Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ANKRD12_0004700

Sequence Length

1266 nt

GC Content

0.3894

AUCCAGGAUGAGAAGACUGAUAAAAGAAGAAGCUAGCUGAACAGCUGUAAAAUGCCCAAAUCUGGGUUCACAAAACCAAUUCAGAGUGAAAAUUCUGACAGUGACAGCAAUAUGGUAGAGAAACCAUAUGGAAGAAAGAGUAAAGACAAGAUUGCAUCCUACAGCAAAACUCCAAAAAUUGAACGAAGUGAUGUGAGCAAGGAGAUGAAAGAGAAAUCAUCCAUGAAACGUAAACUUCCUUUUACUAUUAGCCCAUCAAGAAAUGAAGAACGAGAUUCAGACACAGAUUCAGAUCCAGGACAUACAAGUGAAAAUUGGGGGGAGAGACUUAUAUCUUCUUACAGGACAUACUCAGAGAAAGAAGGUCCAGAAAAGAAGAAGACAAAAAAGGAAGCUGGAAAUAAGAAAUCCACACCAGUUAGCAUUCUUUUUGGUUAUCCACUCUCUGAGCGAAAACAGAUGGCACUUCUUAUGCAGAUGACAGCAAGAGACAACAGUCCAGAUUCCACACCAAAUCAUCCAUCACAAACAACGCCUGCCCAAAAGAAAACUCCCAGUUCUUCAUCUCGACAGAAAGAUAAAGUUAAUAAAAGAAAUGAACGUGGUGAAACUCCUUUACACAUGGCUGCUAUUCGAGGAGAUGUGAAACAAGUUAAAGAAUUAAUAAGUUUAGGGGCAAAUGUGAAUGUGAAAGAUUUUGCAGGUUGGACACCACUGCAUGAAGCUUGCAAUGUUGGAUAUUACGAUGUUGCUAAGAUACUUAUAGCAGCUGGAGCAGAUGUUAACACACAAGGAUUAGAUGAUGACACUCCACUCCAUGAUUCUGCUAGUAGUGGGCACAGAGAUAUAGUAAAGCUGUUACUUCGUCACGGUGGAAAUCCAUUUCAAGCUAAUAAACAUGGGGAGCGUCCAGUGGAUGUAGCAGAAACAGAGGAGUUGGAGUUGCUACUAAAAAGAGAGGUGCCUUUAUCUGAUGAUGAUGAAAGUUACACAGGAUCCAGCUACCAAUUUGCAGGAAAUGCCAAGCUCAGCGGAGCAAGUUGAACUAUACCAAGUGUAUGCAAUCAGCAAAUUCCAGAUUGUGAGAAAGCCAAACAGCCUUGGUUCUUUAACAGAUAUUUUGUGUGGAAAAGAAACAGAAGAAGACCAUGUAGAAAAAAAUAAAAAUGAUUUAAAAGGCUCAUCAGACUUUAAUGGGCAAGACUGAGAAAUAUGUGUUUAAUAGUUGAUUUAUUCUUCUCUGGGAAAAUCUUAUAGAAAACUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-274.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -301.38

Frequency: 0.0000

Diversity: 344.03

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(...((((((((..(((((.((((.((((((((((((((....((((((..((((...(((((.((((.....))))...(((((((....)))))))..((....)).(((((((......)))))))...................)))))))))..))))))....(((((...(((......)))..)).)))((.((((((.........))).))).)).........(((((((((....((..((((((......((((........))))......)))......((((..(((....)))....)))))))..))........(((((((...((((...((.......))...))))....)))))))......))))))))).((((.........))))...)))))))).))))))((((((.(((((..((((............(((((.((((..(((((((...(((....(((....))).....((((.(((..(..(((..(((((....(((..(((((......(((((...(((((((((((((....(((......(((................(((((((((.....))))).)))))))....)))...))))))............)))))))....)))))..)))))..)))...)))))..)))..)...)))))))..(((((((((((..((((((((((((.......))))))))).)))....)))).)))).)))(((....))).........(((((...((.((((((((((((((.((.((((((((.((.(((((.....(((..(((((.....)))))..)))..(((((....)))))....(((.............)))))))).))....)))))))).))..)))).)))))).((.(((.........))))).((((((.......)))))).))))))...))))).)))....))))))))))).))))).((((....))))..(((((..(((((.....)))))...)))))......))))..))).)).))))))..(((((((..(((((..((.(((...))).))..)))))..)..........(((................)))......))))))..((((.(((........))).))))..........)))).)))))..))))))))..)(((((....(((...)))...)))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(...((((((((..(((((.({{{{((((((((((((((....((((((..{{((,,,{{{{|||||{.....,}}}...(((((((....)))))))..,|....,|.(((((((......)))))))..........,,.....,.,}})}))})..))))))....{({({...,{{....,,|||.,||{,,,((.((((((,,.......})),))).))..,,,,...|((((((((.,,..,..{((,{{......((((........)))}......},|,,...,{{{{..{{{....)))....))))}}}|,,,........(((((((.,.((((...{(,......,)...)))).,..}))))))......}}}))))}}.((((.........)))}...)))))))).))))))}|(({{.{||{{..((((,,..........((({(,(((({.(((,,,,....||}.|,|{{....)))}...{((((,((,{{{{.(((..(((((..,.(((..(((((....,.,,{{(...{{{(({{((((((....{{,.,.....,,.............,..|{{||{{{(.....}))}}.}|}}.||.||.,}}.,,)))))),,|{{,..{{{,|,,,,)),,,.,))))..)))))..))),..)))))..}}},{{{{{||||||,..,.,{{(({{{(..((((((((((((.......))))))))).)))....))}).))||(((((.,...((({(((.{{,....(((((((((.{.,((((((((((.((.((((((((.,{,(((((,{.,.({{..((({{..,,.)))))..))).,,|||{...,))))}....{{{........,,,,.,}||}))).}),}},)))))))).))..)))),}))))).{(,.((......,,.)}}},}.)))))))))..},.))...))))})},.,.))))))).})})))))))))),.}}}},.((((....))))..(((((..{((((...,,)))}}...)))))......}}}}.,))}.}}.}}||||..,,,{|||}||{|||.,|{,|||.,,})),)),,)}}},..},...,,,,.,|||.,...............,..,,,...,,||{({(,{{.,,{..,}}}}},}}.})}},........,)))}.)))))..))))))))..)(((((....(({...}))...)))))