Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ANKRD36_0013000
Sequence Length
1914 nt
GC Content
0.4091
UGUCUUCUCAGAAACAACCAGCCUUGAAGGCUACAACUGACGAGGAAGACUCUGUUUCGAAUAUAGCCACAGAAAUAAAGGAUGGAGAAAAAUCUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAGCAACCAGCCUUGAAGGCUACAACUGACGAGGAAGAUUCUGUUUCGAAUAUAGCCACAGAAAUAAAGGAUGGAGAAAAAUCUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAACAACCAGCCUUGAAGGCUACAACUGAUGAGAAAGAUUCUGUUUCGAACAUAGCCACAGAAAUAAAGGAUGGAGAAAAAUCUGGGACAGUGUCUUCUCAGAAACCACCAGCCUUGACGGCUACAAGUGACGAGGAAGGUUCUGUUUUGAGUAUAGCCAGAGAAAACAAGGAUGGAGAAAAAUCUAGGACAGUGUCUUCUCGGAAAAAACCAGCCUUGAAGGCUACAAGUGAUGAGAAGGAUUCUUUUUCGAAUAUAACCAGAGGAAAAAAGGAUGGAGAAAUAUCUAGGAAAGUGUCUUCUCAGAAACCACCAACCUUGAAGGGUACAAGUGACGAGGAAGAUUCUGUUUUGGGUAUAGCCAGAGAAAACAAGGAUGGAGAAAAAUCUAGGACAGUGUCUUCUGAGAAACCACCAGGCUUGAAGGCUUCAAGUGCCGAGAAAGAUUCUGUUUUGAAUAUAGCCAGAGGAAAAAAGGAUGGAGAAAAAACUAAGAGAGUGUCUUCUCGGAAAAAACCAUCCUUGGAGGCCACAAGUGAUGAGAAGGAUUCUUUUUCGAAUAUAACCAGAGAAAAAAAGGAUGGAGAAAUAUCUAGGAAAGUGUCUUCUCAGAAACCACCAGCCUUGAAGGGUACAAGUGACGAGGAAGAUUCUGUUUUGGGUAUAGCCAGAGAAAACAAGGAUGGAGAAAAAUCUAGGACAGUGUCUUCUGAGAAACCACCAGGCUUGAAGGCUACAAGUGAUGAGAAAGAUUCUGUUUUGAAUAUAGCCAGAGGAAAAAAGGAUGGAGAAAAAACUAGGACAGUGUCUUCUCAGAAACCACCAACCUUGAAGGCUACAAGUGAUGAGGAAGAUUCUGUUUUGAGUAUAGCCAGAGAAAACAAGGAUGGAGAAAAAUCUAGGACAGUGUCUUCUGAGAAACCAUCAGGCUUGAAGGCUACAAGUGCCGAGAAAGAUUCUGUUUUGAAUAUAGCCAGAGGAAAAAAGUAUGGAGAAAAAACUAAGAGAGUGUCUUCUCGGAAAAAACCAGCCUUGAAGGCUACAAGUGACGAGAAAGAUUCUGUUUUGUAUAUAGCCAGAGAAAAAAAGGAUGGAGAAAAAUCUAGGACAGUGUCUUCUCCGAAACAACCAGCAUUGAAGGCUAUCUGUGACAAGGAAGAUUCUGUUCCGAAUAUGGCCACGGAAAAAAAGGAUGAACAAAUAUCUGGGACAGUGUCUUGUCAGAAACAACCAGCCUUGAAGGCUACAAGUGACAAGAAAGAUUCUGUUUCGAAUAUACCCACAGAAAUAAAGGAUGGACAACAAUCUGGAACAGUGUCUUCUCAGAAACAACCGGCCUGGAAGGCUACAAGUGUCAAGAAAGAUUCUGUUUCGAAUAUAGCCACAGAAAUAAAGGAUGGACAAAUACGUGGGACAGGUAUUUUGGAAUACACCUUUAAUGUAAUGUUCGAUCAAAUAGAAGAGAAAUUCACUUCCCUAAAUAAAUCAGCGGGGGUGUCUCCUCAGAAACAAUCGGCCCAGAAGGUUAUAUUUAAAAAGAAAGUUUCUCUUUUGAAUAUUGCCACAAGAAUAACAGGCGGUUGGAAAUCUGGAACAGAGUAUCCUGAGAAUCUGCCCACCUUGAAGGCUACAAUUGAAAAUAAAAAUUCUGUUCUGAAUACAGCCACCAAAAUGAAGGAUGUACAAACAUCCACACCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-502.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -537.82
Frequency: 0.0000
Diversity: 425.54
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((((..(........(((((...)))))........)..))))))).(((((((((...(((((.........((((.((((((....)))(((((((.(((((((((..((.....((((((.((((((........(..(((((((.(((((((((......(((.............))).......)).))))))).)))))))..)........)))))).))))))....))..)))).))))).))))))).........((((((......((.(((.......(((((((........)))))))..)))))((((((.(..(((....((..((.((((((..(((((((((......(((.............(((.........((((((((.(((((((((..(......((((((.((((((....((..(((((((.((.((((((...((((..(((.............)))....))))...)))))).)))))))))...))(((..((((....))))....))).(..(((((((.(((((((((((.(..(((.............)))..)...))))))))))).)))))))..)..........(((((.((.((((((((.(((((((.(((.((.(((((.......(((.............))).........))))).)).))))))))))........((((((.(((((.....((..(((((((.((.((((((...((((..(((.............)))