Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ANKRD36_0008000
Sequence Length
1973 nt
GC Content
0.4166
UAGAUGCUGCAUGUGGCAUUGACAAAACAGAAAAUGGAAACAUGUUUGAAGACCAAAAUGUUGAUAAGGAAGGAAAAGCACUACCAGCAACUGGACAAAAAGCAAAUGUGUCUCCUGAGCAACCGCCUUUAUUCACGCAUACGGUGAAAGACAGAGAUCACAUUUCAACUAGAUUCUUAGGAGGUAUGGAUUCACUAACUUCCAGUGAAGAAUCUUCUGAGCGACCUCCUUUAUCCACGCUUACUCUGAAAGAGGCAGAUCCCAGUUCAAAAGCAGCCAUGAGAAGGAAGGAUUCACCACCUCCAGGAAAAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCUGAGAAGGCUACAAGUGACGACAAAGAUUCUGUUUCAAAUAUAGCCACAGAAAUAAAGGAGGGACCAAUAUCUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCUGAGAAGGCUACAAGUGACGAGAAAGAUUCUGUUUCAAAUAUAGCCACAGAAAUAAAGAAGGGACAACAAUCUGGGACAGUGUCUCCUCAGAAACAAUCGGCCUGGAAGGUUAUAUUUAAAAAGAAAGUUUCUCUUUUGAAUAUUGCCACAAGAAUAAUGGGUGGUGGGAAAUCUGGAACAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCCUCAAAGGCUACAAGUGACAAGACAGAUUCUGCUUUGAAUAUAGCUACAGAAAUAAAGGAUGGACUACAGUGUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCCUUGAAGGCUACAACUGACGAGGAAGACUCUGUUUCGAAUAUAGCCACAGAAAUAAAGGAUGGAGAAAAAUCUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAGCAACCAGCCUUGAAGGCUACAACUGACGAGGAAGAUUCUGUUUCGAAUAUAGCCACAGAAAUAAAGGAUGGAGAAAAAUCUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCCUUGAAGGCUACAACUGAUGAGAAAGAUUCUGUUUCGAACAUAGCCACAGAAAUAAAGGAUGGAGAAAAAUCUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAACCACCAGCCUUGACGGCUACAAGUGACGAGGAAGGUUCUGUUUUGAGUAUAGCCAGAGAAAACAAGGAUGGAGAAAAAUCUAGGACAGUGUCUUCUCGGAAAAAACCAGCCUUGAAGGCUACAAGUGAUGAGAAGGAUUCUUUUUCGAAUAUAACCAGAGGAAAAAAGGAUGGAGAAAUAUCUAGGAAAGUGUCUUCUCAGAAACCACCAACCUUGAAGGGUACAAGUGACGAGGAAGAUUCUGUUUUGGGUAUAGCCAGAGAAAACAAGGAUGGAGAAAAAUCUAGGACAGUGUCUUCUGAGAAACCACCAGGCUUGAAGGCUUCAAGUGCCGAGAAAGAUUCUGUUUUGAAUAUAGCCAGAGGAAAAAAGGAUGGAGAAAAAACUAAGAGAGUGUCUUCUCGGAAAAAACCAUCCUUGGAGGCCACAAGUGAUGAGAAGGAUUCUUUUUCGAAUAUAACCAGAGAAAAAAAGGAUGGAGAAAUAUCUAGGAAAGUGUCUUCUCAGAAACCACCAGCCUUGAAGGGUACAAGUGACGAGGAAGAUUCUGUUUUGGGUAUAGCCAGAGAAAACAAGGAUGGAGAAAAAUCUAGGACAGUGUCUUCUGAGAAACCACCAGGCUUGAAGGCUACAAGUGAUGAGAAAGAUUCUGUUUUGAAUAUAGCCAGAGGAAAAAAGGAUGGAGAAAAAACUAGGACAGUGUCUUCUCAGAAACCACCAACCUUGAAGGCUACAAGUGAUGAGGAAGAUUCUGUUUUGAGUAUAGCCAGAGAAAACAAGGAUGGAGAAAAAUCUAGGACAGUGUCUUCUGAGAAACCAUCAGGCUUGAAGGCUACAAGUGCCGAGAAAGAUUCUGUUUUGAAUAUAGCCAGAGGAAAAAAGUAUGGAGAAAAAACUAAGAGAGUGUCUUCUCGGAAAAAACCAGCCUUGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-532.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -567.67
Frequency: 0.0000
Diversity: 429.43
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((..(.((((((...((((((((((...(((.(((((((((...........((((....((.((........)).))..))))...........))))))))).)))...((....)).....(((((.......))))).....(((((...)))))..((((((.((((((((((.....((((((.......))))))..))))))))))...((((((((((..((((((..((((...((((..(((((...(((.....((....)).....)))))))).....))))))))..)))))).(((((((..........)))))))(((((....(((.((((.......)))))))....)))))......)))))))))).......))))))((((.(((((((((((..........)))))).(((((....(((..((((...))))...)))....))))).((((...................))))))))).))))((((((...((....(((((..((((((((((((((((((((...)))).)))))))))).(((.((.......)))))(((((....(((((((((.(((((((((............((((...(((((...((..(((((((((.((((((........)))...............(((.(((.....((((((((.(((((((..(........(((((...)))))........)