Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ANKRD11_0009300

Sequence Length

343 nt

GC Content

0.4869

GGUCUCAGUCGCUCGCCCAGGUGGAGUGCAGUGGUGCCACCCUAACUGACUGCAGCCUUGAGCUUCUGUGCGGAAGUGAUCCUCCCACCUCGGCCUCUUAAAGUUCUGGGAUUAUAGGUUUGGCCUAGAGCUCUUUCUUCUUAGAAUAUAUACAGCCCUGCUCUGGGACACACCUCCAUUGGAUUUAAAAGACAGUCCUCGUCAGCACUGACUUUCAGCUAUGGAAUCGAUGUAAUUGGGUUCCUGUAGCAAAUGGGGUAAGGGCUCUGCGUGUCUUAAUACAUCAUUGCCACCAGAAGGCCCAUUUACAACUUGCUUAGAUUUUGUUGAGAAGAAGAGGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-95.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -102.07

Frequency: 0.0000

Diversity: 95.18

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((.....(((((((((.(((((.((((((((((((.........))).))))))..))).)...)))).)))..))))))...))(.((((..(.((((((...((((((.....((((.((.((((((((...((((....)))).............)))))))).)).))))((((((((((........)))))..((((....)))).....(((((((((((.(......).)))))).))))).))))).((((((((((((.(((.(.............).)))))))..))))..))))......)))))).....)))))).)..))))..)

Thermodynamic Ensemble Prediction

(({{.,,{{{(({(({.,(((((,(((,(((((({.....,...)))}))),)).}))}},))..}}).)}}},.},)})}{|,},.{{((..(.(((({{{{,((((((.,...,{{{.||,||||||||,..{(((....|}}}.........,,,.}}}}}))).)}.||||((((((((((........)))))..((((....)))).....(((((((((((.(......).)))))).))))).)))))}||,,((((((((.(((.,.,,,,.....,,,).))))))}.,))))..,,}}..,.,.}}))}).,,,.}))))),)..)))).,)