Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ANKRD11_0007900
Sequence Length
1790 nt
GC Content
0.5123
GCUCUGGCACGGUCUCACUGCCACUCACGUUAGCCUUCUGUCGUCAGACGUGAAAGUGGUGCUGAGUGGGGUUUUCUUUGCAGACUGUACGUGAUGGACUGUACCUAAAGUGAAUUCGUAGUUUUGAAAUCUUUAAAGCAUUUGAGUGAAAUGUGGAAAUGCAUCAUCGUGAGUGUGUUGUGUUGGGAAUAUGGUGACUGUCUUCUUGCUCACUCAGUAGAGUUGGAGAAUUGGUAGGGAGCAGCUUGAGGCUCUGACACAGGGAUACCCACAGGGUCUCGGUGUCUCUGGCGCCCUUCCCUCUGCCCGGUGCUGGCUUGUGGACGGGCUCAGUCUGCUCUGCCAUAGAAAACCAUUUCUGUCUGCUGGGUCCGGUGGCUCACGCCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCUGAAGCGGGUGGAUCACCUGAGGUCAGGAGUUCGAGACCAGCCCGGCCAACAUGGCAAAACAGCGUCUCUACUAAAAAUACACAAAUUAGUUGGGCAUGGUGGCAGACACCUGUGCAGUGAGCUGAGACGGGCCAUUGCACUCCAGCCUGGGUGACAGAGGGAGACUCCAUCUCAAACAAACAAACAAAAAAACACCAUUUCUCAAGGCCGGGUACAGUGGCUCACGCCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGUGGAGGACCUGAGGUCAAGAGUUCAAGACCAGCCUGGCCAACAUGGUGAAAUAUCGUCUCUACUAAAAAUACAAAAAUUAGCCUGGCAUGGUGGUGUGUGCCUGUAGUUCCAGCUACUUGGGAGGCUGAGUCAGGAGAAUCACUUGAACCCAGGAGUCAGAGGUUGCAGUGAGCUGAGAUUGUGCCACUGCACUCCAGCCUGGGCGACAGAAACGUAGUCUCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAACUAUUUCUCAUUGUGUGCUCCCACACACAUGUUCUUACACACGUAUGUUCUCACCUGCAGCGGUUCUGUUGUUGGGCUGUCUAGUGGGCCUGCUUUUUCUGUAGGUGCUAAAUACAGGUUGCCAAAAAUACAGUAAGACCAAAAGGCCACCUGAUUGAGGUAAAAGGAGGGAAGAAUUGAGUUCUAUUCUUUCUGUAGUUUGUGUCUUCGCAGCUCCUUUGAAGCCGUCAGUGCCACUGCCAGUGCAGAGGCUCCUUCCUGCAGAAGCUGCCCUGCUCUGUCCUGCCCCAUCCCGUCCCGUCCCAUCCUGUCCCAUUCCCAUCCCAUCCCAUCCCAGUCCCAUCCCAUCCUGUUCCAUGUCGUCCCAUCCUGUCCCAUUUCCAUCUCGUCCCAUUCCCAUCUUGUCCUGUCCCAUUUCAUCCCAUCCCGUUCUGCUCUGCCUCAGCCCCCCACAUAGCUGGGAUUACAGCCAUGCACCACUACGCCUAGCUAAUUUUUGUAUUUUUCAUAGAGAUGGGGUUUCGCUAUGUUGGACGGGCUGGUCUCGAACUCCUGACCUCAGGUGAUCCACCCAACUCGGUCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGCGUGAGCCACCGUGCCCAGCCUUGAGAAAUGUUUGUUUUUGUUUGUUUUUGAGAUGGAGUCUCGCUCUGUCACCCAGGCUGGAGUGCAGGAGCACAUCUCAGCUCACUGCAACCUCCACCUUCUGGGUUCAAGCAACUCUCCCUGCCUCGGCCUCCUGAGUAGCUGGGAUUACAAGCGCCUGCCACCACGCCCGGCUAAUUUUUGUGUUUUUAAUAGAGACAGGGUUUUGCCAUGUUGGCCAGGCUGGUCUUGAACUGCUGAGCUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-861.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -885.68
Frequency: 0.0000
Diversity: 241.39
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.((.((((((((((.(((((((.((..((.(((((((....)))).))).))...)))))))))))).......(((.(((.(((((((((.(.....((........(((((..((((((((...))))))))...))))).......))...).))))).))))))).))).(((((((((.(((((((...(((.((..(((((..((((((((.(((.....((((..(((((((.(((((.(((...((((((..((((((.((((....((((((...))))))...)))).))...))))....))))))...)))))))).))))))))))).......))).))))).))).)))))..)).)))...)))).))).))))))))).....)))))))..)).)).))....)(((((.((((.(((((((((((((((.(((((((((((((((((...(((((((.((((((((((.(((((((((((((.(((((((((.(.(.(((((((((((((((((.(.((..(((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((..((((((((((((.....(((((((((((((.((((((.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((..(((((((((((.((((((.(((((((((((.(((((((((((((((.(((((((((..