Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ANKRD11_0008100
Sequence Length
665 nt
GC Content
0.5233
GCAGGCUCUGGCACGGUCUCACUGCCACUCACGUUAGCCUUCUGUCGUCAGACGUGAAAGUGGUGCUGAGUGGGGUUUUCUUUGCAGACUGUACGUGAUGGACUGUACCUAAAGUGAAUUCGUAGUUUUGAAAUCUUUAAAGCAUUUGAGUGAAAUGUGGAAAUGCAUCAUCGUGAGUGUGUUGUGUUGGGAAUAUGGUGACUGUCUUCUUGCUCACUCAGUAGAGUUGGAGAAUUGGUAGGGAGCAGCUUGAGGCUCUGACACAGGGAUACCCACAGGGUCUCGGUGUCUCUGGCGCCCUUCCCUCUGCCCGGUGCUGGCUUGUGGACGGGCUCAGUCUGCUCUGCCAUAGAAAACCAUUUCUGUCUGCUGGGUCCGGUGGCUCACGCCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCUGAAGCGGGUGGAUCACCUGAGGUCAGGAGUUCGAGACCAGCCCGGCCAACAUGGCAAAACAGCGUCUCUACUAAAAAUACACAAAUUAGUUGGGCAUGGUGGCAGACACCUGUGCAGUGAGCUGAGACGGGCCAUUGCACUCCAGCCUGGGUGACAGAGGGAGACUCCAUCUCAAACAAACAAACAAAAAAACACCAUUUCUCAAGGCCGGGUACAGUGGCUCACGCCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-238.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -250.12
Frequency: 0.0000
Diversity: 119.21
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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