Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ANKRD11_0012300
Sequence Length
615 nt
GC Content
0.4309
GUUGCAGUGAGCCAAGAUUGCGCUACAGCACUCUAGCCUGGGCGACAGAGUGAGACUCCAUCUCAAAAGAAAAAAAAGAGUGGAUAUCACAGGCUUAUUUCUUUUUUUUCCUCUUUUUUUUUUUGAAACAGAGCCUCGCCCUGUGGCCCAAGCUGAAGUGCAGUGCAGUGGUGGCUCACUGCAGGCUCUGACACAGGCUUAUUUCUGAUGGUAAUUGAAAAGUGUCCACUUUUUCACCAUUAACCAUGAUGUUUGCUGUGGGAUUUCAUAAAGGCACUUUAUGAGGUUGAGGAAGUUCCCUUCUAUUACAAGUUUGCUAAGUAUCAGGAAUGGACAUUGAAUUUUAUAGUUUUCUUUUACAUUUAUUUAUCAUUUGGUUUUGUUUUUUGAACGUUUAACCAAUCAUGUAUUCCUGGGUUAAACCCACUUGGUGACAGUGUAUCAUUCUUCCUGUAGGAUACAUUGGCUGGCAGGGUGUCAGCUGAGCCCUGUACGUUUCAACAUCCAGCAGGCUGGCCAUUGGGGCUGCCAAGAACAGUAGGGCAGCAGAAGCAGGGGCCACAUGGCUUCACUUUUGCUUCGUCCUUCUUUUUUUUUGAGAUAGCGUCUUACUCU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-207.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -219.14
Frequency: 0.0000
Diversity: 91.05
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((((((((((..((((((((...(((((.((((.(((((.((((.(((((.(((....((((..((((((((((((.(((......(((......))).....)))))))))))))))))))....))).))))).)))).))))).)))).)))))))))))))..))))))))))))).....((...((((((((((((((((((....(((((((....))))))).))))))).(((((........)))))((((((((((((...))))))))))))..(((((....))))).........(((((((((...((((((..((((.((........((........)).............((((((.(((((...)))))...))))))))))))))))))((((...)))))))))))))(((((((((...(.....)...)))))))))(((((((((((.((....)))))))).............))))).(((.((((.....)))))))(((((.((.(((((((((((((..((((((....)))))).))))))))..))))).)).)))))..))))))).))))...)).
Thermodynamic Ensemble Prediction
,(((((((((((((..((((((((...(((((.((((.(((((.((((.(((((.(((....((((((((((((((((((.(((......(({......})).....)))))))))))))))))))....))).))))).)))).))))).)))).)))))))))))))..))))))))))))},},((.((((((((((((...(((((((....(((((((....))))))),)))))))...}))).))}}).))),)||((((((((((...))))))))))},,,(((((....))))}.........{((((((((..,(((((({.{{{,{(({,.....,{|...,....,,.............((((((.(((((...)))))...)))))),,})})))))))|(({...}))))))))))))(((((((((...(.....)...)))))))))(((((((((((.{(....)))))))).............))))).(((.((((.....)))))))(((((.((.(((((((((((((..((((((....)))))).))))))))..))))).)).))))}.{((({{...)))))}....
Back