Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ANKRD36_0005500
Sequence Length
599 nt
GC Content
0.4140
GAGUCUCUACAGACCUGAUGCUGUUGCACAGCCUGUGACAGAGAAUGAGUUUUCUUUGGAAUCUGAGAUUAUUUCAAAACUAUACAUCCCAAAGAGAAAGAUUAUUUCUCCACGAUCUAUAAAAGAUGUGCUUCCUCCUGUUGAAGAGGCUGUUGACAGGUGUCUCUACCUACUGGACCGUUUUGCACAGCCUGUGACAAAGGAUAAGUUUGCUUUGGAAUCUGAGAAUAUUUCAGAACCAUACUUUACGAACAGAAGGACUAUUUCUCAACAAUCUGCAGAAAAUUUAGAUGCUGCAUGUGGCAUUGACAAAACAGAAAAUGGAAACAUGUUUGAAGACCAAAAUGUUGAUAAGGAAGGAAAAGCACUACCAGCAACUGGACAAAAAGCAAAUGUGUCUCCUGAGCAACCGCCUUUAUUCACGCAUACGGUGAAAGACAGAGAUCACAUUUCAACUAGAUUCUUAGGAGGUAUGGAUUCACUAACUUCCAGUGAAGAAUCUUCUGAGCGACCUCCUUUAUCCACGCUUACUCUGAAAGAGGCAGAUCCCAGUUCAAAAGCAGCCAUGAGAAGGAAGGAUUCACCACCUCCAGGAAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-134.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -149.61
Frequency: 0.0000
Diversity: 173.40
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.((.((((.......((((((.(((((((((..(((((((......)))))))..)).(((((...))))).................((((((.....))))))(((.((((.....)))))))((((........)))))))))))))))))((((((((..((.....(((((..(((.......((((.(((((....(((.(((((((..(((((((...))))))).)))..((((.......)))).....(((((((......)).))))).....((((((......))))))...............(((.(((((((((...........((((....((.((........)).))..))))...........))))))))).))).)))))))..)))))..))))))).)))))...))..))))).))).........((((((((.((((((.(((.....)))))))))....)))))))))))))).)).)))((((.(((..((((...(((...((......)).))).....))))...........(((.((........))))).)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((.((.((({.(((.(((....))))))..|(({...(((((,,(,((((((((((.,,.,{((,....,,,,...,,....,,.)))))))}}|,.,)).,)))))}}}}((((.....))))(((((((((((({{(,,{.((((((({(.{(((.({{,{........)))),..}}}}}))))))).}..{((((.(......).)))}|,..(((((((...))))))).,},..{{{{......,||||,....|||||||,,....{{,||........,,|,|||||,||}}||||.......,,|..,|||...||||,||||.....}},,,)))),,,.})),}))}..}))))..((((...)))).......{.(((((((((({,((.{{....}},....{((((......,))))}.,.)))))).))))))),....((((((((.((((((.{({.....)},))))))....)))))))))))))).))}}))((((.(((..{({..{{{(,..,}}||,,,..,,,.,|||,..,}},,,..,..,..((,,((........))))).)))))))
Back