Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ANKRD12_0014000
Sequence Length
2741 nt
GC Content
0.3827
ACCUAGAAAUAGAACAGUGGCACAAAAAACAUAAGGAAAAAAUUAAGCAAAAAGAAAAGGAACGGUUGAGAAACCGAAACUGUUUAGAACUUAAAAUAAAAGAUAAAGAAAAAACAAAGCAUACACCAACUGAAUCCAAAAAUAAAGAACUUACUAGGUCAAAGAGUUCAGAAGUGACUGAUGCAUAUACCAAGGAGAAACAACCUAAAGAUGCUGUAAGUAACAGAUCACAAUCUGUUGACACCAAAAAUGUAAUGACUUUAGGGAAGUCAUCUUUUGUUUCAGAUAAUAGCUUAAACAGGUCUCCUAGAUCAGAAAAUGAAAAGCCGGGUCUCAGCUCCAGAUCUGUAUCCAUGAUUUCUGUUGCUAGUUCAGAAGAUUCCUGCCAUACUACAGUGACAACCCCAAGGCCUCCAGUUGAGUAUGACUCUGACUUUAUGUUAGAGAGUUCAGAAUCCCAAAUGUCCUUUUCCCAGUCACCUUUUUUGUCAAUUGCCAAAUCUCCUGCUCUUCAUGAAAGGGAAUUGGACAGCCUGGCUGACUUGCCGGAGCGGAUUAAACCACCAUAUGCAAACAGACUUUCAACAUCCCAUCUUAGGUCAUCUUCUGUAGAAGAUGUUAAACUAAUUAUAAGCGAGGGGAGACCUACCAUAGAAGUUCGAAGAUGUAGCAUGCCUUCUGUCAUUUGUGAACAUACCAAACAAUUCCAAACAAUAUCAGAAGAGAGCAAUCAAGGUAGCUUAUUAACUGUGCCAGGAGAUACUAGUCCUUCUCCCAAACCUGAGGUAUUCUCAAAUGUGCCUGAAAGAGACCUUUCAAAUGUAUCUAACAUACAUUCCAGUUUUGCAACUUCUCCAACUGGAGCUUCAAACAGCAAGUAUGUUUCAGCUGAUAGAAAUCUCAUCAAGAAUACUGCCCCAGUGAACACUGUAAUGGACAGUCCAGUGCAUUUAGAGCCAUCUAGUCAGGUUGGUGUGAUCCAGAAUAAAUCAUGGGAGAUGCCUGUUGAUAGACUAGAGACAUUAAGCACCAGAGACUUUAUCUGCCCAAAUUCUAACAUACCUGAUCAAGAAUCCUCUCUUCAGAGUUUUUGUAAUUCUGAAAAUAAGGUAUUGAAAGAAAAUGCUGAUUUUUUAUCCCUGCGCCAGACUGAACUGCCAGGAAACUCUUGUGCUCAGGAUCCGGCAUCCUUUAUGCCUCCACAGCAGCCUUGCUCUUUCCCCAGCCAAUCACUUUCAGAUGCUGAAUCGAUUUCUAAACAUAUGUCUUUGUCAUAUGUUGCUAAUCAAGAGCCAGGUAUUUUACAACAAAAAAAUGCAGUUCAGAUUAUUAGUUCUGCUUUAGAUACUGAUAAUGAAUCUACAAAAGAUACAGAAAAUACUUUUGUCCUAGGAGAUGUUCAAAAAACAGAUGCCUUUGUCCCAGUGUACUCUGACAGCACUAUUCAAGAAGCAUCACCAAACUUUGAGAAAGCUUAUACUUUACCUGUGUUACCAUCAGAAAAGGACUUUAAUGGAAGUGAUGCCUCUACCCAGCUAAAUACACAUUAUGCAUUUAGCAAACUAACUUACAAGUCUUCCAGUGGCCAUGAAGUUGAGAAUAGCACAACUGAUACUCAGGUCAUUUCACAUGAAAAAGAAAACAAACUGGAGAGUUUGGUUUUAACUCAUUUGAGUAGGUGUGAUUCUGAUUUAUGUGAAAUGAAUGCAGGGAUGCCAAAAGGAAACCUAAAUGAACAAGAUCCAAAACAUUGUCCUGAAAGUGAAAAGUGUUUGCUUUCCAUAGAAGAUGAGGAAUCUCAACAAAGCAUUUUAUCAAGUCUGGAAAACCAUUCACAGCAGUCAACUCAACCAGAAAUGCAUAAAUAUGGUCAGUUAGUUAAAGUAGAAUUAGAAGAAAAUGCCGAAGAUGAUAAAACUGAAAACCAAAUCCCUCAAAGAAUGACUAGAAACAAAGCAAAUACAAUGGCAAAUCAAAGCAAACAGAUUCUUGCUAGCUGUACACUAUUAUCAGAAAAAGACAGUGAAUCCUCAUCUCCUAGAGGAAGAAUAAGAUUAACUGAAGAUGACGAUCCUCAAAUUCACCAUCCACGGAAAAGGAAAGUGUCACGUGUACCUCAGCCUGUGCAAGUGAGUCCCUCUUUACUACAAGCAAAAGAGAAAACUCAGCAAUCUCUGGCAGCCAUUGUAGAUUCUCUAAAACUAGAUGAGAUUCAGCCAUACAGUUCAGAGAGAGCAAAUCCAUAUUUUGAAUACUUGCACAUAAGGAAAAAAAUAGAAGAAAAACGCAAAUUACUGUGUAGUGUGAUUCCUCAAGCACCUCAGUACUAUGACGAAUAUGUAACAUUUAACGGAUCAUAUCUCCUGGAUGGAAACCCCUUAAGCAAGAUUUGUAUUCCCACAAUUACACCACCACCUUCACUGUCAGAUCCACUUAAAGAGCUUUUUCGACAACAGGAAGUUGUAAGGAUGAAACUACGUUUGCAACACAGUAUUGAAAGGGAAAAACUCAUUGUAUCCAACGAACAAGAAGUUUUGCGAGUUCAUUACAGAGCUGCAAGAACAUUGGCAAAUCAAACACUGCCAUUUAGUGCUUGUACUGUUUUGCUGGAUGCCGAAGUAUACAAUGUACCAUUGGACUCUCAGUCUGAUGACAGUAAAACUUCUGUGAGGGAUCGCUUUAAUGCAAGACAAUUCAUGUCUUGGUUACAAGAUGUGGAUGAUAAAUUUGACAAAUUAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-628.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -679.02