....))))...)))))).)))))))))...)).....))))).))))))....((..(..(((((((.(((((((((((.(..(((.............(((.......((.(((((((.(((((((.....((....((.(((.((((......((..((((((.(((.((((((((.......(((.............))).........)))))))).)))))))))...))......)))).))).))....)).....))))))).)))))))))......))).............)))..)...))))))))))).)))))))..)..))......)))))))).)).))))).(((((((.(((.((.(((((.......(((.............))).........))))).)).))))))))))........)))))).)))))).....)..)))).))))).)))))))).......))).............))).......)).)))))))..)))))).))..))....)))..).)))))).))))))....(((((((.((((((((.((.((.(((.............((.....((((.((((((((..((((((((.........(((((...))))).....))))))))......)))))))).)))).....))...........))).))...)).)))))))).)))))))((((..((((((.((((...(((((....((...((((...))))....))....))))).......((((((.((..(((((((.((...)).))).)))).....))))))))..(((((((((((........((((((((((..(((...((((((((((..(.(((.((................)).))).)..)))).))))))..)))..)))))))))))))))))))))...........))))))))))....))))...((((............)))).)))))))...)))))...)))))).........((((.......)))).............((((((....))))))....)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.((..(((({,,({...((((((.((((...,,.......((((..((((((((((,......,.(((((,......{({(,,......}))}(((((((.(((((((((..((.....((((((.((((((........,..(((((((.((((((((,......(({{..........,.))).......),}))))))).))))))),.}........)))))).))))))....))..))))}}}))).))))))).....{{(((.{{{.......,{.((({{{.....,,,(((((.{((((|((({{{{.,.{((..(((((.,.{{{....|),.)))))..))).,,||||}}}}.....(({.............({{......,|,|(((((((.(((((((((..{......((((((.((((((....((..((((((({((.((((((,..,,,,..{{,...,......,,,|||.....}})}}.}}}}}}.}))))))))...}}{{{..((((....))))....||}.(..(((((((.(((((((((((.{..(((.............)))..,...))))))))))).)))))))..)...,,.....(((((.((.((((((((.(((((((((((.((.(((((.......(((.............))).........})))).)).))))))))))........((((((.(((((.....((..((((((((((.((((((,..,{,,..{{{.............}|}....,)))},.}))))).}))))))))...)).....))))).))))))....((..(..(((((((.(((((((((((.{..(((.............|||..,...}||}|||||||.|||||||..}..||....{{,(((,{(({,,.,,.{{..(((({{{(((.((((((((.......(((.............))).........)))))))).)))))))))...}}......}))).})).)}....||,.|,.|||||||.|||||||||......|||.............)))..,...}))}))))))).)))))))..,..,,,.,,..)))))))).)).))))}.(((((((((((.((.(((((.......(((.............))).........})))).)).))))))))))........)))))).)))))).....}..))))}}}))).)))))))}.......}}}.............|}},......))})))))).}))))))))))...}....,,,.,),.,))))})))))).,..(((((((.((((((({....{{.(({,.........,,.{,.....,{||,|(((((((.,((((((((.........(((((...))))).....)))))))}..,,,.)))))))}.,},,..,,...........||.|}}.,....,)}}))))))).))))))){{{{..((((({{((((...((((,...,{{{{.,{,....||||{{,{||,,{,|,||}.......((((((.((..(((((((.((...)).)))))))).....))))))))..||{||||||||.....,,|{{(((({{{,,,((({,,({{{{,,,{,,,,}|||}|||,|,.,..,,......}},))}.}..|||},||||||,,|||,.,}}))))}))))))))))}))}..........))))))))))....}}))))))))))).)))).......,}....)))).))))))....,,{{{........}}}})))))))....)).)}{.....,{..((((((....)))))).,....)
Back