Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ANKRD36_0008700
Sequence Length
2600 nt
GC Content
0.4131
UGUCUCCUGAGCAACCGCCUUUAUUCACGCAUACGGUGAAAGACAGAGAUCACAUUUCAACUAGAUUCUUAGGAGGUAUGGAUUCACUAACUUCCAGUGAAGAAUCUUCUGAGCGACCUCCUUUAUCCACGCUUACUCUGAAAGAGGCAGAUCCCAGUUCAAAAGCAGCCAUGAGAAGGAAGGAUUCACCACCUCCAGGAAAAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCUGAGAAGGCUACAAGUGACGACAAAGAUUCUGUUUCAAAUAUAGCCACAGAAAUAAAGGAGGGACCAAUAUCUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCUGAGAAGGCUACAAGUGACGAGAAAGAUUCUGUUUCAAAUAUAGCCACAGAAAUAAAGAAGGGACAACAAUCUGGGACAGUGUCUCCUCAGAAACAAUCGGCCUGGAAGGUUAUAUUUAAAAAGAAAGUUUCUCUUUUGAAUAUUGCCACAAGAAUAAUGGGUGGUGGGAAAUCUGGAACAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCCUCAAAGGCUACAAGUGACAAGACAGAUUCUGCUUUGAAUAUAGCUACAGAAAUAAAGGAUGGACUACAGUGUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCCUUGAAGGCUACAACUGACGAGGAAGACUCUGUUUCGAAUAUAGCCACAGAAAUAAAGGAUGGAGAAAAAUCUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAGCAACCAGCCUUGAAGGCUACAACUGACGAGGAAGAUUCUGUUUCGAAUAUAGCCACAGAAAUAAAGGAUGGAGAAAAAUCUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCCUUGAAGGCUACAACUGAUGAGAAAGAUUCUGUUUCGAACAUAGCCACAGAAAUAAAGGAUGGAGAAAAAUCUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAACCACCAGCCUUGACGGCUACAAGUGACGAGGAAGGUUCUGUUUUGAGUAUAGCCAGAGAAAACAAGGAUGGAGAAAAAUCUAGGACAGUGUCUUCUCGGAAAAAACCAGCCUUGAAGGCUACAAGUGAUGAGAAGGAUUCUUUUUCGAAUAUAACCAGAGGAAAAAAGGAUGGAGAAAUAUCUAGGAAAGUGUCUUCUCAGAAACCACCAACCUUGAAGGGUACAAGUGACGAGGAAGAUUCUGUUUUGGGUAUAGCCAGAGAAAACAAGGAUGGAGAAAAAUCUAGGACAGUGUCUUCUGAGAAACCACCAGGCUUGAAGGCUUCAAGUGCCGAGAAAGAUUCUGUUUUGAAUAUAGCCAGAGGAAAAAAGGAUGGAGAAAAAACUAAGAGAGUGUCUUCUCGGAAAAAACCAUCCUUGGAGGCCACAAGUGAUGAGAAGGAUUCUUUUUCGAAUAUAACCAGAGAAAAAAAGGAUGGAGAAAUAUCUAGGAAAGUGUCUUCUCAGAAACCACCAGCCUUGAAGGGUACAAGUGACGAGGAAGAUUCUGUUUUGGGUAUAGCCAGAGAAAACAAGGAUGGAGAAAAAUCUAGGACAGUGUCUUCUGAGAAACCACCAGGCUUGAAGGCUACAAGUGAUGAGAAAGAUUCUGUUUUGAAUAUAGCCAGAGGAAAAAAGGAUGGAGAAAAAACUAGGACAGUGUCUUCUCAGAAACCACCAACCUUGAAGGCUACAAGUGAUGAGGAAGAUUCUGUUUUGAGUAUAGCCAGAGAAAACAAGGAUGGAGAAAAAUCUAGGACAGUGUCUUCUGAGAAACCAUCAGGCUUGAAGGCUACAAGUGCCGAGAAAGAUUCUGUUUUGAAUAUAGCCAGAGGAAAAAAGUAUGGAGAAAAAACUAAGAGAGUGUCUUCUCGGAAAAAACCAGCCUUGAAGGCUACAAGUGACGAGAAAGAUUCUGUUUUGUAUAUAGCCAGAGAAAAAAAGGAUGGAGAAAAAUCUAGGACAGUGUCUUCUCCGAAACAACCAGCAUUGAAGGCUAUCUGUGACAAGGAAGAUUCUGUUCCGAAUAUGGCCACGGAAAAAAAGGAUGAACAAAUAUCUGGGACAGUGUCUUGUCAGAAACAACCAGCCUUGAAGGCUACAAGUGACAAGAAAGAUUCUGUUUCGAAUAUACCCACAGAAAUAAAGGAUGGACAACAAUCUGGAACAGUGUCUUCUCAGAAACAACCGGCCUGGAAGGCUACAAGUGUCAAGAAAGAUUCUGUUUCGAAUAUAGCCACAGAAAUAAAGGAUGGACAAAUACGUGGGACAGGUAUUUUGGAAUACACCUUUAAUGUAAUGUUCGAUCAAAUAGAAGAGAAAUUCACUUCCCUAAAUAAAUCAGCGGGGGUGUCUCCUCAGAAACAAUCGGCCCAGAAGGUUAUAUUUAAAAAGAAAGUUUCUCUUUUGAAUAUUGCCACAAGAAUAACAGGCGGUUGGAAAUCUGGAACAGAGUAUCCUGAGAAUCUGCCCACCUUGAAGGCUACAAUUGAAAAUAAAAAUUCUGUUCUGAAUACAGCCACCAAAAUGAAGGAUGUACAAACAUCCACACCAGCAGAACAAGACUUAGAAAUGGCAUCAGAGGGAGAGCAAAAGAGGCUUGAAGAAUAUGAAAAUAACCAGCCACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-689.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -737.21
