGCACUUUGGGAGGCCGAGGCAGGAGGAUUACUUGAGCCCAGGAGUUUGAGACCAACCUGGGCAACAUAGUGAGACCCCAUCUACUGGAGGGGGGGAAUUGUUUAUUUGUCGGCCAAGUGUGGUGGCUCAGGCCUGUAAUCUCAGCACUUUGGGAGGCCGAAGUGGAUGGAUCAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-587.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -615.90

Frequency: 0.0000

Diversity: 366.71

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(.((((((((((((.(((.(((((((((((((.((((((((.(((((((((....(((((......((((((((..(((((.((.((((((((((.......))))))..)))).))))))).))))))))((((((((((((((((...(.(((((((((.(((.(((.((((.((((((((.(((((.((((((((((((.((((((.........))))))..(((((.(((((((((((.(.(((((((..(...((....((((.(((.((.(.((((.((.(((...(.(((.(((((((((((.(..((((........))))).))).))))))))))).)...))))).)).)).).)).)))..))))......))...)..))))))).).))))))))))))))))..(((.(((((.((((((((((...(((...((((((..(((((((..((((((.....))))))........(((((......)))))((((((((((((((((((...(((((((((((....(((((((((.........(((....))).(((.((((.(.(.(((...(((..((((((((((...))))))))))..)))....))).).)))))))).))))))))))))).)).)))))...)))))...)))).)))))))))....)))))))))))))..)))..)))).)))))).))))))))..........(((..((((...))))..))).........((((.(((((....)))))......))))....))))))))))))...)))))...((((......))))....))))).))))))).)))....((((....)))).(((((.(((((.((((.((.(((((......(((((((((..(((...........))).)))))))))............(((((((((((......))))..........)))))))............((((...))))))))).))))))))))))))))...))).)))))).(..(..(((.(((((((((...(((((.........))))).....((((((.(((.........)))))))))))))))))).)))..)..)))).)..))))))))).........))))))).(((((((.........))))))).((((...)))).(((((..((((((..(((((.......)))))....))))))..)))))..))))).......))))))))).))))))))))).)))))))))).))).)))))))))))).)((.(((((.(((((....((((.((....)).))))....)))))....)))))((((.(((......)))..))))....((((...((((((((....))))))))...))))..))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(,((((((((((((.(((.(((((((((((((.((((((((.(((((((((,...((((,....,,((((((((..((((((((.((((((((((.......))))))..)))).))))))).)))))))){{(((,((((((((((...{.(({((((((.(((,(((.(((,,((((((((.(((((.((((((((((((.((((((..,,,,,,.}}}}}}..{((((.(((((((((((.(.(((((((..{..{((....((((.(((.((.{.((((.((,{{{|,.(.(((.(((((((((({.(.,{(((........))))).))).)))))))}))).).,,))))).)),}).}.)).)))..))))...}},)},..}..))))))).).)))))))))))))))}..(((.(((((.((((((((((.,,(((...((((((,.(((((((..((((({|....}))))).,,..,,.,{,,|.,},..,|||,(((((((((((((,,{,{{{.(((((((((((....(((((((((.........(((....))|,(((.((((.{.(.(((...(((..((((((((((...))))))))))..)))....))).).}))))})),))))))))))))).)).)))))..}))}),..,)))).)))))))))}}}.))))))))))))).,)))|.)))).)))))).))))))))......,.,,(((,{(({{,{|||||{{|||||.....,}|,||}||,,|}}}},,)),,,},.,)))},}}.))))))))))))...))))).{,(({,.}},,,)))),},.))}}}.)}})})).)}},{{{,{||....,))),(((((.(((((.((((.{(.(((((,.....(((((((((..(((..,........))).))))))))).........,..(((((((((({..,...}},,.....,,,..)))))))....,,,{{...||||,...,)}))))).)}))))))))))))))...})).)))))),(..(..(((.(((((((((...{{({{..,,,,...}}})}.,,,,{(((((.(((.........))))))))}))))))))).)))..)..)))).}..))))))))))..,,.,,{{,{((((((((.,......)))))))))))}.({{,...}})).(((((.,((({{,..{,,,...{{{{{{|,,..}})))))}}..)))))..})))}.},,}},,)))))))).))))))))))).)))))))))).))).)))))))))))).}(({((({{.(((((....((((.(({...))}))))},..}))}}....}}}}},(((,,,,.,},}.)))}})))|{...((((...((((((((....))))))))...))))..))