Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ANKRD12_0005100
Sequence Length
988 nt
GC Content
0.3978
GAUGAGAAGACUGAUAAAAGAAGAAGCUAGCUGAACAGCUGUAAAAUGCCCAAAUCUGGGUUCACAAAACCAAUUCAGAGUGAAAAUUCUGACAGUGACAGCAAUAUGGUAGAGAAACCAUAUGGAAGAAAGAGUAAAGACAAGAUUGCAUCCUACAGCAAAACUCCAAAAAUUGAACGAAGUGAUGUGAGCAAGGAGAUGAAAGAGAAAUCAUCCAUGAAACGUAAACUUCCUUUUACUAUUAGCCCAUCAAGAAAUGAAGAACGAGAUUCAGACACAGAUUCAGAUCCAGGACAUACAAGUGAAAAUUGGGGGGAGAGACUUAUAUCUUCUUACAGGACAUACUCAGAGAAAGAAGGUCCAGAAAAGAAGAAGACAAAAAAGGAAGCUGGAAAUAAGAAAUCCACACCAGUUAGCAUUCUUUUUGGUUAUCCACUCUCUGAGCGAAAACAGAUGGCACUUCUUAUGCAGAUGACAGCAAGAGACAACAGUCCAGAUUCCACACCAAAUCAUCCAUCACAAACAACGCCUGCCCAAAAGAAAACUCCCAGUUCUUCAUCUCGACAGAAAGAUAAAGUUAAUAAAAGAAAUGAACGUGGUGAAACUCCUUUACACAUGGCUGCUAUUCGAGGAGAUGUGAAACAAGUUAAAGAAUUAAUAAGUUUAGGGGCAAAUGUGAAUGUGAAAGAUUUUGCAGGUUGGACACCACUGCAUGAAGCUUGCAAUGUUGGAUAUUACGAUGUUGCUAAGAUACUUAUAGCAGCUGGAGCAGAUGUUAACACACAAGGAUUAGAUGAUGACACUCCACUCCAUGAUUCUGCUAGUAGUGGGCACAGAGAUAUAGUAAAGCUGUUACUUCGUCACGGUGGAAAUCCAUUUCAAGCUAAUAAACAUGGGGAGCGUCCAGUGGAUGUAGCAGAAACAGAGGAGUUGGAGUUGCUACUAAAAAGAGAGGUGCCUUUAUCUGAUGAUGAUGAAAGUUACACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-217.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -237.73
Frequency: 0.0000
Diversity: 208.45
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((......(((((((((((((((((((((....((((((..((((...(((((.((((.....))))...(((((((....)))))))..((....)).(((((((......)))))))...................)))))))))..))))))....(((((...(((......)))..)).)))((.((((((.........))).))).)).........(((((((((....((..((((((......((((........))))......)))......((((..(((....)))....)))))))..))........(((((((...((((...((.......))...))))....)))))))......))))))))).((((.........))))...)))))))).))))))))..))))).....((((........)))).((((((((((.(((........)))...(((....))).....((((.(((..(..(((..(((((....(((..(((((......(((((...(((((((((((((....(((......(((................(((((((((.....))))).)))))))....)))...))))))............)))))))....)))))..)))))..)))...)))))..)))..)...)))))))..(((((((((((..((((((((((((.......))))))))).)))....)))).)))).)))((((...((((.(((..........).)).))))((((((((((.((.((((((((.((.(((((.....(((..(((((.....)))))..)))..(((((....)))))....(((.............)))))))).))....)))))))).))..)))).))))))))))........))))))))))))))))(..((.((((....))))))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((..{,.,((({,((((((((((((((((....((((((..((((...{{{{{|||{{.....,}}}...(((((((....)))))))..,|....,|.(((((((......)))))))..........,,.....,.}}}))))))..))))))....(((({...,{{......}}}.,||,}}}((.((((((,,.......})),))).))..,,,,...(((((((((.....,..(((,{(......((((........)))}......}}},,...,{{{{..{{{....)))....))))))}}..,........(((((((...((((...{(,......,)...))))....)))))))......})))))))).((((.........))))...)))))))).)))))))).,))))),..},{(((........)))}.((((((((((.(((........))).,.(((....)))|....((((.(((.,{..(((..(((((..,.(((..(((((....,.,,{{(...{{{(({{((((((....{{,.,.....,,.............,..|{{||{{{(.....}))}}.}|}}.||.||.,}}.,,)))))),,|{{,..{{{,|,,,,)),,,.,))))..)))))..))),..)))))..))).,}...)))))))..(((((((((((.,((((((((((((.......))))))))).)))....)))).)))).)))((({..,((({.{{,..........}.}}.))}}|(((((((((.((.((((((((.,{,(((((,{.,.({{..((({{..,,.)))))..))).,,|||{...,))))}....{{{........,,,,.,}||})}).}),}},)))))))).))..))))}})))))))))........))))))))))})))))(..((.((((....))))))..)
Back