Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ANKS1A_0008200
Sequence Length
371 nt
GC Content
0.5229
GCUGGAGUGCAGUGGCGCAGUCACAGCUCACUGCAGCCCUGACCCCCCAGGCUCAAGUGAUCCUCCCAUCUAAGUCUCCCAAAUAGCUGGAACUACAGGUACACACCACCCUACCUGGCUAAUAUAUAUAUAUUUUUUUUUUUAAGAGACUGGGUGUCAGUCCGGGUGUGGUGGCUCAUGCCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCCGAGGUGGGUGGAUCACCUGAGGUCAGGAGUUCAAGACCAGCCUGACCAACAAUGGCGAAACCCAGUCUCUGCUAAAAAUAGAAAAUUAGCUGGGUUUGGUGGCACAUGCCUGUAAUCCCAGCUACUUGGGAGGCUGAGGCAGGAGAAUCGCUUGAACCUGGGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-179.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -183.92
Frequency: 0.0006
Diversity: 48.10
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.((..(((((((((.........)).)))))))..)).).)(.((((((.(((((((((.((((..(((.((((((((((.(((((((...((((((((....(((((..(((((((((((.........(((((.(((((((((((((((((.((.(((((((((....(((....)))....((((...((((((((....))))))))...)))))))))).(((((((.(((...)))...)))))))......))))).)))))))))))..)))))).))))))))))))))))..)))))....))))))))...))))))).)))))))))).)))..)))).))))))))).)))))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.((..(((((((({,,.......)),)))))))..)).).)(.((((((.(((((((((.((((..(((.((((((((((.(((((((...((((((((....(((((..(((((((((((.........(((((.((((({(((((((((((.((.((((((((({{..,{{,}}})))}}..,((({,.{{((((((....))))))))|,,}},}))))},.(((((((.(({...}))...)))))))......))))}.)))))))))))..}))))).))))))))))))))))..)))))....)))))))).,.))))))).)))))))))).)))..)))).))))))))).)))))).)
Back