Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ANKRD12_0000300
Sequence Length
784 nt
GC Content
0.4018
GCAGUUCCCGUCAUCGUUUUUCAAGUACCCACUUGUGAUGCUUCAAGACCCCUGGAGCACGUCAGGUUCUUAGAUCUCGUUUUGAGGAGUGAUGUGGAGUGACGCAUCCUUACAGAUCCCAAAGCGUUGAAUAAACGGUUGUACAAAGAGAUCCAGGAUGAGAAGACUGAUAAAAGAAGAAGCUAGCUGAACAGCUGUAAAAUGCCCAAAUCUGGGUUCACAAAACCAAUUCAGAGUGAAAAUUCUGACAGUGACAGCAAUAUGGUAGAGAAACCAUAUGGAAGAAAGAGUAAAGACAAGAUUGCAUCCUACAGCAAAACUCCAAAAAUUGAACGAAGUGAUGUGAGCAAGGAGAUGAAAGAGAAAUCAUCCAUGAAACGUAAACUUCCUUUUACUAUUAGCCCAUCAAGAAAUGAAGAACGAGAUUCAGACACAGAGAAAGAAGGUCCAGAAAAGAAGAAGACAAAAAAGGAAGCUGGAAAUAAGAAAUCCACACCAGUUAGCAUUCUUUUUGGUUAUCCACUCUCUGAGCGAAAACAGAUGGCACUUCUUAUGCAGAUGACAGCAAGAGACAACAGUCCAGAUUCCACACCAAAUCAUCCAUCACAAACAACGCCUGCCCAAAAGAAAACUCCCAGUUCUUCAUCUCGACAGAAAGAUAAAGUUAAUAAAAGAAAUGAACGUGGUGAAACUCCUUUACACAUGGCUGCUAUUCGAGGAGAUGUGAAACAAGUUAAAGAAUUAAUAAGUUUAGGGGCAAAUGUGAAUGUGAAAGAUUUUGCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-161.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -175.70
Frequency: 0.0000
Diversity: 205.60
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((...(((.((((((((((.......(((((((.(((((((.......))))))))).)))))((((.((((((..((((..(((.((((((......))))))))).)))).....((.((((.....)))).)).......)))))).))))(((...(.((((((..(((((......((((....(((((.....(((((....)))))..............((((((....)))))))))))..)))).(((((((......)))))))........((((..........((((........)))).))))............(((((.((((...((.((((((.........))).))).))..))))..))))))))))..)))))))...))).....)))))))))))))...))).((((((........(((((((.((((..(((......(((..((.......))...)))......)))..).))))))))))........)))))).(((((......(((.(((((((.(((........))).))))....))))))((((........))))(((..(((((....(((..(((((......(((((...(((((((((((((....(((......(((................(((((((((.....))))).)))))))....)))...))))))............)))))))....)))))..)))))..)))...)))))..))))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
{..{{,.,.(((.((((((((((.......((((({(.(((((((.{....})))))))}}.))))}((((.((((((({((((.{(((.((((((......)))))))}}.},,,,},}}||,|(((.....)))}.}),......)))))).)))}{{{,..{.{(((({..(((((..,,,,((((....(((({.....(((((....))))).............{((((((....))))))),,}}..}})).(((((((......))))))),,.......,{{..........{(((........))}}..,|,{,.....,,...(((((.((((...((.((((((.........})).))).))..))))..)))))}))))..)}))}},,..}},.....})))))))))}}),,.},}.((((({..,...,.((({{{{{(({{..{{{......{{{,{{({{..........}}}...,}})))..).)))))))))),,.}}...)))))).{{|||,...,,|||.{{{((({.(((........))).})}|....})))),((((........)))){((..(((((..,.(((..(((((....,.,,{{(...{{{(({{((((((....{,,.,.....,,.............,..|{{||{{{(.....}))}}.}|}}.||.||.,}}.,,)))))),,{{{,..{{{,|,,,,)),,,.,))))..)))))..))),..)))))..)))))))).}
Back