Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ANKRD36_0007300
Sequence Length
1728 nt
GC Content
0.4161
AAUAUUUCAGAACCAUACUUUACGAACAGAAGGACUAUUUCUCAACAAUCUGCAGAAAAUUUAGAUGCUGCAUGUGGCAUUGACAAAACAGAAAAUGGAAACAUGUUUGAAGACCAAAAUGUUGAUAAGGAAGGAAAAGCACUACCAGCAACUGGACAAAAAGCAAAUGUGUCUCCUGAGCAACCGCCUUUAUUCACGCAUACGGUGAAAGACAGAGAUCACAUUUCAACUAGAUUCUUAGGAGGUAUGGAUUCACUAACUUCCAGUGAAGAAUCUUCUGAGCGACCUCCUUUAUCCACGCUUACUCUGAAAGAGGCAGAUCCCAGUUCAAAAGCAGCCAUGAGAAGGAAGGAUUCACCACCUCCAGGAAAAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCUGAGAAGGCUACAAGUGACGACAAAGAUUCUGUUUCAAAUAUAGCCACAGAAAUAAAGGAGGGACCAAUAUCUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCUGAGAAGGCUACAAGUGACGAGAAAGAUUCUGUUUCAAAUAUAGCCACAGAAAUAAAGAAGGGACAACAAUCUGGGACAGUGUCUCCUCAGAAACAAUCGGCCUGGAAGGUUAUAUUUAAAAAGAAAGUUUCUCUUUUGAAUAUUGCCACAAGAAUAAUGGGUGGUGGGAAAUCUGGAACAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCCUCAAAGGCUACAAGUGACAAGACAGAUUCUGCUUUGAAUAUAGCUACAGAAAUAAAGGAUGGACUACAGUGUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCCUUGAAGGCUACAACUGACGAGGAAGACUCUGUUUCGAAUAUAGCCACAGAAAUAAAGGAUGGAGAAAAAUCUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAGCAACCAGCCUUGAAGGCUACAACUGACGAGGAAGAUUCUGUUUCGAAUAUAGCCACAGAAAUAAAGGAUGGAGAAAAAUCUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCCUUGAAGGCUACAACUGAUGAGAAAGAUUCUGUUUCGAACAUAGCCACAGAAAUAAAGGAUGGAGAAAAAUCUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAACCACCAGCCUUGACGGCUACAAGUGACGAGGAAGGUUCUGUUUUGAGUAUAGCCAGAGAAAACAAGGAUGGAGAAAAAUCUAGGACAGUGUCUUCUCGGAAAAAACCAGCCUUGAAGGCUACAAGUGAUGAGAAGGAUUCUUUUUCGAAUAUAACCAGAGGAAAAAAGGAUGGAGAAAUAUCUAGGAAAGUGUCUUCUCAGAAACCACCAACCUUGAAGGGUACAAGUGACGAGGAAGAUUCUGUUUUGGGUAUAGCCAGAGAAAACAAGGAUGGAGAAAAAUCUAGGACAGUGUCUUCUGAGAAACCACCAGGCUUGAAGGCUUCAAGUGCCGAGAAAGAUUCUGUUUUGAAUAUAGCCAGAGGAAAAAAGGAUGGAGAAAAAACUAAGAGAGUGUCUUCUCGGAAAAAACCAUCCUUGGAGGCCACAAGUGAUGAGAAGGAUUCUUUUUCGAAUAUAACCAGAGAAAAAAAGGAUGGAGAAAUAUCUAGGAAAGUGUCUUCUCAGAAACCACCAGCCUUGAAGGGUACAAGUGACGAGGAAGAUUCUGUUUUGGGUAUAGCCAGAGAAAACAAGGAUGGAGAAAAAUCUAGGACAGUGUCUUCUGAGAAACCACCAGGCUUGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-453.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -484.73
Frequency: 0.0000
Diversity: 523.84
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....((((...(((((((((.......(((((.(..((.((((....((((...........((((((......)))))).......))))....(((.(((((((((...........((((....((.((........)).))..))))...........))))))))).))))))).))..)))))).(((((.......))))).....(((((...)))))..((((....))))))))))))).((((((.......)))))).....(((((((.((((((((((((..((((((..((((...((((..(((((...(((.....((....)).....)))))))).....))))))))..)))))).(((((((..........)))))))(((((....(((.((((.......)))))))....)))))......))))))))))..(((.....)))((((.(((((((((((..........)))))).(((((....(((..((((...))))...)))....))))).((((...................))))))))).)))))))))))))......(((((((..((((((((((((((((((..((((((.