Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ANKRD36_0009700
Sequence Length
1110 nt
GC Content
0.3486
GUGUCAAAUGAUAGUCUCCAGAUAAAGAAAUGCUCUAUAAUGCCUCACCGCUGUGUUUUCCUGUAUUUUGUGCUUUUCUGAAAACUUUAAAUACAUGAAUUUUUGGUAGAAAUGAAAAUCUUUCUGUUUUAUAUAUUUGUUUCUGUCCAUGGCACUCUGAUCUCUUUGAAUCUGGUAAGGAUCUAGCCUUGUCUUAUUUAUACCAGCAAGCAGUGUUGUCACUUAAUGCUCUCAUUUUUCAUGUAAAUGACUGACAUUUUCCCAAGUCUUCACAAGUGAUUUCUGAAGAUGUUGCUGCAUUGAGCAGAGACUAUGUCAUUGUAAUUGCAGAAGUUUUAAAAUUAAAUAUGUUUAAUAAAAUUUUAGAGUUCUGUUUAUCUGGAACACAUAACACAUAAUGGUGUAAUGUGUAUUUAACCAUAAAUUAGCUUCACAAAAAGUUUGUGUACAUAAAAGUGUUUAUAUCCAAAGAAAUUCUUAUUUACUGCUCAGUAAUCUCUUGUGUAGAAGAAAAUAUGUAACAUAGUUUGCUGAGUCUUUGAUAAUAACCCUCAUGUAAAAUAAAGCCGUAAAGAUAAAAUGAGAGUUGAUACUCGAUGAAACUGAUGUGAGUGAAUAGAAACUAUGAAACUGUGUCUAUGGGAGAGAGGAGGACAUGGGGCUGCUGUUGUGAAGAAGGAAUUUGUACAAGUUAGUCCAUUUUCUGUAACUUUUAUAUUCUAAUAAAGGAAAACCAUAUCUUCAUAUUUAUAAAAAUGAGAUUUUACUGGUUUGAUCACAGGGGUGGUGAGAAUAAUGAAGAACAAAAUGUGGAAGGCAAAGAAUGAAGACCAGAUAGUGAGAUUAGAUUUAUCAACAAAAAAGAGUACAAGUGGGGUGGGAUGGUGUAAAUAAAGAUAGCAGCUGGCUAGGUGUUUGGGGGUUUCUGAUGAGGAAACCUGAGAACACUGACUUUAUGUGGACCUGGUAUAUUCGCACUCGAACAGAAUAUUGGAUUAUUGUUGCUUCAGAGAUUAAUGGAAGCAGAGGUGGAAGAAUGAGAGUAAACCACAGGGACUCAAUUCUUCUCUCUGUAGGGGUCACACAGCAACAAUAGGACAGGUGCUUCAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-257.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -280.83
Frequency: 0.0000
Diversity: 306.53
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.(((((.(((..((((.((((((...(((.((((..((((((((...(((((((((.(((((((.((..((....))..))...))))))).)).....(((((((((((((...................)))))))))).)))......(((((((((.....(((((((.....(((.(((((..(((.((((((.(((((.((((((....)))).(((((..((((((.......))))))..).))))..((((.((((((...((((((.((....)).))))))..(((((((((.(((...))).........((((((.((((((((((...(((.....))).)))))))))))))))).....((((((((((.((((......)))).))))))........((((((..((((((((((...)))))).......)))))))))).))))((((...)))).....)))))))))..((((((.((((((.....(((.((..((((((((.(((..((.((((((.((((.(((((........................))))).)))).)).)))).)).(((......)))...)))))))))))..))))).)))))).)))))).)))))).))))))))))).)))))).)))(((..((.((......)).))..))).....(((((((......)))))))....((((((((((((((((....((((.((......)).)))).(((((....)))))..)))).)))))))......))))))))))..)))......)))))))...)))))))))...............))))))).))))))))..)))).)))........((((.....))))(((((((..((((((((.....))))))))..)))))))..)))))).)))).))).))).)).))))..((..((....(((..(((((((((((.....((((.......((((((..((((((((..((((...((....)))))).))))))))))))))...))))....)))))))))))..)))...))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
{(((,..,,,.{{{..((((.((((((...(((.((((..((((((((...(((({,(((.(((((((.{{,.({,...,},,}}...))))))).))}....(((((((((((((.,.................)))))))))).))}.||...(((((((((.,,..(((((((..,,,{((.(((((,{(({.((((((.(((({,(({(({,{,((,{{{..,,(((((((,,.{{{{..,,))))..|{|||{{{(,,({(((,,,...,,.|||}|,.}}}))})))}{{{{,.,.,||||.{((...}}},,.{{....((((((.((((((((((...(({.....))}.)))))))))})))))),,,,.{(({((((((.((((......)))).)))))).,,,,...,|||||.,,,,,(({{{..,,}))))).{{{{....)))},,}},}}}},{{{..,||||,{{{,|||{{{||{{{.((,{({((({,,........,.,.}|||||,||}}}}}}|{.{({{{{.((((.(((((........................))))).)))).}},))}}.},.,{,...,},)))},}}}}},})}}}},.,},}},))))))})))}}}.))))))}},},))))))).)))))).,))||,..,{.||||||||}}}},..|||{.,..(((((((|{{,,.....,}}....((({{(((((((((((....{{{{.{{......}).)))|.(((((....))))).,)))),})))))}.....,))))))))))..))),,....))))))),,.)))))))))..............,})})))).))))))))..)))).)))........((((.....))))(((((((..((((((((.....))))))))..)))))))..)))))).)))).}}}.}||,||,}}}}..{{,.,|.,,.|{{..(((((((((((.,,..{{{{..|,...((((((..{(((((((..((((...((...,)})))).))))))))))))))...}}}}.,..))))))))))),,)),{|,,}}),,
Back