Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ANKRD36_0005700

Sequence Length

1450 nt

GC Content

0.4131

AUUAUUUCAAAACUAUACAUCCCAAAGAGAAAGAUUAUUUCUCCACGAUCUAUAAAAGAUGUGCUUCCUCCUGUUGAAGAGGCUGUUGACAGGUGUCUCUACCUACUGGACCGUUUUGCACAGCCUGUGACAAAGGAUAAGUUUGCUUUGGAAUCUGAGAAUAUUUCAGAACCAUACUUUACGAACAGAAGGACUAUUUCUCAACAAUCUGCAGAAAAUUUAGAUGCUGCAUGUGGCAUUGACAAAACAGAAAAUGGAAACAUGUUUGAAGACCAAAAUGUUGAUAAGGAAGGAAAAGCACUACCAGCAACUGGACAAAAAGCAAAUGUGUCUCCUGAGCAACCGCCUUUAUUCACGCAUACGGUGAAAGACAGAGAUCACAUUUCAACUAGAUUCUUAGGAGGUAUGGAUUCACUAACUUCCAGUGAAGAAUCUUCUGAGCGACCUCCUUUAUCCACGCUUACUCUGAAAGAGGCAGAUCCCAGUUCAAAAGCAGCCAUGAGAAGGAAGGAUUCACCACCUCCAGGAAAAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCUGAGAAGGCUACAAGUGACGACAAAGAUUCUGUUUCAAAUAUAGCCACAGAAAUAAAGGAGGGACCAAUAUCUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCUGAGAAGGCUACAAGUGACGAGAAAGAUUCUGUUUCAAAUAUAGCCACAGAAAUAAAGAAGGGACAACAAUCUGGGACAGUGUCUCCUCAGAAACAAUCGGCCUGGAAGGUUAUAUUUAAAAAGAAAGUUUCUCUUUUGAAUAUUGCCACAAGAAUAAUGGGUGGUGGGAAAUCUGGAACAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCCUCAAAGGCUACAAGUGACAAGACAGAUUCUGCUUUGAAUAUAGCUACAGAAAUAAAGGAUGGACUACAGUGUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCCUUGAAGGCUACAACUGACGAGGAAGACUCUGUUUCGAAUAUAGCCACAGAAAUAAAGGAUGGAGAAAAAUCUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAGCAACCAGCCUUGAAGGCUACAACUGACGAGGAAGAUUCUGUUUCGAAUAUAGCCACAGAAAUAAAGGAUGGAGAAAAAUCUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCCUUGAAGGCUACAACUGAUGAGAAAGAUUCUGUUUCGAACAUAGCCACAGAAAUAAAGGAUGGAGAAAAAUCUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAACCACCAGCCUUGACGGCUACAAGUGACGAGGAAGGUUCUGUUUUGAGUAUAGCCAGAGAAAACAAGGAUGGAGAAAAAUCUAGGACAGUGUCUUCUCGGAAAAAACCAGCCUUGAAGGCUACAAGUGAUGAGAAGGAUUCUUUUUCGAAUAUAACCAGAGGAAAAAAGGAUGGAGAAAUAUCUAGGAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-383.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -407.29

Frequency: 0.0000

Diversity: 336.66

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((.(((((.........(((((....((((((.....))))))(((.((((.....))))))).(((((((((..(((((.((((((..(((((.(((((((((.(((..(......)..))).(((((.(((((.(......).)))))...(((((((...))))))).(((..(((((.....(((((.....)))))........(((((............)))))((((((..................(((.(((((((((...........((((....((.((........)).))..))))...........))))))))).)))......(((((((((((((........(((((.........(((.(((.((..((((....))))..)).)))))))))))...((((((.(..((...(((((((.((((((((((((..((((((..((((...((((..(((((...(((.....((....)).....)))))))).....))))))))..)))))).(((((((..........)))))))(((((....(((.((((.......)))))))....)))))......))))))))))..(((.....)))((((.(((((((((((..........)))))).(((((....(((..((((...))))...)))....))))).((((...................))))))))).)))))))))))))....))..)))))))(((.((((((((((((((...)))).)))))))))).)))....)))))).)))))))........((((((((.(((((((..(........(((((..((((((.....(((.((((((..(((((((........)))...))))........((..((((...))))..)).)))))).))).........))))))..)))))........)..))))))).))))))))......))))))....)))))..)))(((....)))(((((((.(((((((((..((.....((((((.((((((........(..(((((((.(((((((((......(((.............))).......)).))))))).)))))))..)........)))))).))))))....))..)))).))))).))))))).........)))))......))).))))))...))))).)))))).))))).)))....(((.((((((.(.((((.....(..((((.((((..(((((((((......(((.............))).......)).)))))))..))))))))..)......)))).).))))))....)))..(((((((...)))))))...........))))))....)))))..)))))))((.....))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(,,(((((.........(((((....((((((.....))))))(((,{(((.....))))))).(((((((((..(((((.((((((..{((((.(((((((((.{{{..{,..,,,|{{||,.,||||.|||||,,...{{,|.|||||{..(((((((...))))))).{{({,(((,,.{{,{((({{.....|||||{.......(((((............)))))((((((..{,..............(((.(((((((((.....,.....((((....((.((........)).))..)))),,,........))))))))).)))....,.,((((((((((((,(......,||||......{,{{{{.{||,||..{{((,,,,||}|,,||,}||},}},.}}.,}||||{{.{,,||,},|((((((.{,((((((((((..((((((..((((...((((..(((((...(((.....{{....)).....)}})))))..,..))))))))..)))))).(((((((..........)))))))(((((....(((.((((.......)))))))....)))))......))))))))))..(({.....}))((((.(((((((((((..........)))))),(((((....{((..((({...}))),,,})}....))))).{{{,......,...,.....,..)))}})))).))))))))))))}....}}..})))))}(((.(((((((((((((,...,))).)))))))))).)))....,,,,,,.))))))},|....{,{(((((((.(((((((,.{........(((((..((((((.....(((.((((((..(((((({..,.....}}}..,}}},........{(..((({...)))),.}}.)))))).))).........))))))..)))))........,..))))))).))))))))......))))),....}}}))|,))),,,....}}}(((((((.(((((((((..((.....((((((.((((((........,..(((((((.((((((((,......(({{..........,.))).......),}))))))).))))))),.}........)))))).))))))....))..))))}}}))).))))))),......}})))),......}||.}|}}}}...}||||,||}}}}.}}})),))),...{{|,{((({{.{.{{{|.....|..{||||||||},||||||{||,,,|..|||,,,..,,,.,,,.))),,}...,)),}}))))),.)))))})},.,......||||,}.})))))....}},.,(((((((...))))))),..........))))))....)))))..)))))))((.....))