Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ANKRD36_0009000
Sequence Length
1326 nt
GC Content
0.4231
UGUCUCCUGAGCAACCGCCUUUAUUCACGCAUACGGUGAAAGACAGAGAUCACAUUUCAACUAGAUUCUUAGGAGGUAUGGAUUCACUAACUUCCAGUGAAGAAUCUUCUGAGCGACCUCCUUUAUCCACGCUUACUCUGAAAGAGGCAGAUCCCAGUUCAAAAGCAGCCAUGAGAAGGAAGGAUUCACCACCUCCAGGAAAAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCUGAGAAGGCUACAAGUGACGACAAAGAUUCUGUUUCAAAUAUAGCCACAGAAAUAAAGGAGGGACCAAUAUCUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCUGAGAAGGCUACAAGUGACGAGAAAGAUUCUGUUUCAAAUAUAGCCACAGAAAUAAAGAAGGGACAACAAUCUGGGACAGUGUCUCCUCAGAAACAAUCGGCCUGGAAGGUUAUAUUUAAAAAGAAAGUUUCUCUUUUGAAUAUUGCCACAAGAAUAAUGGGUGGUGGGAAAUCUGGAACAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCCUCAAAGGCUACAAGUGACAAGACAGAUUCUGCUUUGAAUAUAGCUACAGAAAUAAAGGAUGGACUACAGUGUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCCUUGAAGGCUACAACUGACGAGGAAGACUCUGUUUCGAAUAUAGCCACAGAAAUAAAGGAUGGAGAAAAAUCUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAGCAACCAGCCUUGAAGGCUACAACUGACGAGGAAGAUUCUGUUUCGAAUAUAGCCACAGAAAUAAAGGAUGGAGAAAAAUCUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCCUUGAAGGCUACAACUGAUGAGAAAGAUUCUGUUUCGAACAUAGCCACAGAAAUAAAGGAUGGAGAAAAAUCUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAACCACCAGCCUUGACGGCUACAAGUGACGAGGAAGGUUCUGUUUUGAGUAUAGCCAGAGAAAACAAGGAUGGAGAAAAAUCUAGGACAGUGUCUUCUCGGAAAAAACCAGCCUUGAAGGCUACAAGUGAUGAGAAGGAUUCUUUUUCGAAUAUAACCAGAGGAAAAAAGGAUGGAGAAAUAUCUAGGAAAGUGUCUUCUCAGAAACCACCAACCUUGAAGGGUACAAGUGACGAGGAAGAUUCUGUUUUGGGUAUAGCCAGAGAAAACAAGGAUGGAGAAAAAUCUAGGACAGUGUCUUCUGAGAAACCACCAGGCUUGAAGGCUUCAAGUGCCGAGAAAGAUUCUGUUUUGAAUAUAGCCAGAGGAAAAAAGGAUGGAGAAAAAACUAAGAGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-356.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -379.37
Frequency: 0.0000
Diversity: 389.00
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.(((((..........(((((.(((((.......))))).......((((.(((.((..((((....))))..)).))))))).......((((((.(..((...(((((((.((((((((((((..((((((..((((...((((..(((((...(((.....((....)).....)))))))).....))))))))..)))))).(((((((..........)))))))(((((....(((.((((.......)))))))....)))))......))))))))))..(((.....)))((((.(((((((((((..........)))))).(((((....(((..((((...))))...)))....))))).((((...................))))))))).)))))))))))))....))..)))))))((((((((((((((((((..((((((.((((((....(((.((((.....(((.((((((....((((........((((((((...((....(((((..((((((........(((((((((.(((.(((((.......................(((.(((.....((((((((.(((((((..(........(((((...)))))........)..))))))).))))))))....))))))..........((((........))))(((((((.(((((((((..((.....((((((.((((((........(..(((((((.(((((((((......(((.............))).......)).))))))).)))))))..)........)))))).))))))....))..)))).))))).))))))).....(((((.........((((.(((.......(((((((........))))))).....))).))))...))))).......))))).))).))))))))).......((.(((((.(((....((((......))))......))).)))))))........))))))..)))))....))..))))))))((((......))))......((((((........((((......))))........))))))))))..))))))((((....))))....((..(..(((((((.(((((((((((.(..(((.............)))..)...))))))))))).)))))))..)..))..)))..))))..)))))))))....))))))..)))).)))))))))))))))))))..........)))))....)((.....))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{.(((((.........,(((((.(((((.......)))}|,,,,,({{{((.,,{|{(..,,(({{{({|,((((({.|{|.....)},})}}}},,.,}}}}}}}|((((((.{{((((((((((..((((((..((((...((((..(((((...(((.....({....)).....)}}))))).....))))))))..)))))).(((((((..........)))))))(((((....(((.((((.......)))))))....)))))......))))))))))..(({.....}))((((.(((((((((((..........)))))).(((((....(((..((({...}))).,.}))....))))).{{{,......,...,........)))}})))).)))))))))))),....||,,|||||,.((({((((((((((((({..,{|||{}}||}}}}}}.|||.,,.,......||||{(({(....{{{({{{|{,.,((((((({...,{....(((((,.{{((((.....{..(((((((((.(((,(({{{.....|||,..............(((.(((...,.{(((((((.(((((((|,,........(((((,..}))))........,..})))))).)))))))}....}}}})},.........,{,{,,......,}}|(((((((.(((((((((..((.....((((((.((((((........,..{((((((.((((((((....,..({{{..........,.))).......)}}))))))).))))))),.}........)))))).))))))....))..))))}}}))).))))))),..,.{,{{{.,.......,,{{.{{{.......||||(((,,.,,,||}||||}}....,|}}.||||,..||||,...}}..))))).})),}}}}))))),,.....{{.{{{{{.{{{..,.{{{{......)))),,,},.))),)))))||........})))|).|}))))....}}..})))))}|{{{{{{{{{{,.,,....,,,,,{||.....,,,|(((......))),........)))))))),,..}}}}}.{||{....})}}....{{..(..(((((((.(((((((((((.{..(((.............)))..,...))))))))))).)))))))..)..}}..)})}})}}}}.|||,,.....}))))))}}}})))))))))},}}.}}}}},))))......,...)))))....,{{...,.),
Back