Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ANKRD36_0004100
Sequence Length
2568 nt
GC Content
0.4124
GCUACAAGUGGCAAGGAAGAUUCUAUUUCAAAUAUAGCCACAGAAAUAAAGGAUGGACAAAAAUCUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAACAACCGGCCUUGAAGGAUACAAGUGACAAGGAUGAUUCUGUUUCGAACACAGCCACAGAAAUAAAAGAUGAACAAAAAUCUGGGACAGUGCUUCCUGCUGUUGAACAGUGUUUAAACAGGAGUCUCUACAGACCUGAUGCUGUUGCACAGCCUGUGACAGAGAAUGAGUUUUCUUUGGAAUCUGAGAUUAUUUCAAAACUAUACAUCCCAAAGAGAAAGAUUAUUUCUCCACGAUCUAUAAAAGAUGUGCUUCCUCCUGUUGAAGAGGCUGUUGACAGGUGUCUCUACCUACUGGACCGUUUUGCACAGCCUGUGACAAAGGAUAAGUUUGCUUUGGAAUCUGAGAAUAUUUCAGAACCAUACUUUACGAACAGAAGGACUAUUUCUCAACAAUCUGCAGAAAAUUUAGAUGCUGCAUGUGGCAUUGACAAAACAGAAAAUGGAAACAUGUUUGAAGACCAAAAUGUUGAUAAGGAAGGAAAAGCACUACCAGCAACUGGACAAAAAGCAAAUGUGUCUCCUGAGCAACCGCCUUUAUUCACGCAUACGGUGAAAGACAGAGAUCACAUUUCAACUAGAUUCUUAGGAGGUAUGGAUUCACUAACUUCCAGUGAAGAAUCUUCUGAGCGACCUCCUUUAUCCACGCUUACUCUGAAAGAGGCAGAUCCCAGUUCAAAAGCAGCCAUGAGAAGGAAGGAUUCACCACCUCCAGGAAAAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCUGAGAAGGCUACAAGUGACGACAAAGAUUCUGUUUCAAAUAUAGCCACAGAAAUAAAGGAGGGACCAAUAUCUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCUGAGAAGGCUACAAGUGACGAGAAAGAUUCUGUUUCAAAUAUAGCCACAGAAAUAAAGAAGGGACAACAAUCUGGGACAGUGUCUCCUCAGAAACAAUCGGCCUGGAAGGUUAUAUUUAAAAAGAAAGUUUCUCUUUUGAAUAUUGCCACAAGAAUAAUGGGUGGUGGGAAAUCUGGAACAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCCUCAAAGGCUACAAGUGACAAGACAGAUUCUGCUUUGAAUAUAGCUACAGAAAUAAAGGAUGGACUACAGUGUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCCUUGAAGGCUACAACUGACGAGGAAGACUCUGUUUCGAAUAUAGCCACAGAAAUAAAGGAUGGAGAAAAAUCUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAGCAACCAGCCUUGAAGGCUACAACUGACGAGGAAGAUUCUGUUUCGAAUAUAGCCACAGAAAUAAAGGAUGGAGAAAAAUCUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCCUUGAAGGCUACAACUGAUGAGAAAGAUUCUGUUUCGAACAUAGCCACAGAAAUAAAGGAUGGAGAAAAAUCUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAACCACCAGCCUUGACGGCUACAAGUGACGAGGAAGGUUCUGUUUUGAGUAUAGCCAGAGAAAACAAGGAUGGAGAAAAAUCUAGGACAGUGUCUUCUCGGAAAAAACCAGCCUUGAAGGCUACAAGUGAUGAGAAGGAUUCUUUUUCGAAUAUAACCAGAGGAAAAAAGGAUGGAGAAAUAUCUAGGAAAGUGUCUUCUCAGAAACCACCAACCUUGAAGGGUACAAGUGACGAGGAAGAUUCUGUUUUGGGUAUAGCCAGAGAAAACAAGGAUGGAGAAAAAUCUAGGACAGUGUCUUCUGAGAAACCACCAGGCUUGAAGGCUUCAAGUGCCGAGAAAGAUUCUGUUUUGAAUAUAGCCAGAGGAAAAAAGGAUGGAGAAAAAACUAAGAGAGUGUCUUCUCGGAAAAAACCAUCCUUGGAGGCCACAAGUGAUGAGAAGGAUUCUUUUUCGAAUAUAACCAGAGAAAAAAAGGAUGGAGAAAUAUCUAGGAAAGUGUCUUCUCAGAAACCACCAGCCUUGAAGGGUACAAGUGACGAGGAAGAUUCUGUUUUGGGUAUAGCCAGAGAAAACAAGGAUGGAGAAAAAUCUAGGACAGUGUCUUCUGAGAAACCACCAGGCUUGAAGGCUACAAGUGAUGAGAAAGAUUCUGUUUUGAAUAUAGCCAGAGGAAAAAAGGAUGGAGAAAAAACUAGGACAGUGUCUUCUCAGAAACCACCAACCUUGAAGGCUACAAGUGAUGAGGAAGAUUCUGUUUUGAGUAUAGCCAGAGAAAACAAGGAUGGAGAAAAAUCUAGGACAGUGUCUUCUGAGAAACCAUCAGGCUUGAAGGCUACAAGUGCCGAGAAAGAUUCUGUUUUGAAUAUAGCCAGAGGAAAAAAGUAUGGAGAAAAAACUAAGAGAGUGUCUUCUCGGAAAAAACCAGCCUUGAAGGCUACAAGUGACGAGAAAGAUUCUGUUUUGUAUAUAGCCAGAGAAAAAAAGGAUGGAGAAAAAUCUAGGACAGUGUCUUCUCCGAAACAACCAGCAUUGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-684.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -730.13
