Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ANKRD36_0006000
Sequence Length
2438 nt
GC Content
0.4163
UGCUUCCUCCUGUUGAAGAGGCUGUUGACAGGUGUCUCUACCUACUGGACCGUUUUGCACAGCCUGUGACAAAGGAUAAGUUUGCUUUGGAAUCUGAGAAUAUUUCAGAACCAUACUUUACGAACAGAAGGACUAUUUCUCAACAAUCUGCAGAAAAUUUAGAUGCUGCAUGUGGCAUUGACAAAACAGAAAAUGGAAACAUGUUUGAAGACCAAAAUGUUGAUAAGGAAGGAAAAGCACUACCAGCAACUGGACAAAAAGCAAAUGUGUCUCCUGAGCAACCGCCUUUAUUCACGCAUACGGUGAAAGACAGAGAUCACAUUUCAACUAGAUUCUUAGGAGGUAUGGAUUCACUAACUUCCAGUGAAGAAUCUUCUGAGCGACCUCCUUUAUCCACGCUUACUCUGAAAGAGGCAGAUCCCAGUUCAAAAGCAGCCAUGAGAAGGAAGGAUUCACCACCUCCAGGAAAAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCUGAGAAGGCUACAAGUGACGACAAAGAUUCUGUUUCAAAUAUAGCCACAGAAAUAAAGGAGGGACCAAUAUCUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCUGAGAAGGCUACAAGUGACGAGAAAGAUUCUGUUUCAAAUAUAGCCACAGAAAUAAAGAAGGGACAACAAUCUGGGACAGUGUCUCCUCAGAAACAAUCGGCCUGGAAGGUUAUAUUUAAAAAGAAAGUUUCUCUUUUGAAUAUUGCCACAAGAAUAAUGGGUGGUGGGAAAUCUGGAACAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCCUCAAAGGCUACAAGUGACAAGACAGAUUCUGCUUUGAAUAUAGCUACAGAAAUAAAGGAUGGACUACAGUGUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCCUUGAAGGCUACAACUGACGAGGAAGACUCUGUUUCGAAUAUAGCCACAGAAAUAAAGGAUGGAGAAAAAUCUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAGCAACCAGCCUUGAAGGCUACAACUGACGAGGAAGAUUCUGUUUCGAAUAUAGCCACAGAAAUAAAGGAUGGAGAAAAAUCUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCCUUGAAGGCUACAACUGAUGAGAAAGAUUCUGUUUCGAACAUAGCCACAGAAAUAAAGGAUGGAGAAAAAUCUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAACCACCAGCCUUGACGGCUACAAGUGACGAGGAAGGUUCUGUUUUGAGUAUAGCCAGAGAAAACAAGGAUGGAGAAAAAUCUAGGACAGUGUCUUCUCGGAAAAAACCAGCCUUGAAGGCUACAAGUGAUGAGAAGGAUUCUUUUUCGAAUAUAACCAGAGGAAAAAAGGAUGGAGAAAUAUCUAGGAAAGUGUCUUCUCAGAAACCACCAACCUUGAAGGGUACAAGUGACGAGGAAGAUUCUGUUUUGGGUAUAGCCAGAGAAAACAAGGAUGGAGAAAAAUCUAGGACAGUGUCUUCUGAGAAACCACCAGGCUUGAAGGCUUCAAGUGCCGAGAAAGAUUCUGUUUUGAAUAUAGCCAGAGGAAAAAAGGAUGGAGAAAAAACUAAGAGAGUGUCUUCUCGGAAAAAACCAUCCUUGGAGGCCACAAGUGAUGAGAAGGAUUCUUUUUCGAAUAUAACCAGAGAAAAAAAGGAUGGAGAAAUAUCUAGGAAAGUGUCUUCUCAGAAACCACCAGCCUUGAAGGGUACAAGUGACGAGGAAGAUUCUGUUUUGGGUAUAGCCAGAGAAAACAAGGAUGGAGAAAAAUCUAGGACAGUGUCUUCUGAGAAACCACCAGGCUUGAAGGCUACAAGUGAUGAGAAAGAUUCUGUUUUGAAUAUAGCCAGAGGAAAAAAGGAUGGAGAAAAAACUAGGACAGUGUCUUCUCAGAAACCACCAACCUUGAAGGCUACAAGUGAUGAGGAAGAUUCUGUUUUGAGUAUAGCCAGAGAAAACAAGGAUGGAGAAAAAUCUAGGACAGUGUCUUCUGAGAAACCAUCAGGCUUGAAGGCUACAAGUGCCGAGAAAGAUUCUGUUUUGAAUAUAGCCAGAGGAAAAAAGUAUGGAGAAAAAACUAAGAGAGUGUCUUCUCGGAAAAAACCAGCCUUGAAGGCUACAAGUGACGAGAAAGAUUCUGUUUUGUAUAUAGCCAGAGAAAAAAAGGAUGGAGAAAAAUCUAGGACAGUGUCUUCUCCGAAACAACCAGCAUUGAAGGCUAUCUGUGACAAGGAAGAUUCUGUUCCGAAUAUGGCCACGGAAAAAAAGGAUGAACAAAUAUCUGGGACAGUGUCUUGUCAGAAACAACCAGCCUUGAAGGCUACAAGUGACAAGAAAGAUUCUGUUUCGAAUAUACCCACAGAAAUAAAGGAUGGACAACAAUCUGGAACAGUGUCUUCUCAGAAACAACCGGCCUGGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-655.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -700.90