Frequency: 0.0000
Diversity: 499.95
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((....))).....(((((((.............................((((((((.(((((....)))))..........(((((............................(((((..((((((..............((((((...........))))))((((((.(..(((((........((((((.....(((......(((((...((((((((....))))))))..............((((((((...))))))))...............)))))......)))))))))...(((.....)))......((((((.......)))))))))))..).))))))(((((((((.....((....)).....)))..))))))..((....))....)))))).))))).(((((((.....)))))))))))).............))))))))..(((.(((((..((((....((((((.((.(((..((.....)).))))).)))).))(((((((......))))).))((......))....(((((..(((..((((.(((.((......((((((.((((((((..(.(((.........))).)..)).)))))))))))).....)).))).)))).))).))))).((((((....((((.....................))))...))))))...))))..))))).))).......)))))))(((((..........)))))........((((((........))))))(((((....))))).(((((((.....))))))).((((((((((.(((((((....)))(((......)))..((((.((((.((.((((((..((((.........((((.((((((....))))....)).))))...((((..((((.(.(.(((((((..((((((((..((((((.....)).))))..)))))....))).)))))))).).))))))))..)))).)))))).))...(((((((....((((((((((((.((((((((((((((((.....))))))((((((..((((((.......)))))).))))))((((((((((.....((((((((((((((...)))))((((..(((...(((((.....))))))))..))))((((.((((((....((((..(((.......)))))))....((((....((((((((.......))))))))...)))))))))).))))..................)))))))))(((((((((((((...)))).)))))))))..((((.....)))).((((..(((((...(.(..(((...((((.....))))....)))..).)..)))))..))))......((((((.(((.(((((((..(((...(..((((......))))..)...))).((((.(((.......))).))))..))))))).))).....(((((((.((.....)).)))))))....((((((....(((.......)))....)))))).)))))).....((((...)))).((((((((((((((..((((.(((.(((.(((((((.......)))))..)).)))...)))..))))..)))))))))))))).)))))))))).....((((........((.........))........))))(((((((((.....)))))))))....))))).))))).))).......(((((((....(((((((((.....))).)))......)))......))))))).......)))))))...)).....)))))))....)))))))).)))).)).))))))))........((((((((.((((.........((((.(((.....(((((((............(((.(((((((.((((.(..................((((((((((((((........)))))..............((((..(((......)))..))))(((((((.(((...(..((((((.((((((.(.(((.(((((((((((((((..((((((..........))))))...)))).((..(((((((.....((((((((.((((...........)))).)).....)))))))))))))..)).................))))))))...))).................(((((......))))).((((..........))))..........))).).)))))).))))))..)..........))))))))))......(((....)))...((((..........))))........)))))))))...(((.......(((....))).......))).((((((..((((......))))))))))...(((.((((...(.((((((..((((.((....))))))..)))))).)...)))).)))).)))))))))))..))).............)))))))...)))))))...(((((((((.........(((((...)))))(((((((((...))))))))).))))))))))))).))))))))