Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ANKRD36_0003200
Sequence Length
1781 nt
GC Content
0.4149
UGUCUUCUCAGAAACAACCAGCCUUGAAGGCUACAAGUGGCAAGGAAGAUUCUAUUUCAAAUAUAGCCACAGAAAUAAAGGAUGGACAAAAAUCUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAACAACCGGCCUUGAAGGAUACAAGUGACAAGGAUGAUUCUGUUUCGAACACAGCCACAGAAAUAAAAGAUGAACAAAAAUCUGGGACAGUGCUUCCUGCUGUUGAACAGUGUUUAAACAGGAGUCUCUACAGACCUGAUGCUGUUGCACAGCCUGUGACAGAGAAUGAGUUUUCUUUGGAAUCUGAGAUUAUUUCAAAACUAUACAUCCCAAAGAGAAAGAUUAUUUCUCCACGAUCUAUAAAAGAUGUGCUUCCUCCUGUUGAAGAGGCUGUUGACAGGUGUCUCUACCUACUGGACCGUUUUGCACAGCCUGUGACAAAGGAUAAGUUUGCUUUGGAAUCUGAGAAUAUUUCAGAACCAUACUUUACGAACAGAAGGACUAUUUCUCAACAAUCUGCAGAAAAUUUAGAUGCUGCAUGUGGCAUUGACAAAACAGAAAAUGGAAACAUGUUUGAAGACCAAAAUGUUGAUAAGGAAGGAAAAGCACUACCAGCAACUGGACAAAAAGCAAAUGUGUCUCCUGAGCAACCGCCUUUAUUCACGCAUACGGUGAAAGACAGAGAUCACAUUUCAACUAGAUUCUUAGGAGGUAUGGAUUCACUAACUUCCAGUGAAGAAUCUUCUGAGCGACCUCCUUUAUCCACGCUUACUCUGAAAGAGGCAGAUCCCAGUUCAAAAGCAGCCAUGAGAAGGAAGGAUUCACCACCUCCAGGAAAAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCUGAGAAGGCUACAAGUGACGACAAAGAUUCUGUUUCAAAUAUAGCCACAGAAAUAAAGGAGGGACCAAUAUCUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCUGAGAAGGCUACAAGUGACGAGAAAGAUUCUGUUUCAAAUAUAGCCACAGAAAUAAAGAAGGGACAACAAUCUGGGACAGUGUCUCCUCAGAAACAAUCGGCCUGGAAGGUUAUAUUUAAAAAGAAAGUUUCUCUUUUGAAUAUUGCCACAAGAAUAAUGGGUGGUGGGAAAUCUGGAACAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCCUCAAAGGCUACAAGUGACAAGACAGAUUCUGCUUUGAAUAUAGCUACAGAAAUAAAGGAUGGACUACAGUGUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCCUUGAAGGCUACAACUGACGAGGAAGACUCUGUUUCGAAUAUAGCCACAGAAAUAAAGGAUGGAGAAAAAUCUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAGCAACCAGCCUUGAAGGCUACAACUGACGAGGAAGAUUCUGUUUCGAAUAUAGCCACAGAAAUAAAGGAUGGAGAAAAAUCUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCCUUGAAGGCUACAACUGAUGAGAAAGAUUCUGUUUCGAACAUAGCCACAGAAAUAAAGGAUGGAGAAAAAUCUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAACCACCAGCCUUGACGGCUACAAGUGACGAGGAAGGUUCUGUUUUGAGUAUAGCCAGAGAAAACAAGGAUGGAGAAAAAUCUAGGACAGUGUCUUCUCGGAAAAAACCAGCCUUGAAGGCUACAAGUGAUGAGAAGGAUUCUUUUUCGAAUAUAACCAGAGGAAAAAAGGAUGGAGAAAUAUCUAGGAAAGUGUCUUCUCAGAAACCACCAACCUUGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-474.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -504.61
Frequency: 0.0000
Diversity: 400.80
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((((...((....((((((.((((((....(((((...(((........))).......))))).........((((........))))((((((.((((((..(((((.((.((..(((((.......)))).)....)).)).)))))....((((((.(((.((((...................)))))).).))).)))((.(((((.((......)).))))).))(((((((((..(((.(((....)))))).))))...)))))....(((((((((((.........((((((((((((...((........((((((.....))))))(((.((((.....)))))))((((((((((..(((((.((((((..(((((.(((((((((.(((..(......)..))).(((((.(((((.(......).)))))...(((((((...))))))).(((..(((((.....(((((.....)))))........(((((............)))))((((((..................(((.(((((((((...........((((....((.((........)).))..))))...........))))))))).)))......