Frequency: 0.0000
Diversity: 614.44
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((......((..(((((.((((((...((((.((((((((((((...((..((((((((...)))).))))))...)))...((((((..(((((((...))))))).(((((((((......(((((.....)))))........(((((............)))))(.((((((...((((((((((...(((.(((((((((...........((((....((.((........)).))..))))...........))))))))).)))...((....)).....(((((.......))))).....(((((...)))))....((((((((.((((((.(((.....)))))))))....))))))))((((((.((((((((((((..((((((..((((...((((..(((((...(((.....((....)).....)))))))).....))))))))..)))))).(((((((..........)))))))(((((....(((.((((.......)))))))....)))))......))))))))))..(((.....)))((((.(((((((((((..........)))))).(((((....(((..((((...))))...)))....))))).((((...................))))))))).)))))))))))).....(((((((....(((.((((((((((((((...)))).)))))))))).)))...........(((((((((....(((((((((.(((((((((............((((...(((((...((..(((((((((.((((((........)))...............(((.(((.....((((((((.(((((((..(........(((((...)))))........)..))))))).))))))))....))))))..........((.((((((....)))(((((((.(((((((((..((.....((((((.((((((........(..(((((((.(((((((((......(((.............))).......)).))))))).)))))))..)........)))))).))))))....))..)))).))))).)))))))..((((.(((.((((...................)))))).).))))(((((((...((....((((((.(.((((.....(..((((.((((..(((((((((......(((.............))).......)).)))))))..))))))))..)......)))).).))))))....))..))))))).((((......))))......((((((........((((......))))........))))))......))))).((((....))))....((..(..(((((((.(((((((((((.(..(((.............)))..)...))))))))))).)))))))..)..))...((.(((((.((.((((((((.(((((((.(((.((.(((((.......(((.............))).........))))).)).))))))))))........((((((.(((((.....((..(((((((.((.((((((...((((..(((.............)))....))))...)))))).)))))))))...)).....))))).))))))....((..(..(((((((.(((((((((((.(..(((.............)))..)...))))))))))).)))))))..)..))......)))))))).)).)))))..))....))).))))))))).)).))))).))))...........))))........))))).)))..)).))))..))))).))))((.((.((.(((((((((.(((((((.(((((((((......(((.............))).......)).))))))).))))))).......))))..))))).)).)).)))).)))))......))))))))))...)).)))).).....))))))))).........(((((.((.(((((((((..(......(((((...))))).....)..)))).))))).)).))))).......))))))......))).))))))...))))..)))))).)))))..))........))))((..(((((...(((.....(((((((.((((((((.((.((.(((.............((.....((((.