Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ANKRD36_0009600

Sequence Length

1459 nt

GC Content

0.3400

CAUACGGUGAAAGACAGAGAUCACAUUUCAACUAGAUUCUUAGGAGGUAUGGAUUCACUAACUUCCAGUGAAGGUAAAUUUGCCGCUACAAAUUUCGUUCUAGAAAAUGUAGAUGAAAAUAUUGAAAAUGCUCAUAGUUUUUUGAUUCCCACUUUUUAUCCAAGUGAGAUGGAAGGAUUUGAUGUAAAUAUGCUGAUGUUCUUGUUAAUAUCUUUGUUUAUAAAAUGAUUUUUAAGGCAUAAGGCGGACAUUUUACACGGUGAGCUCUAGCCCAAAUGCUUUUCCUUUAAAGUUGUCAUCAGCUAAAGAUCCCAGUUUUGAAUUCCUGUGCAUGUUAGGGAUUUGAGGAGGUGUAUUUUGACACUAAAUAUUUUCAGUGCUUCAAAAUUGAUUGCAAUACUCUUCUGUCUUCUUCAUCUAGAGAAAAGCUAUACCUGCUGACUUUACAAUUGUUUUAGAACUUCAACGCCUUUAUUUCAGCGUUGUUACAUUGAGAAUCUUAAUCACAUCUUCUGAUUACCGGAUUGAGUUUCUGCAUGUGUGUGUGUGUGUAUCUCUGAUUAAAAAUGAAUAAAAUGAUUAAUCAUUCUUUUGUAACUCUUUGGUAGAUACAGUGUUUUAAAACAAUGAUUCUGAGCUGUUUUGGCCUUAGAAUAUUUUCUUCUACUACUAUUUAUUGCCUACAGGUAACCAACAGCCUGAAUUAACGUUUUUACUUUUAAGUCACUGCAAUGCACAUUAAAAAUACUUUACAAGAUACUUGCACUUUCAUAGGUAAUAUGUGGAAUCUGUUUCCAAGUAUCAAGUCUUCUAUACGAUUUCACACAGUGUACAUAAUAGCUGCAACUCGGCUUUUGUAAUCAGUGGAAUAUAUUUCAGAUCUGUCCAGGUUGACACAGUUUGGUCAUCUUUGAUUUGUUUUAUGACUGCACCACAUAUUUGAUUUGUUUUAUGACUGCACCACAAUUAAUUAAAAUCUCUUCAUGCUGAUACAAAAUGAACAUAAAUAUGAUGACAUACCAACAUAGAUUUGCUUAUGUGGUUGCCUUUAUUGAUUUGUACUAUAAAGAAAUUAAAUAGAAGUAUUUCAGAUACCCCGAGUAUAGCUGUAUACACUGCCAUAGCUGAAAAACUCCAGUGUAUGCUUUUCAGAGAAUGACAUUGGAAAGAAGAAAUGGCCAAAGUAUCAUUUGGUACCUUGGCUUCCUUACAUAGAUGAUGAACUCCAGGAAUGAUCAAAUCACAGUUUAGAACCCCUUUGUUGGGCCCUAUAAAGGGUUUCCAGGUGUCAAAUGAUAGUCUCCAGAUAAAGAAAUGCUCUAUAAUGCCUCACCGCUGUGUUUUCCUGUAUUUUGUGCUUUUCUGAAAACUUUAAAUACAUGAAUUUUUGGUAGAAAUGAAAAUCUUUCUGUUUUAUAUAUUUGUUUCUGUCCAUGGCACUCUGAUCUCUUUGAAUCUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-320.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -349.69

Frequency: 0.0000

Diversity: 314.12

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

....(((.....((.((((((((........((((....))))((((((((((((((((.......))))).((((....)))).(((((..((((......)))).)))))..((((((..(((......)))..)))))).....................(((((((((((((((((..((((((((....((((((......))))))..))))))))...........((((((((((((((......(((((((((((....(((......)))....((((..(((((....))))))))).........(((((((((((.......)))))))))))((((((((..(((((((((............(((.(((....)))..)))......(((((..(((.((((((((((...(((.......)))..)))....(((((((((((((..((((((..........)))))).(((((..((((.(((((((..(((....))).....))))))).))))..)))))........(((((((((((......(((((...(((((....)))))..)))))......)))).)))))))..))))))))))))).((((((((((.....)).))))))))..((((((((.........((((((((((((((........)))))...............((((((((((......)).)).))))))........((((...))))........)))))))))(((((((((.((....(((........)))....)))))))))))(((((((....(((((((..((((((....((((.(((.(((((((....(((((..((.((((((((...)))))))).))..)))))..)))))))))).)))).....(((((((((((((....))).((((((((..(((...(((((..(((((..((...))..)))))......((((.((......)).)))))))))..)))))))).)))((((((...........))))))))))))))))...(((((...))))).)))))).))))))).)))))))...............((((((((...(((....)))....)))))))).)))))))).((((((.(((((....))))).))))))........))))))).)))...))))).((((...)))).......(((.((((((((........)))))))).)))..)))))))))..))).)))))............((........))))))))).)))).....))))..)))))))))).(((((((.((((......))))))))))).........)))))))))))))))))............)))))).)).)))))))))))))....)))

Thermodynamic Ensemble Prediction

....,,({{,..{{,((((({{{,.,,,,..{(((,,,,.,||(((((,{(({{(((((.......))))),((((....)))).(((((..((((......)))).))))),,{(({{{..(((,,....|}}.,}}})}}|,|,...,{{{|...,,..,}|||{{((((((((((({..((((((((....((((((......))))))..)))))))).......,,,,{(((((((((((((,.....((((((((((({..,({{......||,{{{,((((,.(((((....)))))}}}}.........{((((((((((.......))))))))))}((((((((..(((((((((..........,,({{.{{,..,,)))..}},......(((((..(((.((((((((((...(((.......)))..}}}....(((((((((((((..((((((..........)))))).(((((..((((.(((((((..(((....))).....))))))).))))..)))))....,{{{(,((((,,,(({{{.,{(,(({,..,{{{,....})))),.))),},,.}}.,,))}),)))))..))))))))))))).((((((((((.....)),})))))))..((((((((.........((((((((((((((........))))).......,,....|,{{{{{{{,...,{{...},}..}}}}},........{{{{...})))........)))))))))(((((((((.((....(((........)))....)))))))))))(((((((..,.(((((((..((((((....((((.(((,(((((((.,..(((((..((.((((((((...)))))))).))..)))))..))))))}))).)))}...,.((((((((((,(({{{{|,..((({{{{{..,{,...{{{{{..{((((..{{...}}..))))}......{{{{.{{.,,.,,||.|||||,,,}..})))))))}})},{{{|{||,,,|.,...}}})),)))))))))),,.{{{{{...))))}.)))))).))))))).)))))))...............((((((((,..(((....)))..,.)))))))).)))))))).((((((.(((((....))))).))))))........))))))).)))...))))).,{{{...}}},.......(((.((((((((.,....,.)))))))).)))..)))))))))..))).)))))....,.,}},,.}}........)}))))))).))))...,,)}))..)))))))))|,{{{{{{{.{{{{......,}})}})}}}}}}}}|,,..}}))))))))))))}}}.....,},,,,}}})))},}).,}}}})))))),,,,,})}}