Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ANKRD36_0004700

Sequence Length

2087 nt

GC Content

0.4164

UGUCUUCUCAGAAACAACCGGCCUUGAAGGAUACAAGUGACAAGGAUGAUUCUGUUUCGAACACAGCCACAGAAAUAAAAGAUGAACAAAAAUCUGGGACAGUGCUUCCUGCUGUUGAACAGUGUUUAAACAGGAGUCUCUACAGACCUGAUGCUGUUGCACAGCCUGUGACAGAGAAUGAGUUUUCUUUGGAAUCUGAGAUUAUUUCAAAACUAUACAUCCCAAAGAGAAAGAUUAUUUCUCCACGAUCUAUAAAAGAUGUGCUUCCUCCUGUUGAAGAGGCUGUUGACAGGUGUCUCUACCUACUGGACCGUUUUGCACAGCCUGUGACAAAGGAUAAGUUUGCUUUGGAAUCUGAGAAUAUUUCAGAACCAUACUUUACGAACAGAAGGACUAUUUCUCAACAAUCUGCAGAAAAUUUAGAUGCUGCAUGUGGCAUUGACAAAACAGAAAAUGGAAACAUGUUUGAAGACCAAAAUGUUGAUAAGGAAGGAAAAGCACUACCAGCAACUGGACAAAAAGCAAAUGUGUCUCCUGAGCAACCGCCUUUAUUCACGCAUACGGUGAAAGACAGAGAUCACAUUUCAACUAGAUUCUUAGGAGGUAUGGAUUCACUAACUUCCAGUGAAGAAUCUUCUGAGCGACCUCCUUUAUCCACGCUUACUCUGAAAGAGGCAGAUCCCAGUUCAAAAGCAGCCAUGAGAAGGAAGGAUUCACCACCUCCAGGAAAAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCUGAGAAGGCUACAAGUGACGACAAAGAUUCUGUUUCAAAUAUAGCCACAGAAAUAAAGGAGGGACCAAUAUCUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCUGAGAAGGCUACAAGUGACGAGAAAGAUUCUGUUUCAAAUAUAGCCACAGAAAUAAAGAAGGGACAACAAUCUGGGACAGUGUCUCCUCAGAAACAAUCGGCCUGGAAGGUUAUAUUUAAAAAGAAAGUUUCUCUUUUGAAUAUUGCCACAAGAAUAAUGGGUGGUGGGAAAUCUGGAACAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCCUCAAAGGCUACAAGUGACAAGACAGAUUCUGCUUUGAAUAUAGCUACAGAAAUAAAGGAUGGACUACAGUGUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCCUUGAAGGCUACAACUGACGAGGAAGACUCUGUUUCGAAUAUAGCCACAGAAAUAAAGGAUGGAGAAAAAUCUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAGCAACCAGCCUUGAAGGCUACAACUGACGAGGAAGAUUCUGUUUCGAAUAUAGCCACAGAAAUAAAGGAUGGAGAAAAAUCUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCCUUGAAGGCUACAACUGAUGAGAAAGAUUCUGUUUCGAACAUAGCCACAGAAAUAAAGGAUGGAGAAAAAUCUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAACCACCAGCCUUGACGGCUACAAGUGACGAGGAAGGUUCUGUUUUGAGUAUAGCCAGAGAAAACAAGGAUGGAGAAAAAUCUAGGACAGUGUCUUCUCGGAAAAAACCAGCCUUGAAGGCUACAAGUGAUGAGAAGGAUUCUUUUUCGAAUAUAACCAGAGGAAAAAAGGAUGGAGAAAUAUCUAGGAAAGUGUCUUCUCAGAAACCACCAACCUUGAAGGGUACAAGUGACGAGGAAGAUUCUGUUUUGGGUAUAGCCAGAGAAAACAAGGAUGGAGAAAAAUCUAGGACAGUGUCUUCUGAGAAACCACCAGGCUUGAAGGCUUCAAGUGCCGAGAAAGAUUCUGUUUUGAAUAUAGCCAGAGGAAAAAAGGAUGGAGAAAAAACUAAGAGAGUGUCUUCUCGGAAAAAACCAUCCUUGGAGGCCACAAGUGAUGAGAAGGAUUCUUUUUCGAAUAUAACCAGAGAAAAAAAGGAUGGAGAAAUAUCUAGGAAAGUGUCUUCUCAGAAACCACCAGCCUUGAAGGGUACAAGUGACGAGGAAGAUUCUGUUUUGGGUAUAGCCAGAGAAAACAAGGAUGGAGAAAAAUCUAGGACAGUGUCUUCUGAGAAACCACCAGGCUUGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-564.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -600.48