..((((((((((((...((((((((((((....))))))))))))......)))).))..))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((....))).....(((((((...................,.........((((((((.(((((....)))))....,{{{{.({{((............................(((((..((((((...,,.........((((((...........)))))){(((((.(..(((((,.......(((((,....,(((......(((((..,((((((((....)))))))},}.........,..((((((((...)))))))).,,|||,,..,}...)))))......))))))))).|,{({.....||}......{(({{{...,...}))))))))))..}.))))))|{{{{{{{{.,,,.,{....)),....}}}..})))))..,,....))....)))))).))))).(((((((.....)))))))})))).,,..........))))))))..(((.(((((..((((,...{(((((.{,,(((..((.....)).})))).)))).)}(((((((......))))).))((......))....(((((..(((..((((.(((.((......((((((.((((((((..,.{{{,........))}.,..)).)))))))))))).....)).))).)))).))).))))).((((((....((((.....................))))...)))))).}.})))..))))).))).......)))))))(((((..........)))))......,,((((((........)))))}(((((....))))).(((((((.....))))))).((((((((((.((((,{(..,,|||(((..,,,{|,,..,,.|}}||,,|||((({({..,|||,}},.,...((((,,,||||....||||....||,))))...((((..((((.{...(((((((..{{{(((((..((((({.....}}.))))..)))))....}}}.))))))),.).)))})))){{||,,.,,,,))})....{(((((({{.{(,((((((((((.((((((((((((((((.....))))))|(((({..((((((.......)))))).}))))}{((((((((,.....((((((((((((((...)))))((((..(((...(((((.....))))))))..))))((((.((((((....((((..(((.......)))))))....((((....((((((((.,...,.))))))))...)))))))))).)))),{{{{........}},,,)))))))))(((((((((((((...}))).)))))))))..{(((.....}}}}.{(((..{{{||}}}|,,..(((,..((((.....))))..}.))).,|,|..||}}}..})))...|..((((((.(((.(((((((....,,,{{{,,{{{,,,,..{|||..{{{{|,...||,}||..,}},.,}}}.,}}},,))))))).))).....(((((((.((.....)).)))))))....((((((.,,.(((.......)))..,,)))))).))))))..,..((((...)))).((((((((((((((..((((.(((.(((.({(((((.......)))))..}).)))...)))..))))..)))))))))))))).,))))))))}.,...{({,..,,,....{.,,,,...........}}})}},(((((((((.....)))))))))....))))).))))).))).......(((((((.,...,(((((,......,,}.},,..,...,,,...},}))))))).......))))))).},)}.....))))))).,.......,,..)))).)).))))))))........((((((((.((((.........,{,,{(({..{{.{{(((((..,,..,,,,,,(((.(((((((.((((.{..................((((((((((((((........)))))..............((({,,({,..,,,.)))..}}},(((((((.(((...{..((((((.((((((.{.({,.{{(((((((((((((..((((((..........))))))...)))).((..(((((((.....((((({((.((((...........)))).)).....)})})))))))))..)).....,,.....,}...}))))))))..,)).................,((({...{{{||,|}.(({({{....}},.))}}..}}}}}...))}.).)))))).))))))..}.,,,....,,))))))))))......,,,....,,}..,{((,.....,,,,.,,,.........)))))))))...{{{.......{{,....|||.......))).(((((({{,,((......}}))))))))...(((.((((...{.{(((((..((((.((....))))))..)))))}.}...)))).))),.))))))))))}..|||,,...........)))))}},,.)))))}}.,,|{{{{{{{{,||||,...||||,...,}}}}(((((((((...))))))))).)))))}}}))))).)))))))).,((((((((((({...((((((((((((....))))))))))))......}))).)}..))))))
Back