Frequency: 0.0000
Diversity: 633.43
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((....((((..((((((....((((((.............))))))..(((((........(((((((........))))))).......((..(((((.(((.((.((..((((((.(((((..((((...(((((.............((((........))))((((......)))).(((((..(((((((((......((.((((....)))))))))))))))..))))))))))...))))..))))).))))))..)).))..)))..)))))..))...)))))....((((((.....))))))(((.((((.....))))))))))))).(((..(((((.((((((..(((((.(((((((((.(((..(......)..))).(((((.(((((.(......).)))))...(((((((...))))))).(((..(((((.....(((((.....)))))........(((((............)))))((((((..................(((.(((((((((...........((((....((.((........)).))..))))...........))))))))).)))......(((((((((((((........(((((.........(((.(((.((..((((....))))..)).)))))))))))...((((((.(..((...(((((((.((((((((((((..((((((..((((...((((..(((((...(((.....((....)).....)))))))).....))))))))..)))))).(((((((..........)))))))(((((....(((.((((.......)))))))....)))))......))))))))))..(((.....)))((((.(((((((((((..........)))))).(((((....(((..((((...))))...)))....))))).((((...................))))))))).)))))))))))))....))..)))))))(((.((((((((((((((...)))).)))))))))).)))....)))))).)))))))........((((((((.(((((((..(........(((((..((((((.....(((.((((((..(((((((........)))...))))........((..((((...))))..)).)))))).))).........))))))..)))))........)..))))))).))))))))......))))))....)))))..)))(((....)))(((((((.(((((((((..((.....((((((.((((((........(..(((((((.(((((((((......(((.............))).......)).))))))).)))))))..)........)))))).))))))....))..)))).))))).))))))).........)))))......))).))))))...))))).)))))).))))).)))...)))).)))(((.(..(((....((..((.((((((..(((((((((......(((.............(((.........((((((((.(((((((((..(......((((((.((((((....((..(((((((.((.((((((...((((..(((.............)))....))))...)))))).)))))))))...))(((..((((....))))....))).(..(((((((.(((((((((((.(..(((.............)))..)...))))))))))).)))))))..)..........(((((.((.((((((((.(((((((.(((.((.(((((.......(((.............))).........))))).)).))))))))))........((((((.(((((.....((..(((((((.((.((((((...((((..(((.............)))....))))...)))))).)))))))))...)).....))))).))))))....((..(..(((((((.(((((((((((.(..(((.............(((.......((.(((((((.(((((((.....((....((.(((.((((......((..((((((.(((.((((((((.......(((.............))).........)))))))).)))))))))...))......)))).))).))....)).....))))))).)))))))))......))).............)))..)...))))))))))).)))))))..)..))......)))))))).)).))))).(((((((.(((.((.(((((.......