Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_APP_0000500
Sequence Length
248 nt
GC Content
0.3911
AACUAGACCCCCGCCACAGCAGCCUCUGAAGUUGGACAGCAAAACCAUUGCUUCACUACCCAUCGGUGUCCAUUUAUAGAAUAAUGUGGGAAGAAACAAACCCGUUUUAUGAUUUACUCAUUAUCGCCUUUUGACAGCUGUGCUGUAACACAAGUAGAUGCCUGAACUUGAAUUAAUCCACACAUCAGUAAUGUAUUCUAUCUCUCUUUACAUUUUGGUCUCUAUACUACAUUAUUAAUGGGUUUUGU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-41.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -44.93
Frequency: 0.0017
Diversity: 49.05
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((((((..((....))....((((.((.((((((((((.....))))).....(((....)))))))).)).))))(((((((((...(((((......))))).(((((((.(((.((((..(((.(((((((...)))))..)).)))..))))..)))...)))))))........(((((.((((((.............))))))))))).......)))))))))....))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
....((((((..{(....}}....{(((.({.((((((((((.....))))).....(((....)))))))).}).)))|{{{((((((...(((((......))))}.(((((((.(((.((((..(((.(((((((...)))))..}}.)))..))))..)))...))))))}........{{(((.((((((.............))))))})))).......))))))))),...))))))...
Back