..))))))).))))))))....))))))..........((.((((((....)))(((((((.(((((((((..((.....((((((.((((((........(..(((((((.(((((((((......(((.............))).......)).))))))).)))))))..)........)))))).))))))....))..)))).))))).)))))))..((((.(((.((((...................)))))).).))))(((((((...((....((((((.(.((((.....(..((((.((((..(((((((((......(((.............))).......)).)))))))..))))))))..)......)))).).))))))....))..))))))).((((......))))......((((((........((((......))))........))))))......))))).((((....))))....((..(..(((((((.(((((((((((.(..(((.............)))..)...))))))))))).)))))))..)..))...((.(((((.((.((((((((.(((((((.(((.((.(((((.......(((.............))).........))))).)).))))))))))........((((((.(((((.....((..(((((((.((.((((((...((((..(((.............)))....))))...)))))).)))))))))...)).....))))).))))))....((..(..(((((((.(((((((((((.(..(((.............)))..)...))))))))))).)))))))..)..))......)))))))).)).)))))..))....))).))))))))).)).))))).))))...........))))........))))).)))..)).))))..)))))))))))..)))))....))..))))))...))))))))))...)).)))).)........((((........))))....)))))))).((((.......)))))(((.((((((.......(((((((.(((.((.(((((.......(((.............))).........))))).)).))))))))))........)))))).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
({(((((((,.({(((({{...,,((((((((..,(,,.{||{(((({....{{{....((((....((.((........)).))..))))}}}.....,,,)}|||||||{|||,{.{{....}},,,,.(((((.......))))}.,.}}}}}}.}}}))}||....{(((((((,((((((.,{,..,,,||,}}}}}}.,}}))}})))),,})}}...((((((((((..((((((..((((...((((..(((((...(((.....{{....)).,...}}}))))).....))))))))..)))))).(((((((..........)))))))(((((....(((.((((.......)))))))....)))))......))))))))))..{{{...,,}}}{{({,(((((((((((..........))))))}|||,|,..,|{,,.|||....))))))))},...,},)))}}},......,,,.,{.....,..|||||||||{,|||((((((...((....(((((..{{(((,(((((((((((((,...,))).)))))))))).|||.,,.......,||||(((((....(((((((((.(((((((((.....,......((((...(((((...((..(((((((((.((((((........)))............,,.((,.((((...}|||,,||..{{(((((((...{{....((((((.((((((.....,..{{{{{(((((.((((({{|....,..{{{,.........,{.{{{.......}}|(((((((.(((((((((..((.....((((((.((((((........,..(((((((.((((((((,......(({{..........,.))).......),}))))))).))))))),.}........)))))).))))))....))..))))}}}))).))))))),....,..||,{.........,,.|}|.......|||||||},},}}||||||||{,.,.{{{,.(((({.,{{{{....}),.}}}}}..}}}.||||||||},.....|||,,.....,..,,.|||,......)))}}))))).))))))))).........)))))).))))))....))..))))))),{(((((((((.............,)}}},}}}}}|{{{....,,}}}......|||,,||||||,....{,|..{(({,...})}}....||,.|..|{{((((.(((((((((((.{..(((.............)))..,...))))))))))).)))))))},),,.,}}}{{.(((((.((.((((((((.(((((((((((.((.(((((.......(((.............))).........})))).)).))))))))))........((((((.(((((.....((..((((((((((.((((((,..,{,,..{{{.............}|}....,)))},.}))))).}))))))))...)).....))))).))))))....((..(..(((((((.(((((((((((.{..(((.............)))..,...))))))))))).)))))))..)..}},.....)))))))).)).)))))..}}....))).))))))))).)).))))).))))......,....))))........))))).)))..)).))))..)))))))))))..)))))....))..)))))),}}),)))))}}}...,..}))),}.....,..{{{(,.......})))..}.)))))))).((((.....,.)))))(((.((((((.......(((((((((((.((.(((((.......(((.............))).........})))).)).))))))))))........)))))).)))
Back