Frequency: 0.0000
Diversity: 556.85
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((((....((((((((((((.......))))).....(((((...)))))...(((((((((((((........((((((.......)))))).....(((((((.((((((((((((..((((((..((((...((((..(((((...(((.....((....)).....)))))))).....))))))))..)))))).(((((((..........)))))))(((((....(((.((((.......)))))))....)))))......))))))))))..(((.....)))((((.(((((((((((..........)))))).(((((....(((..((((...))))...)))....))))).((((...................))))))))).))))))))))))).((((((.((((...(((.(((((((((((((((.(((((.((((((((((.(((..........(((((.(((((.....((((((((.(((((((.....((....(((((..((((((.....((((((((((...((((((........)))...............(((.(((.....((((((((.(((((((..(........(((((...)))))........)..))))))).))))))))....))))))..........((((........))))(((((((.(((((((((..((.....((((((.((((((........(..(((((((.(((((((((......(((.............))).......)).))))))).)))))))..)........)))))).))))))....))..)))).))))).))))))).......((((..........((((........))))(((((((.(((((((.....((....((((((.(..(((....((..((.((((((..(((((((((......(((.............(((.........((((((((.(((((((((..(......((((((.((((((....((..(((((((.((.((((((...((((..(((.............)))....))))...)))))).)))))))))...))(((..((((....))))....))).(..(((((((.(((((((((((.(..(((.............)))..)...))))))))))).)))))))..)..........(((((.((.((((((((.(((((((.(((.((.(((((.......(((.............))).........))))).)).))))))))))........((((((.(((((.....((..(((((((.((.((((((...((((..(((.............)))....))))...)))))).)))))))))...)).....))))).))))))....((..(..(((((((.(((((((((((.(..(((.............(((.......((.(((((((.(((((((.....((....((.(((.((((......((..((((((.(((.((((((((.......(((.............))).........)))))))).)))))))))...))......)))).))).))....)).....))))))).)))))))))......))).............)))..)...))))))))))).)))))))..)..))......)))))))).)).))))).(((((((.(((.((.(((((.......(((.............))).........))))).)).))))))))))........)))))).)))))).....)..)))).))))).)))))))).......))).............))).......)).)))))))..)))))).))..))....)))..).))))))....)).....))))))).))))))).....))))............(((((......))))).)))...)))))))))).........))))))..)))))....))....)).))))).))))))))......))))).........((((........))))(((((((.(((((((..((.((....(((((...)))))....)).)).)).))))).)))))))((((((.((........((((((.((..(((((((.((...)).))).)))).....))))))))..)).)))))).........((.((((....(((((((((.........)).))))))))))).))...........)))))...))).))))))))))))))).))))).)))))))))).)))..........))))))))))....((((...))))...))))))))))))).......)))))))