Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_APP_0005700
Sequence Length
288 nt
GC Content
0.5556
CAUUUCCAGGAGAAAGUGGAAUCUUUGGAACAGGAAGCAGCCAACGAGAGACAGCAGCUGGUGGAGACACACAUGGCCAGAGUGGAAGCCAUGCUCAAUGACCGCCGCCGCCUGGCCCUGGAGAACUACAUCACCGCUCUGCAGGCUGUUCCUCCUCGGCCUCGUCACGUGUUCAAUAUGCUAAAGAAGUAUGUCCGCGCAGAACAGAAGGACAGACAGCACACCCUAAAGCAUUUCGAGCAUGUGCGCAUGGUGGAUCCCAAGAAAGCCGCUCAGAUCCGGUCCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-84.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -90.72
Frequency: 0.0001
Diversity: 40.47
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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