Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ANKS1A_0009400
Sequence Length
380 nt
GC Content
0.6263
GACCUGCGGGACAUCGGCAUCAGCGACCCACAGCACCGGCGGAAGCUGCUCCAGGCGGCACGCUCCCUACCCAAGGUGAAGGCUCUGGGUUAUGACGGGAACAGCCCCCCUAGCGUGCCCUCCUGGCUGGACUCCCUGGGGCUGCAGGACUACGUCCAUUCCUUCUUGUCAAGUGGUUACAGCUCCAUUGACACCGUGAAGAACCUCUGGGAGCUAGAGCUCGUCAAUGUGAGUAGUCCCUGCGUGGCCCGGCCUGGACUCUCCAGAAGUCUGAGCUUCCCUUAGGGGCAGCCUGGCCCAGCGGAAGAUGCUGGGGGCUGGAGCGGACUGUGAGUGAGUUGGCCACCUGACCUGUCACCUCGCUGCUCCUCAUCACCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-145.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -153.70
Frequency: 0.0000
Diversity: 98.78
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.(.(((((....(((..((((....(((...(((..((((...(((((((((.(((((((((....(((((.(((....))).)))))......(((........))).))))))))..((.(((((...(((((((((..((.(((((.((((((..((.....((((.((((..((.(((((((((((.(((.((......)))))((((....))))))))))).)))).))..)))).))))..))..)))))......).)))))..))..))).))))))))))).))(((((((.....)))))))).))))))))).))))..)))...)))....)))).)))....))))).).))((........))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.(.(((((...,{((,.((((.,.,({(,..(((..((((...(((((((((.(((((((((,...(((((.(((....))).)))))...,..(((......,})},.))))))))..((.(((((...((((((((({{((((((((((.((((({.{{{{.((((({{(((........))))))))).,,.||}}...,|||||((((....))))...)))).)))))))}}})))}.|||}}||{{((({...})))),,||},,.))}.|||,})))))))))).))(((((((.....)))))))).))))))))).))))..))).,.}))....)))).}})}}..)}))).).))((........))
Back