(((.............))).........))))).)).))))))))))........)))))).)))))).....)..)))).))))).)))))))).......))).............))).......)).)))))))..)))))).))..))....)))..).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((....(((((..,{{,,......,,)).....,.))))).........,((({{.......|||((((((.((((({,,({(((,((.,{..(((((..,....,,,,,,.)}})).}}.}}}))|}|}{,,{{{.{{{.{{{|......{{{{........})))|||,|.}}}.)))|{,(((({.(({,,,||}}.,}}}|,}}((({{{{{|.,|||,|||,,,,}})))),))))}..,))))....(((((((((((....(((({...}))))...((((((.((((...((((((.....))))))(((.{(((.....)))))))..((((,((((({{(,(((((((,(.((((.(((,{........)))),..})))}))))))).|..(((((.(......).))))),..(((((((...)))))))..,...||||...,}}}).)))}.{{{{{{|........(((((............))))){(((((,{,....{(((((({..,(,,.{||{(((({....,{{....((((....((.((........)).))..))))}}}......,,)||||||||{|||{{.{{....}},,,,.{((((.......))))}.,.}}}}}}.}}})))||....{{{(((((,((((((.,({..,,.||.}}}}}}.,||}}}}))))|,||||,..((((((((((..{(((({..{(((...{{((..(((((...(((.....{{....)}.,,,,}}}))))),....))))))))..}))))|,(((((((..........)))))))|((({....(({.{{({.....,,)))))))....)))))......})))))))))..,{,...{,|||,{{,({((((((((((..........)))))))))).}}..}}..,.}}}....)))))))),,...,}.))))))}}}}},.....)))}......,|,{((((((.(((((((((...((....(((((..{{(((,(((((((((((((,...,))).)))))))))).|||.,,.......,||||(((((....(((((((((.(((((((((.....,......((((...(((((...((..(((((((((.((((((........)))............,,.((,.((((...}|||,,||.,|{(((((((...{{....((((((.((((((.....,..{{{|{(((((.((((({||....,..{{|,.........,{.{|{.......}}|(((((((.(((((((((..((.....((((((.((((((........,..(((((((.((((((((,......(({{..........,.))).......),}))))))).))))))),.}........)))))).))))))....))..))))}}}))).))))))),....,..||,|,........,|.|}|.......|||||||}}},}}||}||||||,.,.{{{,.(((({.,{{{{....}),.}}}}}..}}}.||||||||},.....|||,,.....,..,,.|||,......))}}}}}))}.))))))))).........)))))).))))))....))..)))))))}{(((((((((.............,)}},,,,}}}|{{{....,,}}}......|||},||||||,....{,|..{(({,...})}}....||,.|..|{{((((.(((((((((((.{..(((.............)))..,...))))))))))).)))))))},),,.,}}}{{.(((((.((.((((((((.((((((({(((.((.(((((.......(((.............))).........})))).)).))))))))))........((((((.(((((.....((..((((((((((.((((((,..,{,,..{{{.............}|}....,)))},.}))))).}))))))))...)).....))))).))))))....((..(..(((((((.(((((((((((.{..(((.............)))..,...))))))))))).)))))))..)..}},.....)))))))).)).)))))..}}....))).))))))))).)).))))).))))......,....))))........))))).)))..)).))))..)))))))))))..)))))....))..)))))}}))).))))))}},)))))))))))))))))..{{{(,,,.....}))),))))).)))))}{{||....,},))}|{(((,{{{{{{.,,,,,.(((((((((((.((.(((((.......(((.............))).........})))).)).))))))))))........)))|||.||}{({....((..{(((({{(((.((((((({.,,.,..(((.............)))......,},)))))))).)))))))),}..})....))).}).,,)
Back