Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ANKS1A_0000400
Sequence Length
413 nt
GC Content
0.3075
GUGUGAGCCACCUUACCCAGCCAAUAGUUUUUGAAUCUAAAAUUGAUCAAUCAGGAAGCAUGACAUCUACCCAAAGAAAUUUAUGUAGACAUUUAAAAAAUUCAUACAAAUGAUUCUUACACUGGGCUAUUUUAUUUUUAAAAAAUCAUUAAAAACAUUAGAAUUUAAACAAUAUUAAUUAAGGACUCAUUGUUUGCCCAAUAAAAAUAAUCGUCACUUCGUAAAUCACCCUAAUGAACGAUUUAGUCAUCAUAAUUUGAUUUAGUGUUUUCAGGACGACAUUGUUCAGUGUAUUUUUUUAUUGGUUUGGAAGGUAGUGAGUAAGAUAUUUCUAAGGGCAAAAAGGAAACAGUUUUGAAAAUUCUUAGCUAAUACUGAGUUGGCCAGGAUGGGUGAAACAGAGUUAAAGGAAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-65.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -73.78
Frequency: 0.0000
Diversity: 118.27
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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