Frequency: 0.0000

Diversity: 470.52

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((..(((((((((........(((((..(........)..)))))..(((.((((((.((((((.(((.((((...................)))))).).))).)))((.(((((.((......)).))))).))(((((((((..(((.(((....)))))).))))...)))))....(((((((((((..((((.(.((((((((((((...((........((((((.....))))))(((.((((.....)))))))((((((((((..(((((.((((((..(((((.(((((((((.(((..(......)..))).(((((.(((((.(......).)))))...(((((((...))))))).(((..(((((.....(((((.....)))))........(((((............)))))((((((..................(((.(((((((((...........((((....((.((........)).))..))))...........))))))))).)))......(((((((((((((........(((((.........(((.(((.((..((((....))))..)).)))))))))))...((((((.(..((...(((((((.((((((((((((..((((((..((((...((((..(((((...(((.....((....)).....)))))))).....))))))))..)))))).(((((((..........)))))))(((((....(((.((((.......)))))))....)))))......))))))))))..(((.....)))((((.(((((((((((..........)))))).(((((....(((..((((...))))...)))....))))).((((...................))))))))).)))))))))))))....))..)))))))(((.((((((((((((((...)))).)))))))))).)))....)))))).)))))))........((((((((.(((((((..(........(((((..((((((.....(((.((((((..(((((((........)))...))))........((..((((...))))..)).)))))).))).........))))))..)))))........)..))))))).))))))))......))))))....)))))..)))(((....)))(((((((.(((((((((..((.....((((((.((((((........(..(((((((.(((((((((......(((.............))).......)).))))))).)))))))..)........)))))).))))))....))..)))).))))).))))))).........)))))......))).))))))...))))).)))))).))))).)))....(((.((((.....))))....)))..)))))))))...)))))))).)))))))))....................(((((((((((.(((((((((..(......(.((((.((((......((..(((((((.((.((((((...((((..(((.............)))....))))...)))))).)))))))))...))......)))).)))).).....)..))).)))))).)))))))))))....)))))))))))..((((........)))).)))))).))))))))))))..))(((((((((..((.(((.....(((((((.(((.((.(((((.......(((.............))).........))))).)).))))))))))........((((((.(((((.....((..(((((((.((.((((((...((((..(((.............)))....))))...)))))).)))))))))...)).....))))).))))))...........(((((((.(((((((((((.(..(((.............)))..)...))))))))))).)))))))..))).))..))))))))..)

Thermodynamic Ensemble Prediction

((..((((((((,.....{,.(((((..{........}..))))).,}.((((((,,{...,,,.}..}}}}},.....((((........)))){((({{.{{.||||{.(((({.((,.,,||)}.})))),)}(((((((((..(((.(((....)))))).)))),..}))))....(((((((((((..,.(({({...|}}}|...{,,,{(,,,{....((((((.....))))))(((,{(((.....)))))))((((((((((..(((((.((((((..(((((.(((((((((.(({..{.....,},,))).{|{||.{{{{{.{...,..}.}}}||,..(((((((...))))))).{{(,.((({,.....{({{{.....||}}}........(((((............)))))((((((..,,......,.......(((.(((((((((.....,.....((((....((.((........)).))..)))),,,........))))))))).)))....,.,((((((((((((,(......,||||......{,{{{{.{||,||..{{((,,,,||}|{{||,,||},}},.}}.,}||||{{.{,,||,},|((((((.{,((((((((((..((((((..((((...((((..(((((...(((.....{{....)).....)}}))))).....))))))))..)))))).(((((((..........)))))))(((((....(((.((((.......)))))))....)))))......))))))))))..(({.....}))((((.(((((((((((..........)))))),(((((....{((..((({...}))),,,})}....))))).{{{,......,...,.....,..)))}})))).))))))))))))}....}}..}))))),(((.(((((((((((((,...,))).)))))))))).)))....}}}}},.))))))),,....{,{(((((((.(((((((,.{........(((((..((((((.....(((.((((((..{((((({..,.....}}}..,}}},........{(..((({...)))),.}}.)))))).))).........))))))..)))))........,..))))))).))))))))......)))))}....))))),,))),,,....}}|(((((((.(((((((((..((.....((((((.((((((........,..(((((((.((((((((,......(({{..........,.))).......),}))))))).))))))),.}........)))))).))))))....))..))))}}}))).))))))),......,,)))))......))).))))))...))))).)))))).))))).)))....{{(.{(((.....))))....)))..)))))))}}||||||||},}.,,,}})))),..,}}..}}}}},......{{(((((((((.(((((((((..{......{.((((.((((......((..((((((((((.((((((,...,,,..{{,...,......,,,|||....,}})}}.}})))).}))))))))...))......)))).)))).}.....)..)))}}))))).))))))))))).,..)))))))))))..{{{(,,......))))}})})).)))))))))))))..))(((((((((..((.{{{.....((((({{{(((.((.(((({.......(((.............))).........})))).)).))))))))))........((((((.(((((.....((..((((((({((.((((((,..,{,,..{{{...........,.}|}....,)})},.}))))).}))))))))...)).....))))).))))))........,..(((((((.(((((((((((.{..(((.............)))..,...))))))))))).)))))))..)}}.))..))))))))..)