((((((....(((.((((.....(((.((((((....((((........((((((((...((....(((((..((((((........(((((((((.(((.(((((.......................(((.(((.....((((((((.(((((((..(........(((((...)))))........)..))))))).))))))))....))))))..........((((........))))(((((((.(((((((((..((.....((((((.((((((........(..(((((((.(((((((((......(((.............))).......)).))))))).)))))))..)........)))))).))))))....))..)))).))))).))))))).....(((((.........((((.(((.......(((((((........))))))).....))).))))...))))).......))))).))).))))))))).......((.(((((.(((....((((......))))......))).)))))))........))))))..)))))....))..))))))))((((......))))......((((((........((((......))))........))))))))))..))))))((((....))))....((..(..(((((((.(((((((((((.(..(((.............)))..)...))))))))))).)))))))..)..))..)))..))))..)))))))))....))))))..)))).))))))))))))))................(((((...(((.....)))...)))))((......))((((((.(((((.....((..(((((((.((.((((((...((((..(((.............)))....))))...)))))).)))))))))...)).....))))).))))))....((..(..(((((((.(((((((((((.(..(((.............)))..)...))))))))))).)))))))..)..))..))))))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
....,((((,..{{,,.((((......,{|{|,....{||||{.......{((({..........,.)}}}}{(({{({{{....,,,{{{{..,|(,,.{|||{{(({....,|,...,(({{....((.((........)).}),,))})))).......,}||||||||{|||{{.{{....|},,,,.(((((......,))))}.,.}}}}}}.}}})))}|....{({(((({,((((((.|{|..,,.||.}}}}}}.,,}))}}}}}|{{((((.{,((((((((((..((((((..((((...((((..(((((...(((.....{{....)).,...}}}))))).....))))))))..)))))),(((((((..........)))))))|((((....(((.((((.......)))))))....)))))......))))))))))..{{{.....}}}{(((.(((((((((((..........))))))}|||{{....{{{,.{{{,...})))}}})}}....)}))).||{,......,,.,{,....,..}}}}})))).)))))))))))),.....,{((((((..(((,((((((((((((({...|}}),)))))))))).}}}...........((,((((((....((((({{,{,..((((((((...{(....,(((({.,,((((,....,..(((((((((.(((.(((((....,|{{,..............(((.(((...,.((((((((.((((((({,,........(((((,..}))))........,..})))))).)))))))}....}}}))},.........,{,{,,......,))}(((((((.(((((((((..((.....((((((.((((((........,..{((((((.((((((((....,..({{{..........,.))).......)}}))))))).))))))),.}........)))))).))))))....))..))))}}}))).))))))),....{{|||.........{{((.{((.......(((((((........))))))).....))}.))))...))))}...}}..))))).})).)))))))))..,.}}}||........(({{({(((,......|}||{{{{{{.{{{{||||({........||{(({.{((,||....{{..{((({{|{{(,(((((({...,....,,,..,},.....,,,|||,....,,))}.,}},}}.,))))))))....}|||..{{({....))})....||,.(..(((((((.(((((((((((.{..(((.............)))..,...))))))))))).)))))))..)..,,,,,.}}|)))|}})})),,,,,..)))))}}}}}).))}))))}.......(({,,,,,........||(,,,....,||,....}},.}}))))}}}......))||||||}|||||.....||..||||||||{{,(((((({.........,...}},,....||||||,....}})}}.,}},}}.}))))))))},.,)}}}}}}))}}.,,}}}}....{{..(..(((((((.(((((((((((.{..(((.............)))..,...))))))))))).)))))))..)..))..))))))))))},
Back