Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ANKRD11_0011800
Sequence Length
2344 nt
GC Content
0.5482
GUGUGAACCACUGUGCCUGGCGUUAGCGUUGUGGUCUAAUAGUACUACAGUACUAUUGUUUUUUGUAAAUAGAAUUGCAGUCUGAACAGGAAGAACUUCCACCAUAGGUGUUUUGAAGAAGUUAAUUUUUUGCAUAAGUAGAAAGCCAUGGGAGCAUUAAACUUAACAGUCUAUUGCUUGUGUGGUAACGUAGGGAAUUAAUUUUGAAUUAAAUGUGAACUAGACAAUUUGCUGUGGAAUACUACGUUGAAAUUAUUGAAAAACACUUAUCCAGUGUGAGGCUUUUUUUUUUUUUAAUUUAUUUAUUUUUUAUUGAUAAUUCUUGGGUGUUUCUCAUAGAGGGGGAUUUGGCAGGGUCAUAGGACAAUAGUGGAGGGAAGGUCAGCAAAUAAACAAGUGAACAAAGGUCUCUGGUUUUCCUAGGCAGAGGACCCUGCGGCCUUCCGCAGUGUUUGUGUCCCUGGGUACUUGAGAUUAGGGAGUGGUGAUGACUCUUAACGAGUAUGCUGCCUUCAACCGUCUGUUUAACAAAGCACAUCUUGCACCGCCCUUAAUCCAUUUAACCCUGAGUGGACACAGCACAUGUUUCAGAGAGCACAGGGUUGGGGGCAAGGUCACAGAUCAACAGGAUCCCAAGGCAGAAGUUUUCUUAGUACAGAACAAAAUGAAAAGUCUCCCAUGUCUACUUCUUUCUACACAGACACGGCAACCAUCCGAUUUCUCAAUCUUUUCCCCACCUUUCCCCGCUUUCUAUUCCACAAAACCGCCACUGUCAUCAUGGCCCGUUCUCAAUGAGCUGUUGGGCACACCUCCCAGACGGGGUGGUGGCCGGGCAGAGGGGCUCCUCACUUCCCAGUAGGGGCGGCCGGGCAGAGGCGCCCCUCACCUCCCGGGCGGGGCGGCUGGCCGGGCGGGGGGGCUGACCCCCCCACCUCCCUCCCGGAUGGGGCGGCUGGCCUGGCGGGGGGCUGACCCCCCCACCUCCCUCCCGGACGGGGCGGCUGGCCUGGCGGGGGGGCUGACCCCCCCCACCUCCACCUCCCUCCCGGACGGGGCAGCUGGGCGGGGGGCUGACCCCCUCACCUCCCUCCCGGAUGGGGCGGCUGCUGGGCGGAGACGCUCCUCACUUCCCAGACGGGGUGGCUGCCGGGCGGAGGGGCUCCUCACUUCUCAGACGGGGUGGUUGCCGGGCAGAGGGUCUUCUCACUUGUCAGACGGGGUGGCCGGGCAGAGGUGCUCCUCACAUCCCAGACGGGGCGGCGGGGCAGAGGCGCUCCCCACAUCUCAGACGAUGGGCGGCCGGGCAGAGACGCUCCUCACUUCCUAGAUGUGAUGGCGGCCGGGAAGAGGUGCUCCUCACUUCCUAAGUGGGAUGGCGGCUGGGCGGAGACGCUCCUCACUUUCCAGACUGGGCAGCCAGGCAGAGGGGCUCCUCACAUCCCAGAUGAUGGGCGGCCAGGCAGAGACGCUCCUCACUUCCCAGACGGGGUGGCGGCCGGGCAGAGGUUGCAGUCUCGGCACUUUGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCUGGGAGGUGGAGGUUGUAGCGAGCCGAGAUCAUGCCACUGCACUCCAGCCUGGGCACCAUUGAGCACUGAGUGAACGAGACUCCGUCUGCAAUCCCGGCACCUCGGGAGGCCGAGGCUGGCGGAUCACUUGCGGUUAGGGGCUGGAGACCGGCCUGGCCAACACAGCGAAACCCCGUCUCCACCAAAACCAGUCAGGCGUGGCGGCGUGAGCCUGCAAUCGCAGGCACUCGGCAGGCUGAGUCAGGAGAAUCAGGCAGGGGGGUUGCAGUGAGCCGAGAUGGCAGCAGUACAGUCCAGCUUCGACUCAGCAUGAGAGGGAGACCGUGGAAAGAGAGGGAGAGGGAGACCAUGGGGAGAGGGAGAGGGAGAGAGGGAGAGGGAGAGGGGGAGAGGGAGAGGGGGAGGGAGAGGGAGCGUGACGCUUUUUUUAAAUGAAGCUCGUGACAGACGGAAGUAUACCAGUGAUUAAGAAGAUGCUGGGAUGGGCUUUUUCAAUAGAUGCUCUGCAGGUUUCCAAAAUGAGUGCCAGAGGAGGGGAGAGGGCAGUGUCAGAGUCUUCUGAACAUUCUGAGAGCUGAGCUGCUGUGAGACAGGCUUAAAUGAGAACCCUAGUUUUCAAAACUUAAUGUUUUAAUGGGAAUGACCAUAGUUAUUAGUGUUAAAAGAUACAUUUCUUCUUAUUUAUUUAGAAGAUGAAGUUCAGAGAAUUUAGGUAGCCUAAAUAAGAUGGCAUAGUUAGUAAUUCUAUGAGCUUUUCCUUGUUUAGUAAAUCGGUAUUAAAAUGGAAUUAUUAAGUGGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-911.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -956.86
