Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ANKRD36_0002200
Sequence Length
658 nt
GC Content
0.3845
CAUUUUUGAUCUAAUUUAUGAAUACGAAAGAAAGAGAUAUGAAGAUCUUCCUAUAAAUAGCAAUCCAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCCUUGAAGGCUACAAGUGGCAAGGAAGAUUCUAUUUCAAAUAUAGCCACAGAAAUAAAGGAUGGACAAAAAUCUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAACAACCGGCCUUGAAGGAUACAAGUGACAAGGAUGAUUCUGUUUCGAACACAGCCACAGAAAUAAAAGAUGAACAAAAAUCUGGGACAGUGCUUCCUGCUGUUGAACAGUGUUUAAACAGGAGUCUCUACAGACCUGAUGCUGUUGCACAGCCUGUGACAGAGAAUGAGUUUUCUUUGGAAUCUGAGAUUAUUUCAAAACUAUACAUCCCAAAGAGAAAGAUUAUUUCUCCACGAUCUAUAAAAGAUGUGCUUCCUCCUGUUGAAGAGGCUGUUGACAGGUGUCUCUACCUACUGGACCGUUUUGCACAGCCUGUGACAAAGGAUAAGUUUGCUUUGGAAUCUGAGAAUAUUUCAGAACCAUACUUUACGAACAGAAGGACUAUUUCUCAACAAUCUGCAGAAAAUUUAGAUGCUGCAUGUGGCAUUGACAAAACAGAAAAUGGAAACAUGUUUGAAGACCAAAAUGUUGAUAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-147.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -161.06
Frequency: 0.0000
Diversity: 212.50
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((.(.(((.....................((((((.((..((((((((.......((........((((((..................))))))........)).)))))))))))))))).......((((((((((((..(((((........(((((((........))))))).......((..(((((.(((.((.((..((((((.(((((..((((...(((((.............((((........))))((((......)))).(((((..(((((((((......((.((((....)))))))))))))))..))))))))))...))))..))))).))))))..)).))..)))..)))))..))...)))))....((((((.....))))))(((.((((.....)))))))..((((.(((((..(.(((((((.(.((((.(((.(........))))...)))))))))))).)..(((((.(......).)))))...(((((((...))))))).............))))).)))).)))))))........(((((............))))).)))))..........((((..(((....))).)))).)))).))))))((....))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((({(.(((.....................((((({.{,..|||{{{((.......,,...,,,{{((((((,.,{..,,....,{{{{.,,))))}....|},}|.})))))))}}}}}})).......((((({{,,,{{.,({{((,.......(((((({..{,,,,.}}}||||..,..,|,,||||{,,||,,.},,|,,.|{{||{,|,|{{||{{{,,..{{|,{||.||,.......((((........))))((((......)))).(((((,.(((((({({..,,((((,{{{{..,,||}}|||}|||}}}},,))))})))))..,||||,.}|}|||}}}}}},.}}.||{{|,..,}}}}........,}}}),...((((((.....))))))(((,{(((.....)))))))..{{||,|||||,,{|((((((||{,|{{(.({{.,........)))),..}}}}|))))))),}..(((((.{......).))))),..(((((((...))))))).,},..,},,...}))}),))}}.}}})))}........(((((............)))))})))))..,.....,,||||..{{{....))),)))}.))).)))))))((....))
Back