Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ANKS1A_0004700

Sequence Length

1228 nt

GC Content

0.5122

ACUGAAAAGUGAACCACUGAUUUUCCUAAGGUAAAGUUUUAUGUAUCAGUAUUAUGAAGGAAAUUUUCUAACAAGGCAGUUAUGUGUUCUCAGUACUGGCAUUUCUCACUGUGGUCUAGGAUAUGAAAGAGGUGUUUAUGAUCUCUGCUACAGACAUCAAAAACCAUAGAGCAUGCUAAUUGAAUUGUGUAUGUAUGCACAGAGUUCUCCAUCUGUUCAGAGACGAAACCUUGACUUUAGUCUCUCAGGGGAGUUCCAUACAUUAUUUUUUUCAUUUCUAAGGGCUAAGAUGAGGGCAAACCAAAAAAUUAGAUACUUAAAAAAGAGAUCGCAAAAUAUUUAUUUUUUUCUCUUCUGCAGAGGGAACGUCCACCACCUCCAGCAAAGCCACCGCCCGAUGAAGAGGAAGAAGACCACAUAGAUAAGAAGUAUUUUCCCUUGACAGCUUCUGAGGUUCUGUCCAUGAGACCUAGGAUUCAUGGGAGUGCAGCCCGGGAAGAAGACGAACACCCUUAUGAACUGUUGUUAACAGCAGAGACAAAGAAAGUGGUGUUGGUGGAUGGAAAAACAAAAGACCACAGGCGGAGCAGCAGCAGCCGGAGCCAGGACUCUGCGGAGGGGCAGGACGGGCAGGUCCCAGAGCAGUUCUCAGGCCUCCUCCACGGCUCCUCCCCGGUGUGCGAGGUGGGGCAGGACCCUUUCCAGCUGCUCUGUACCGCUGGCCAGAGCCAUCCAGACGGGUCCCCCCAGCAGGGCGCCUGCCACAAGGCCAGCAUGCAGCUGGAGGAGACGGGUGUGCAUGCUCCUGGAGCCUCCCAGCCCAGUGCCCUGGACCAGAGCAAGAGAGUGGGCUACCUCACAGGCCUGCCCACCACCAACAGCCGCUCGCACCCUGAAACUUUGACUCACACAGCAUCUCCGCACCCUGGUGGUGCUGAGGAAGGAGACCGGAGUGGGGCCAGGAGCCGAGCGCCUCCCACUAGCAAACCCAAAGCUGAACUCAAACUCAGCCGCAGCUUGUCCAAGUCUGACUCUGAUCUCCUGACCUGCUCACCCACAGAGGACGCUACCAUGGGGAGUCGGAGUGAGUCCUUAUCCAACUGCAGCAUUGGGAAGAAAAGGCUAGAGAAGUCACCCUCCUUCGCCUCGGAGUGGGAUGAGAUUGAGAAAAUCAUGAGUUCUAUUGGAGAAGGGAUUGACUUUUCUCAGGAACGGCAGAAGAUCUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-396.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -417.95

Frequency: 0.0000

Diversity: 321.48

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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