Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_APP_0005200
Sequence Length
452 nt
GC Content
0.5133
GUCUACCCUGAACUGCAGAUCACCAAUGUGGUAGAAGCCAACCAACCAGUGACCAUCCAGAACUGGUGCAAGCGGGGCCGCAAGCAGUGCAAGACCCAUCCCCACUUUGUGAUUCCCUACCGCUGCUUAGUUGGUGAGUUUGUAAGUGAUGCCCUUCUCGUUCCUGACAAGUGCAAAUUCUUACACCAGGAGAGGAUGGAUGUUUGCGAAACUCAUCUUCACUGGCACACCGUCGCCAAAGAGACAUGCAGUGAGAAGAGUACCAACUUGCAUGACUACGGCAUGUUGCUGCCCUGCGGAAUUGACAAGUUCCGAGGGGUAGAGUUUGUGUGUUGCCCACUGGCUGAAGAAAGUUAUGACACACCUCCGUGUGAUUUAUGAGCGCAUGAAUCAGUCUCUCUCCCUGCUCUACAACGUGCCUGCAGUGGCCGAGGAGAUUCAGGAUGAAGUUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-140.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -148.08
Frequency: 0.0000
Diversity: 130.16
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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