Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ANKRD36_0007200
Sequence Length
1422 nt
GC Content
0.4170
AAUAUUUCAGAACCAUACUUUACGAACAGAAGGACUAUUUCUCAACAAUCUGCAGAAAAUUUAGAUGCUGCAUGUGGCAUUGACAAAACAGAAAAUGGAAACAUGUUUGAAGACCAAAAUGUUGAUAAGGAAGGAAAAGCACUACCAGCAACUGGACAAAAAGCAAAUGUGUCUCCUGAGCAACCGCCUUUAUUCACGCAUACGGUGAAAGACAGAGAUCACAUUUCAACUAGAUUCUUAGGAGGUAUGGAUUCACUAACUUCCAGUGAAGAAUCUUCUGAGCGACCUCCUUUAUCCACGCUUACUCUGAAAGAGGCAGAUCCCAGUUCAAAAGCAGCCAUGAGAAGGAAGGAUUCACCACCUCCAGGAAAAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCUGAGAAGGCUACAAGUGACGACAAAGAUUCUGUUUCAAAUAUAGCCACAGAAAUAAAGGAGGGACCAAUAUCUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCUGAGAAGGCUACAAGUGACGAGAAAGAUUCUGUUUCAAAUAUAGCCACAGAAAUAAAGAAGGGACAACAAUCUGGGACAGUGUCUCCUCAGAAACAAUCGGCCUGGAAGGUUAUAUUUAAAAAGAAAGUUUCUCUUUUGAAUAUUGCCACAAGAAUAAUGGGUGGUGGGAAAUCUGGAACAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCCUCAAAGGCUACAAGUGACAAGACAGAUUCUGCUUUGAAUAUAGCUACAGAAAUAAAGGAUGGACUACAGUGUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCCUUGAAGGCUACAACUGACGAGGAAGACUCUGUUUCGAAUAUAGCCACAGAAAUAAAGGAUGGAGAAAAAUCUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAGCAACCAGCCUUGAAGGCUACAACUGACGAGGAAGAUUCUGUUUCGAAUAUAGCCACAGAAAUAAAGGAUGGAGAAAAAUCUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCCUUGAAGGCUACAACUGAUGAGAAAGAUUCUGUUUCGAACAUAGCCACAGAAAUAAAGGAUGGAGAAAAAUCUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAACCACCAGCCUUGACGGCUACAAGUGACGAGGAAGGUUCUGUUUUGAGUAUAGCCAGAGAAAACAAGGAUGGAGAAAAAUCUAGGACAGUGUCUUCUCGGAAAAAACCAGCCUUGAAGGCUACAAGUGAUGAGAAGGAUUCUUUUUCGAAUAUAACCAGAGGAAAAAAGGAUGGAGAAAUAUCUAGGAAAGUGUCUUCUCAGAAACCACCAACCUUGAAGGGUACAAGUGACGAGGAAGAUUCUGUUUUGGGUAUAGCCAGAGAAAACAAGGAUGGAGAAAAAUCUAGGACAGUGUCUUCUGAGAAACCACCAGGCUUGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-368.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -394.03
Frequency: 0.0000
Diversity: 441.97
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....((((...(((((((((.......(((((.(..((.((((....((((...........((((((......)))))).......))))....(((.(((((((((...........((((....((.((........)).))..))))...........))))))))).))))))).))..)))))).(((((.......))))).....(((((...)))))..((((....))))))))))))).((((((.......)))))).....(((((((.((((((((((((..((((((..((((...((((..(((((...(((.....((....)).....)))))))).....))))))))..)))))).(((((((..........)))))))(((((....(((.((((.......)))))))....)))))......))))))))))..(((.....)))((((.(((((((((((..........)))))).(((((....(((..((((...))))...)))....))))).((((...................))))))))).)))))))))))))......(((((((..((((((((((((((((((..(((((((.((...((((.(((.........)))(((((......((.(((((((.(((((((..(........(((((..((((((.....(((.((((((..(((((((........)))...))))........((..((((...))))..)).)))))).))).........))))))..)))))........)..))))))).))))))))).....)))))...))))...)).)))))))....((((((((.(((((((((..((.....((((((.((((((........(..(((((((.(((((((((......(((.............))).......)).))))))).)))))))..)........)))))).))))))....))..)))).))))).)))))))).((((.(((.((((...................)))))).).))))(((((((...((....((((((.(.((((.....(..((((.((((..(((((((((......(((.............))).......)).)))))))..))))))))..)......)))).).))))))....))..)))))))..)))))))).))))))))))((((((........((((......))))........)))))).......(((..((((....))))....))).(..(((((((.(((((((((((.(..(((.............)))..)...))))))))))).)))))))..)......))))))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
....,((({,..{{,,.((((...,..,{{{{,..,.{|||{{,......{({({..........,.}}}}}{(({{({{{....,,,{{{{..,|(,..{|||{{(({....,||...,{{{{....((.((........)).|),,}}})))).......,}||||||||{|||{{.{{....|},,,,.(((((......,))))}.,.}})}}}.}}})))}|...,{({{{(({,((((((.|{|..,,.||.}}}}}}.,,}))}}}}}|{{{{{{.{,((((((((((..((((((..((((...((((..(((((...(((.....{{....)}.,...}}}))))).....))))))))..)))))),(((((((..........)))))))|((((....(((.((((.......)))))))....)))))......))))))))))..{{{.....}}|{(({,(((((((((((..........))))))}|||{|....|{{,.{{{,...})))}}})}}....)}))).||{,......,,.,{,.,..,..}|}}})))).)))))))))})},.....,{((((((..(((,((((((((((((({...|||},}}))))))}}.|||.,.........|||{(((((....({(((({{{{.{((((((({...,,....(((((..((((((.....{,,{(((((({{,((({(({{{....,|||,..............(({.(((,...,|||{{|{{,|||||{||}.........|||||}..)))))........,..})))))).))))))))....,,}))}}.........,{,{||......,}}|(((((((.(((((((((..((.....((((((.((((((........,..(((((((.((((((((,...,..(({{..........,.))).......)}}))))))).))))))),.}........)))))).))))))....))..))))}}}))).))))))),..,.{,{{{.,.......,{{{.{{{.......{((((((......,,))))))).....}}|.||||...||||,...,}..})))),}}}.)))}))))),......{{.((({{.{({....{{{{......)))).,,}..))).)))))||......,.))))}).,)))))....})..))))))),{|||||||||},,,....,,,{{{||.....,,,|(((......)))}........))))))}}},..}}}}}.{|||....})}}....{{..(..(((((((.(((((((((((.{..(((.............)))..,...))))))))))).)))))))..)..}}..))))))))))),
Back