(((((((((((((........(((((.........(((.(((.((..((((....))))..)).)))))))))))...((((((.(..((...(((((((.((((((((((((..((((((..((((...((((..(((((...(((.....((....)).....)))))))).....))))))))..)))))).(((((((..........)))))))(((((....(((.((((.......)))))))....)))))......))))))))))..(((.....)))((((.(((((((((((..........)))))).(((((....(((..((((...))))...)))....))))).((((...................))))))))).)))))))))))))....))..)))))))(((.((((((((((((((...)))).)))))))))).)))....)))))).)))))))........((((((((.(((((((..(........(((((..((((((.....(((.((((((..(((((((........)))...))))........((..((((...))))..)).)))))).))).........))))))..)))))........)..))))))).))))))))......))))))....)))))..)))(((....)))(((((((.(((((((((..((.....((((((.((((((........(..(((((((.(((((((((......(((.............))).......)).))))))).)))))))..)........)))))).))))))....))..)))).))))).))))))).........)))))......))).))))))...))))).)))))).))))).)))....(((.((((.....))))....)))..)))))))))...)))))))).)))))))))))))))..((((........)))))))))).))))))...((......)))))))).))))))....))..)))))))).(((((((((...........))))))..((((.(((.......(((.((((......)))).))).....))).))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
..((((((((...((....((((((.((((((....(((((...{{,,......,})).......))))).........((((........}))}((((((.((((({,,{{(({,({.,{..(((((..,....,,.,}..}}})).,}.|||})||||,,,(((.(,{.{{{,......{{{{........})))|||{,.,,,.)))|,{((((,.(({{{{{{},.,,|||{,|(((,,,,||,}|||}|||}}}},,))))}))))}..,))))....(((((((((((..,,{{,|,,{,||||{{{{(...((........((((((.....))))))(((,{(((.....)))))))((((((((((..(((((.((((((..(((((.(((((((((.(((..{......|,,}}}.{({{{.(((((.(......}.)))))...(((((((...))))))).{{(,.(((({.....{({{(.....}}))}........(((((............)))))((((((..,,......,.......(((.(((((((((.....,,....((((....((.((........)).))..)))),,,........))))))))).)))....,.{((((((((((((,(......,||||......{,{{{{.{||,||..{{((,,,,||}|,,||,}}|},}},.}}.,}||||{{.{,,||,},|((((((.{,((((((((((..((((((..((((...((((..(((((...(((.....{{....)).....)}}))))).....))))))))..)))))).(((((((..........)))))))(((((....(((.((((.......)))))))....)))))......))))))))))..(({.....}))((((.(((((((((((..........)))))),(((((....{((..((({...}))),,,})}....))))).{{{,......,...,.....,..)))}})))).))))))))))))}....}}..})))))}(((.(((((((((((((,...,))).)))))))))).)))....}}}}},.))))))),,....,,{(((((((.(((((((,.{........(((((..((((((.....(((.((((((..(((((({..,.....}}}..,}}},........{(..((({...)))),.}}.)))))).))).........))))))..)))))........,..))))))).))))))))......)))))}....))))),,))),{,....}}|(((((((.(((((((((..((.....((((((.((((((........,..(((((((.((((((((,......(({{..........,.))).......),}))))))).))))))),.}........)))))).))))))....))..))))}}}))).))))))),........)))))......))).))))))...))))).)))))).))))).)))....(((.((((.....))))....)))..)))))))}}...})))})))})))))))))))))))..{{{(,,,.....})))}))))).)))))}...((......)))))))).))))))....))..))))))))}|{(((((((...........,,}))),.((((.(((.,.....(((.((({......)))).)))...,.))).)))),}},
Back