...................(((((((((........((......))..((((((....)))))).......)))))).)))..........)).))...)))))).)).....((((....................))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((({,{(....(((((({(((((.......))))}.....{{(((..,|||||...{((((((((((((,,,.,{{,{{({{{...,,,.}}}}},,,}}}|((((((.{,((((((((((..((((((..((((...((((..(((((...(((.....({....)).....))}))))).....))))))))..)))))).(((((((..........)))))))(((((....(((.((((.......)))))))....)))))......))))))))))..{{{.....}}|((((.(((((((((((..........)))))),(((((....{((..((({...}))),,,}))....))))).{{{,......,...,.....,..)))}})))).)))))))))))),.(((((,,((((..,(((.(((((((((((((((.(((((.((((((((((.(((..........(((((.(((((..,{.((((((((.(((((((.....((....(((((,.((((((.....((((((((((..,((((((........)))...,,,.........(((.(((...,.((((((((.(((((((,.,........(((((...|)))}........,..}}}}))).)))))))}....}}}}}},.........,{{{,,......}))}(((((((.(((((((((..((.....((((((.((((((........,..{((((((.((((((((,...,..({{{..........,.))).......)}}))))))).))))))),.}........)))))).))))))....))..))))}}}))).))))))),......,{{,,.........,{,{,,......,))}(((((((.(((((((,.{..{{....((((((.{..(((....((..((.((((((,.(((((((({......(((.............(((......,|,{(((((((.(((((((((..{......((((((.((((((....((..((((((({((.(((((({...,....{{,...,......,,,|||.....}})}}.}}}}}}.}))))))))...}}{{{..((((....))))....||}.(..(((((((.(((((((((((.{..(((.............)))..,...))))))))))).)))))))..)...,,.....(((((.((.((((((((.(((((((((((.((.(((((.......(((.............))).........})))).)).))))))))))........((((((.(((((.....((..((((((((((.((((((,..,{,,..{{{.............}|}....,)))},.}))))).}))))))))...)).....))))).))))))....((..(..(((((((.(((((((((((.{..(((.............|||..,...}||}|||||||.|||||||..}..||....{{,|||,|||{,,.,,,|{..(((({{{(((.((((((((.......(((.............))).........)))))))).)))))))))...}}......)))).})).)}....}|..|,.|||||||.|||||||||......|||.............)))..,...}))}))))))).)))))))..,..,,,.,,,.)))))))).)).))))}.(((((((((((.((.(((((.......(((.............))).........})))).)).))))))))))........)))))).)))))).....}..))))}}}))).)))))))).,,.,..))).............)))..,....)),))))))).,)))))).))..))....)))..).))))))...,))..,..))))))).))))))),....||,|{.{{,,......,,.,...,...,.)))))),},.)))))))))).........))))))..)))))....))....))}}}))).)))))))).,,.,.))))).........{({({.....,.,))}(((((((.(((((((..({.((....(((((...)))))....)).)).))}))))).))))))){{{{{{.,,.,,.....((((((.((..(((((((.((...)).))))))}).....)))))))).})).})))))||,......((.((((....(((((((((.........)).))))))))))).))........,}.)))))...))).))))))))))))))).))))).)))))))))).))).......,..))))))))))....{(((...)))}...))))))))))))|,,.....}},})))...................{{(((((((........,.......}}..((((((....)))))).......))))))}.},....,...,})}.)),..)))))).)).....((((.{.............,...,))))....
Back