Frequency: 0.0000
Diversity: 663.05
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((....))(.(((((((((.(.(((((.(((((.(((((((((((....)))))))))....((((((......))))))((((((.(((((((((((((((.(((((((((((...((((((((((((((((...........((((((.(((((.((.(((....))).)).))))).))))))...)))))))))))))))).........(((((........)))))(((((....))))).............)))))))))))...))).)))).))))))))............(((((.......)))))..((((...(((((((.....)))))))....))))(((....)))..........((((((((.(((..................((((((((.((.....)).)))).)))).)))))))))))((((((((.((((((((((((...((.((((((((.((((((...((((.....)))).((((......(((.....)))......)))).......))))))))))))))))....))))..)).))))))))))).))))))))))).))))).))))).).).))).)))))(((.....)))(((((((((.(((((((((......))).............((((((...(((.(((((((((............(..((.(((...(((((..(((((((((..((((((((((((((((.((((((....(((((((.(((....(((...((((.....))))((((.(((.((((.(((.....))).))))))).))))((((((((((((....(((......(((((((((((..((.((((((.(.((....))).)))))).)).)))(((.(((((((....))))))).)))...(((((..(((((((((((.(((((.((((((.....)))))).))(((((((.(((.((((.((.(((...((.(((((((.....))))))).)).)))))))))))).))).))))...(((((.((((((.(((.....))))))))).)))))..))).))))))).(((((....))))).......))))..))))))))))))))))..)))))))))))).......(((((((((..((((.(.((((((((((((.((((((((.......((((.((((((.((((.((.((((...((((....((((((.(........).))))))...((((......))))(((.(((((((......)))).((((.((...)).)))).))).))))))).)))).)).))))........(((((.(((((((((..((...(((.((((..(((((((((.(((....(((.(((.((((((((.((((((((...)))).)))).)))).(((......)))))))..(((((((((((((..((((((.......))))))..)))))....)))))))))))..)))...)))))))))))))))))))...)).)))))...)))).)))))........)))))).)))).......)).))))))..))))).)).)))))....(((.((((((((....)))))).)).))).........((((..(((((((...)))))))))))....).)))).))))))))).........)))....)))))))))).....((((((....)))))).(((..((.((((((((.((((.....(((.(....(((((.((........)).)))))....).)))...)))))))))))).)).)))((...)))))))))))))).....((....)).))))))))))..).))))))))..))))))))..))..)..))))))))).)))))))))..((((.((..(((((........)))))((((.....))))..........(((....(((((((.((((.((..((((((((......(.(((((..(.((........)).)..))))).)...)))))))).)).)))).)))))))...)))(((.(.(((......))).).))))).))))...(((((((....)))))))))))))..)))))...))))((((((....)))))).(((((....)))))...((((((.........)))))).((((((((.(((((((((.