((((((((..((((((((.........(((((...))))).....))))))))......)))))))).)))).....))...........))).))...)).)))))))).))))))).....)))...)))))...))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((({{{(,{({{{{,(,((((((({{.{(((,{(({(,,.,....}})},..}}}}|))))))).),.|||||}|...{{{|.|||{((..(((((((...))))))).,,{,,{{{{...,||||{||,....{{{(((.......(((((............))))){{(((({{...{{((((((({..,(,,.{||{(((({....,{{....((((....((.((........)).))..))))}}}......,,)||||||||{|||{{.((....}},,,,.{((((.......))))}.,.}}}}}}.}}})))}|....{(((((((,((((((.{(,...,.}|,})))))..,,))))))))||||||...((((((((((..((((((..((((...((((..(((((...(((.....{{....)).....}}}))))).....))))))))..)))))),(((((((..........)))))))(((((....(((.((((.......)))))))....)))))......))))))))))..{{,...,.|}|{(({,(((((((((((..........))))))}|||{|...,|{,,.|||,...})))}}})}}....},))),||,.......,,..{.....,..}}}||||||{,|||||((((...{{....(((((..{,((({((((((((((((({...}}}),)))))))))).|||.,,.......,||||(((((....(((((((((.(((((((((.....,......((((...(((((...((..(((((((((.((((((........)))............,,.((,.((((...}|||,,||..{{(((((((...{{....((((((.((((((.....,..{{{{{(((((.((((({{|....,..{{{,.........,{.{{{.......}}|(((((((.(((((((((..((.....((((((.((((((........,..(((((((.((((((((,......(({{..........,.))).......),}))))))).))))))),.}........)))))).))))))....))..))))}}}))).))))))),....,..||,{.........,|.|}|.......|||||||},},}}||}||||||,.,.{{{,.(((({.,{{{{....}),.}}}}}..}}}.||||||||},.....|||,,.....,..,,.|||,......)))}}})))}.))))))))).........)))))).))))))....))..))))))),{(((((((((.............,)}}},}}}}}|{{{....,,}}}......|||,,||||||,....{,|..{(({,...})}}....||,.|..{{{((((.(((((((((((.{..(((.............)))..,...))))))))))).)))))))},),,.,}}}{{.(((((.((.((((((((.(((((((((((.((.(((((.......(((.............))).........})))).)).))))))))))........((((((.(((((.....((..((((((((((.((((((,..,{,,..{{{.............}|}....,)))},.}))))).}))))))))...)).....))))).))))))....((..(..(((((((.(((((((((((.{..(((.............)))..,...))))))))))).)))))))..)..}},.....)))))))).)).)))))..}}....))).))))))))).)).))))).))))......,....))))........))))).)))..)).))))..))))))})))}..)))))....})..)))))}}}}),)))))}}}}},}}.,))}}}}..,,,..,,.{{{{{{....,,,,|{{{{.{||||||{{{.....,.))}},{((.((((((.......((((({{{(((,((.(({{{.......(((...........,.))).........}))}).)).})))))))))........)))))).))}|||,....,,,||||{,.,.}}))})))))}...,,})),,,,.......||,||||,,...}))},})))),)})))))))),........))))((..(((((...(((..,..(((((((.((((((((....{{.(({,.........,,.{,.....,{||,|(((((((.,((((((((.........(((((...))))).....)))))))}...,,.)))))))}.,}},..,,...........||.|}}.,....,)}}))))))).)))))))..,..)))...)))))...))
Back