Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ANKRD36_0006200

Sequence Length

950 nt

GC Content

0.4158

GUGUCUCUACCUACUGGACCGUUUUGCACAGCCUGUGACAAAGGAUAAGUUUGCUUUGGAAUCUGAGAAUAUUUCAGAACCAUACUUUACGAACAGAAGGACUAUUUCUCAACAAUCUGCAGAAAAUUUAGAUGCUGCAUGUGGCAUUGACAAAACAGAAAAUGGAAACAUGUUUGAAGACCAAAAUGUUGAUAAGGAAGGAAAAGCACUACCAGCAACUGGACAAAAAGCAAAUGUGUCUCCUGAGCAACCGCCUUUAUUCACGCAUACGGUGAAAGACAGAGAUCACAUUUCAACUAGAUUCUUAGGAGGUAUGGAUUCACUAACUUCCAGUGAAGAAUCUUCUGAGCGACCUCCUUUAUCCACGCUUACUCUGAAAGAGGCAGAUCCCAGUUCAAAAGCAGCCAUGAGAAGGAAGGAUUCACCACCUCCAGGAAAAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCUGAGAAGGCUACAAGUGACGACAAAGAUUCUGUUUCAAAUAUAGCCACAGAAAUAAAGGAGGGACCAAUAUCUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCUGAGAAGGCUACAAGUGACGAGAAAGAUUCUGUUUCAAAUAUAGCCACAGAAAUAAAGAAGGGACAACAAUCUGGGACAGUGUCUCCUCAGAAACAAUCGGCCUGGAAGGUUAUAUUUAAAAAGAAAGUUUCUCUUUUGAAUAUUGCCACAAGAAUAAUGGGUGGUGGGAAAUCUGGAACAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCCUCAAAGGCUACAAGUGACAAGACAGAUUCUGCUUUGAAUAUAGCUACAGAAAUAAAGGAUGGACUACAGUGUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCCUUGAAGGCUACAACUGACGAGGAAGACUCUGUUUCGAAUAUAGCCACAGAAAUAAAGGAUGGAGAAAAAUCUGGGACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-236.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -252.72

Frequency: 0.0000

Diversity: 282.18

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((.(((((((((((((..(((((((.(((.((((((..(((((.(......).)))))...(((((((...))))))).(((((((((.......(((((.(..((.((((....((((...........((((((......)))))).......))))....(((.(((((((((...........((((....((.((........)).))..))))...........))))))))).))))))).))..)))))).(((((.......))))).....(((((...)))))..((((....)))))))))))))..........((((((.(..((...(((((((.((((((((((((..((((((..((((...((((..(((((...(((.....((....)).....)))))))).....))))))))..)))))).(((((((..........)))))))(((((....(((.((((.......)))))))....)))))......))))))))))..(((.....)))((((.(((((((((((..........)))))).(((((....(((..((((...))))...)))....))))).((((...................))))))))).)))))))))))))....))..)))))))(((.((((((((((((((...)))).)))))))))).))).........)))))).))).)))))..))..))))(((((.(((.........(((((...))))).....))).)))))...(((((((........)))...))))........(((.(((.....((((((((.(((((((..(........(((((...)))))........)..))))))).))))))))....)))))).........))).))))))...))(((...)))

Thermodynamic Ensemble Prediction

((.(((((((((,(({..({,{((({(((,,,,|||}.||||{,{...{,,|,|||||{..(((((((...))))))).}}|..{{{{......,|||{,....|||||,.......{((({..........,.)}}}}{(({{({,{..,....,,,...,|({,.{|||{{(({....,|,....((((....((.((........)).}),,))})}}}.......,))}}|||}}||||,,.,{.,{{||{{{{{((({(......,)))},.....||||{|,|||}||..{{((,{{{||}|{{||{,|||,,,,.},.,}||||{{.{,,||,},|((((((.{,((((((((((..((((((..((((...((((..(((((...(((.....{{....)).....)}}))))).....))))))))..)))))).(((((((..........)))))))(((((....(((.((((.......)))))))....)))))......))))))))))..(({.....)))((((.(((((((((((..........)))))),(((({....{((.,((({...|))).,,}}}....))))).{{{,......,...{.....,..)))}})))).))))))))))))}....}}..}))))},|({.((((((((((((({...}))),)))))))))).)))....,,,,,}.))))}))},,,.,|.|||{{|||.((((({({,,........(((((..{|||||.....|||.|||||{..{((((({........}}}..,}}},........{(|.((({...}|||{{||,,|||||,|}}.........|||||}..)))))........,..))))))).))))))))....,,))))),.......))).))))))...))(((...)))