(((((..........))).)).)))..)))))).)))))))).((...((((((((.((.((......)).)).)))))))).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{{.,...{{,(((((((((.(.(((((.(((((.(((((((((((....))))))))|....{(((((......)))))},(((({,{(((((({(((((((.(((((((((((..,{,((((,,{(((((((....}}}}}},((((((.(((((.((.(((....))).)).))))).)))))){{{||||,,,,||||||||.,,,|,|,{((.......}}},}}},.,||||....))))))}..}}}}.,}..)))))))))))...))).)))).))))))),.......,{{{{{,{{{,{{{{,{({{...,((((...(((((((.....)))))))....)))))}}}}}})).}}}})}}}}.((((((((.(((..................((((((((.((.....)).))))}}))).))))))))))){({(((({{((((((((((((,..((.((((((((.((((((...((((.....)))).((((......(((.....))}......)))).,.....))))))))))))))))..,.))))..)).))))))))))).)))}})))))).))))).))))).).),})).))))}.....,,,|}}(((({(({(.{{{((((({......,,,.......,.....|(((((.{.({(,((((({(((.,,,.....{{,,..{{.(((..{(((((..((((((((({.(((((((((.((((((.(((({(....(({((,(({((..,,((({,{{(((.....)})}((((.(((.((((,(((....,))).))))))).))))((((((((((((.{.,(((....}}||{{((({(((..((.((((((.,.{{..,,|||.||||}|,||,|||(((.(((((((....))))))).))}{{{,{{{{..,||||||||||}||{((.((((((.....)))))).)),|||,|(|(|,.{(((.((.|((..,((.(((((((.....))))))).}}.}}}}}|})}}})})},,))}|,{,{((((.((((((.{{,,}}}}))})))))).})))).,)))|}))}|||.(((((....)))}),.,....}}}}..}))))})))))))})),,)))))))))))).,,,,,,,((((((((|||((((((((((((((((((.((((((({....,,,((((.((((((.(,(((((.{{,{...{(((....)))}.((.(((((......))))))).((((......))))(((.(((((((......)))),((((.{{...)).)))).))).)))(((({((((....))))..))))}.(((((.(((((((((.{((...(((.((((.,(((((((((.(({,.{.(((.(((.(((((((,.(((.{{{(,,,,,,}.)))}.,}},.,||.}}}..))))))).,(((((((((((((..((((((.......))))))..)))))....)))))))))))..))).,.)))))))))))))))))))...)).)))))...)))).)))))))})),,.)))))).)))).,}}...,,.))))))..))))),)).))))}...,}||}||((((((....)))))),||{|||....,||||((({..(((((((...)))))))})))..,,|.}|||.})))))))|{{,,.....||,.{{{,|{.}},}|)}.}},((((((....)))))).|{|,.{{.((((((((.{{{{.....|{{.||||.,||({.{{,.(((....,))).)).}),,.,))).})))))))))))).)),)}}|}...}})))))},)))))}},,.||,.,.)),)))}))}))),.).)))))))),,)))}))))},)))))))))),}))})))))))}||{||{{{||,,.,|||||,,,.....}}|||{|||,..||},}},}}},..,,{({{.{,.(((((((.((((.((..((((((((......(.(((((({,.{(,,......}}.))}))))).)...)))))))).)).)))).))))))).,.}}}|||}{.{||,...|,})),}.}}}},})))}...{((((((....)))))))||||,,..})))),.,||}}|{{{{|....))))},.(((({....}}})),,.((((((.,.......)))))).((((((((.(((((((((.(((((..........))).)).))),.}))))).)))))))),}|}},|(((((((.((.((......)).)).)))))))))))}
Back