Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ANKS1A_0008500
Sequence Length
304 nt
GC Content
0.5132
AAAAACUCUGAGGCUAUAAGCCAGUUAACUCAAGGAGCUCUGGGUGUCCCCAAGUGUGCGGCACCAGGGCCAUGUGGACAGCAGCAUUGGGGCUGAAUCUGGCUCCAAAUGCACUUACCAUGUGACCUUGGCAAGUCACCAGGGCUUUAUGGGCCUCAGCUUCCUCAGUUGUAGGGUGGGAAUAACAACAGUCCCAAUUUUGUUUUGUUUGGUUUUGUUUUGUUUUUGAGGUGGAAUCUUACCCUGUCGCCCAGGCUAGAGUGCAGUGGCGUGAUCUCGGCUCACUGUAACCUCUGCCUCCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-97.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -105.11
Frequency: 0.0000
Diversity: 76.60
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.....)(((.((((...))))......((((.(((((((((((((.((.((....)).)))))(((((.(((((((..((..(((((((((((......)))))).))))).))..))))))).)))))........)))))))))).))))...(((((.....)))))..((((((((((((.(((((..((((...........))))..))))))))))))...(((((....)))))....)))))((((.(((((((((((((.........)).)))))))..))))))))..)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.....)(((.((((...}))).....,(({{,((((((((((({({({,{,....,}.}}},|(((((.(((((((..((..(((((((((((,....,)))))))}}))).))..))))))).))))))...},,.))}))))))}.}}))|}||||{{.,,,.))))).,((((((((((((.(((((..((((.........,.))))..))))))))))},.,.(({(,....}))))}}..}))))((((.(((((((((((((..,....,,)).)))))))..))))))))..)))
Back