Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ANKRD36_0020200

Sequence Length

1274 nt

GC Content

0.4027

UGUCUUCUCGGAAAAAACCAUCCUUGGAGGCCACAAGUGAUGAGAAGGAUUCUUUUUCGAAUAUAACCAGAGAAAAAAAGGAUGGAGAAAUAUCUAGGAAAGUGUCUUCUCAGAAACCACCAGCCUUGAAGGGUACAAGUGACGAGGAAGAUUCUGUUUUGGGUAUAGCCAGAGAAAACAAGGAUGGAGAAAAAUCUAGGACAGUGUCUUCUGAGAAACCACCAGGCUUGAAGGCUACAAGUGAUGAGAAAGAUUCUGUUUUGAAUAUAGCCAGAGGAAAAAAGGAUGGAGAAAAAACUAGGACAGUGUCUUCUCAGAAACCACCAACCUUGAAGGCUACAAGUGAUGAGGAAGAUUCUGUUUUGAGUAUAGCCAGAGAAAACAAGGAUGGAGAAAAAUCUAGGACAGUGUCUUCUGAGAAACCAUCAGGCUUGAAGGCUACAAGUGCCGAGAAAGAUUCUGUUUUGAAUAUAGCCAGAGGAAAAAAGUAUGGAGAAAAAACUAAGAGAGUGUCUUCUCGGAAAAAACCAGCCUUGAAGGCUACAAGUGACGAGAAAGAUUCUGUUUUGUAUAUAGCCAGAGAAAAAAAGGAUGGAGAAAAAUCUAGGACAGUGUCUUCUCCGAAACAACCAGCAUUGAAGGCUAUCUGUGACAAGGAAGAUUCUGUUCCGAAUAUGGCCACGGAAAAAAAGGAUGAACAAAUAUCUGGGACAGUGUCUUGUCAGAAACAACCAGCCUUGAAGGCUACAAGUGACAAGAAAGAUUCUGUUUCGAAUAUACCCACAGAAAUAAAGGAUGGACAACAAUCUGGAACAGUGUCUUCUCAGAAACAACCGGCCUGGAAGGCUACAAGUGUCAAGAAAGAUUCUGUUUCGAAUAUAGCCACAGAAAUAAAGGAUGGACAAAUACGUGGGACAGGUAUUUUGGAAUACACCUUUAAUGUAAUGUUCGAUCAAAUAGAAGAGAAAUUCACUUCCCUAAAUAAAUCAGCGGGGGUGUCUCCUCAGAAACAAUCGGCCCAGAAGGUUAUAUUUAAAAAGAAAGUUUCUCUUUUGAAUAUUGCCACAAGAAUAACAGGCGGUUGGAAAUCUGGAACAGAGUAUCCUGAGAAUCUGCCCACCUUGAAGGCUACAAUUGAAAAUAAAAAUUCUGUUCUGAAUACAGCCACCAAAAUGAAGGAUGUACAAACAUCCACACCAGCAGAACAAGACUUAGAAAUGGCAUCAGAGGGAGAGCAAAAGAGGCUUGAAGAAUAUGAAAAUAACCAGCCACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-308.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -334.72

Frequency: 0.0000

Diversity: 357.29

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.((((((((((........((((((.(((((.....((..(((((((.((.((((((...((((..(((.............)))....))))...)))))).)))))))))...)).....))))).))))))....((..(..(((((((.(((((((((((.(..(((.............(((.......((.(((((((.(((((((.....((....((.(((.((((......((..((((((.(((.((((((((.......(((.............))).........)))))))).)))))))))...))......)))).))).))....)).....))))))).)))))))))......))).............)))..)...))))))))))).)))))))..)..))......(((((.......))))).))))).))))).(((((((((((((((((.(((((..........(((((...(((.....)))...)))))((......))((((((.((.(((....((...(((((.(((.((((((((.......(((.............))).........)))))))).))))))))....))....))).)).)))))).(((.(((((.(((((((.((((((((.((.((.(((.............((.....((((.((((((((..((((((((.........(((((...))))).....))))))))......)))))))).)))).....))...........))).))...)).)))))))).)))))))...........(((((...))))).....))))))))....(((((((((((((((.((........((((((.((..(((((((.((...)).))).)))).....))))))))..)).))))))))...)))))))........(((((((((.........)).)))))))..)))))........((......)).)))))))))))))......((((.((((((((....(((((...........((.(((((....((.((((((((((........(((..(((.........)))....)))..........))))))))))))...))))).))........((((((....)))))).........................))))))))))))).))))......((((....................))))))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

.(((((((((..{......((((((.(((((.....((..((((((((((.((((((,..,{,,..{{{.............}|}....,)))},.}))))).}))))))))...)).....))))).)))))).....}..)))}}))))).(((((((((.,....}||}}........{{{({{......})))|{(((((.(((((((..,..{{....((.(((.((((......((..(((({{{(((.((((((((.......(((.............))).........)))))))).)))))))))...))......)))).))).))....))..,..))))))).)))))}||{{,{{{{((,,.........,,.{((({{....,,..{((((.((((((((((.....,.}}}|,{((.((((((.......((((({{{(((.((.(((((.......(((.............))).........})))).)).))))))))))........)))))).))|{|({,,,,,,{({(((,.,.|}}}|}}}}}},..,,}||...........,{{|}}......,)))}))))).))))))))))}...|....{{{.||..{||||,||({(..,..(((((((.((((((((.,,.{{.{({,.........,,.|,..,..,|||,|{{{{|{{.,((((((({.........(((((...))))).....)))))}}}.,,,|.||||||||.,,,,..,,...........||.|}}......,)}}))))))).))))))},,{,.,{{{{{{|((({..,||||....,||||.,,,..,,|{||{||{|{{{{{{.||,.......((((((.((..(((((((.((...)).)))))))).....)))))))).,}|.|}|}|||}...,,,}|||((((....((((((({(.,.....,.}}.)))))))}}}},}}.,,.....,}}.}},.,..))))|)))))}|,|||...||||}||||||||}}}}||||,.........}}||}|||||....||}||{|||||{|,}}}}.....,.{(((..{{{{,..}||{,...,|..........,}|||||||||....}}},}.,}....,,..((((((....)))))).......}}}}},..,..,,.....)))),))})))),,),)),.....((((.{.............,...,))))))))