((((((((((((((((((..(((.((((((((((((.(((((((((((((((..((((.(((((((.(((((((((....((((..(((((...(((((.(((((((.((.........)))))))))...(((..((((((((((.((((..................................(((((....)))))...((((((......)))))).(..(.(((....))).)..)......((((((....))))))(((((((..((((((((((((.......))))))........(((((.(((.....................))).)))))((((((((.(((((((((((((((........))))))))......(((((....))))))))))))...))).))))).)))))).(((.((((.(((..((((.....))))..))))))).)))......................................................))).))))........)))).).))))).))))..)))........................)).)))..)))))......)))).........))))).).))).))))))).))))..))))))))))))))).)))))))))))).)))..))))))))))))))))))..))))))))).))))))))))))))).))))))))))).)))))).)))))))))))..)))))((.....)).)))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))).)))))))))))))....)))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))..)).).))))))))))))))..............(((((.....)))))((((.(((((((....)))))..)).))))..))).).).))))))))).))))))))))))).)))))))))).)))))))...))))))))))))))))).))))))))))))))).)))).)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((,((.((.(((((((.((.(((((((.((..((,(((((((....)))).))).)},,,))))))))),}........(((.(((.(((((((((.{...,.((.....{..(((((.,((((((({...}))))))).,.)))))....,..))...}.))))).))))))).))).(((((((((.(((((((...(((.,(..((({(,,((((((({.(((.....((((,.{((((((.(((({{((,.{,(((,(({,{{(({,.{|||}}},{|||||...)))|||,.,||}}.,|{,.},,,..}}),,),),,.)))))))).))))))))))).......))).))))),))),)))))..)).)))...)))).))).)))))))))...,,)))))))..)).)).)}....)(((((.((((.(((((((((((((((.(((((((((((((((((...(((((((.((((((((((.(((((((((((((.(((((((((.(.{.{{(((((((((((((((.,.((..(((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((,.,((((((((((((,{{(.(((((((((((((.((((((.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((..(((((((((((.((((((.(((((((((((.(((((((((((((((.(((((((((..((((((((((((((((((..(((.((((((((((((.(((((((((((((((..((((.(((((((.(((((((((....(({,..(((((...{((((.{((((((.((.........))))))))),..(((..((((((((({.((({..................................(((({....}))))...((((((.....,))))}}||,....||,...||,,|{........|||((({..,,|,}||,(((({(...{(((((({{((....,,,|||||,........(((((.(((.....................))).)))))((((((((.(((((((((((((((........))))))))......{((((....))))})))))))...))).))))){{{.|||{{{{.||||.|||..{{{|,,,,,)))),.))))})),}})....}},,......}..,,},.......,....................,,...}}}.,,,.........,))).,.))))).))))..)))........................},.})}..)))))......,,,,.........))))).},))).))))))).))))..))))))))))))))).)))))))))))).)))..))))))))))))))))))..))))))))).))))))))))))))).))))))))))).)))))).)))))))))))..)))))|{.....}}.}))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))).)))))))))))))..}})))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))..)).}.))))))))))))))}....,,,......))||{...{,.,,,,{(((.(((((((....)))))..)).))))..,}}.).).))))))))).))))))))))))).)))))))))).)))))))...))))))))))))))))).))))))))))))))).)))).)))))
Back